Обитель Симонопетра, которая в XVII веке также имела идиоритмическое устройство, вернулась к киновиальному с 1801 года.

В результате изменилась роль устава. В общежитии видели уже не столько путь к достижению высоты богопознания, сколько практическое средство уберечься хотя бы от самых пагубных пороков. Главным в духовном делании теперь считалось послушание, безпрекословное подчинение, всвязи с чем особенно подчеркивается роль игумена.

Русский учёный-паломник архимандрит Антонин (Капустин) отмечал, что полное подчинение игумену возможно лишь там, где игумен есть достойный представитель единой воли, подобный святому Афанасию и другим. Однако же, где нет игуменства делом, игумена-отца, а есть только игумен именем, игумен-господин, там и в общежитии представляются камни преткновения, не меньшие, чем в своежитии.

В 1622 году в обители случился очередной пожар повредивший собрание монастырских летописей. Вскоре монастырь был восстановлен, но в 1626 году горел вновь, что привело к полнейшему упадку, и обитель надолго опустела.

В 1762 году сюда прибыл иеромонах Паисий Величковский, оказавший монастырю серьёзную помощь.

В конце XVIII века усилиями святителя Иоасафа Митиленского, епископа Белгородского, обитель вновь ожила. Известный церковный деятель выкупил для монастыря часть подворий и нетленную десницу Марии Магдалины.

Монастырь Симонопетра благодаря своей неповторимой архитектуре никогда не подвергался пиратским набегам. Трудным временем для него был лишь период борьбы Греции за независимость, когда турки наложили налог на монастырь, вследствие чего монахи оставили обитель. В 1821 году большинство монахов покинули Асимопетру (как стала называться обитель в период турецкого гнёта) как и многие другие монастыри.

Во время греческой революции монастырь был захвачен 60-ю оттоманскими солдатами, и оказался полностью заброшенным. Монахи не могли содержать оккупантов, и были вынуждены разрушить обитель. До этого они уже сожгли этажи, иконы, книги и разобрали свинцовую крышу храма. Однако через 4 года иноки вернулись и восстановили монастырь.

Многие древние реликвии были уничтожены пожаром 1891 года, в котором выгорело большинство зданий, собор, сгорела библиотека, были утрачены многие реликвии.

Огонь охватил фактически все помещения монастыря, уничтожил старые постройки и монастырские драгоценности. Насельники чудом смогли спастись и вынести некоторые святыни, многие из которых пострадали от другого большого пожара, случившегося в августе 1990 года.

В 1902 году обитель восстановил руководитель монастыря архимандрит Неофит. Он несколько раз ездил в Россию, где и собрал необходимые деньги не только на восстановление монастыря, но и на присоединение новых владений. Реставрация стала возможной лишь благодаря поддержке со стороны русских верующих, оказавших монастырю щедрую помощь.

Главный соборный храм монастыря, небольшой и основательный, ведёт свою историю с 1600 года. Но нынешнюю форму обрёл лишь в 1891 году после восстановительных работ, и до сих пор не расписан. От первоначального сооружения остались лишь элементы фундамента, чему виной несколько разрушительных пожаров, охвативших монастырь с XVI по XIX век.

Освящён собор в честь Рождества Спасителя, поэтому престольный праздник в монастыре 25 декабря/7 января – Рождество Христово. Также особо почитаем день памяти Преподобного Симона Мироточивого, основателя монастыря 28 декабря/10 января, и день памяти Святой равноапостольной Марии Магдалины 22 июля/4 августа.

Стоит обратить внимание на богато украшенный иконостас, старинные иконы и серебряные сосуды для святых даров.

Всего на территории монастыря помимо Соборного храма расположены 4 церкви: Марии Магдалины, святого Харалампия, святого Георгия Победоносца и святых Архангелов.

За пределами обители находятся восемь храмов: Успения Пресвятой Богородицы; Святителя Николая Чудотворца; святого Апостола Иоанна Богослова; святого великомученика Димитрия; святой мученицы Мины; преподобного Симона и другие.

Также монастырь имеет восемь часовен на своей территории и четыре вне его; четыре каливы, в которых в одиночестве живут монахи-отшельники, и семь келий в Карее, из которых келья Всех Святых является его представительством, а также другие здания в Карее и Дафни.

Кроме того, за пределами Афона монастырь располагает следующими подворьями: Вознесенским в Афинах, Святого Харлампия в Салониках, Преображенским в Ормилии на Халкидике, Святого Артемия и Святого Антипа на Сифносе и Богородицы Триги на Лемносе.

Среди особо почитаемых икон обители: «Успение Пресвятой Богородицы», образ Божьей Матери «Надежда отчаявшихся» и чудотворная икона «Элеовритисса» («Елеоточивая»), находящаяся рядом с помещением, где хранится оливковое масло.

С этим образом связано множество чудес.

В 1974 году был случай, когда монастырь посетила Своей милостью Пресвятая Богородица. Это чудо, случившееся через год после возвращения иноков в Симонопетру, было знамением, что Богородительница благословляет возрождение обители.

В канун великого праздника Введения во храм Пресвятой Богородицы монах, которого послали осмотреть огромные канистры перед заготовкой нового урожая, сказал, что две ёмкости, которые за день до этого были совершенно пустыми, полны масла. Причём иноки не обращались с мольбой к Божией Матери и не ведали, зачем Богородица послала им масло: они абсолютно в нём не нуждались, да и могли бы купить его.

В 1989 году чудо повторилось. А летом следующего года на Афоне был страшный пожар. Он начался на западном побережье, в Ивероне, и охватил почти весь полуостров.

Вокруг Симонопетры огонь бушевал со всех сторон, но чудесным образом сама обитель от пожара практически не пострадала. Снаружи весь монастырь был охвачен стеной огня, пожарные приказали монахам эвакуироваться, все бегали из стороны в сторону, пытаясь выносить какие-то вещи. И лишь архимандрит Эмилиан спокойно отправил всех по кельям – молиться.

Только когда пожар был полностью потушен, игумен поведал братии, что накануне ему являлась Божья Матерь и сказала, что огонь обойдёт монастырь стороной. Но старец никому ничего не открыл, дабы проверить силу веры у подопечных. Это чудо стало предзнаменованием расцвета монастыря.

Наиболее почитаемая реликвия монастыря – нетленная кисть десницы святой равноапостольной Марии Магдалины, которая, согласно преданию, коснулась Самого Христа и поклониться которой приходят множество паломников со всего света. Она более двух тысячелетий чудесно сохраняет тепло человеческого тела: это ощущает каждый, прикладывающийся к ней.

Также здесь хранятся: фрагмент Честного Древа Животворящего Креста Господня; стопа святого мученика Кирика; честная глава Святого Павла Исповедника, патриарха Константинопольского; глава святого Модеста, патриарха Иерусалимского; лик святого мученика Сергия, на котором виден шрам, оставшийся от удара во время его мучений; кровь святого Димитрия Солунского; правая рука святого Дионисия Ареопагита.

Частицы мощей Иоанна Крестителя; святого Харалампия; святой Феодоры Александрийской; святого Симеона Столпника; преподобного Дионисия Закинфского; святых безсребреников Космы и Дамиана; святого великомученика Пантелеимона; великомученицы Параскевы; преподобного пророка Наума и многих других святых.

В отдельных церквях покоятся: часть руки преподобномученицы Евдокии и часть руки великомученицы Варвары.

Гордость монастыря составляет обширная библиотека. Среди манускриптов на греческом, турецком и румынском языках огромное количество печатных книг, певческие манускрипты и уникальные старинные ноты церковных песнопений.

В сгоревшей библиотеке монастыря хранились 42 кодекса X–XIV веков, написанных на пергаменте, и 210 кодексов XIV–XIX веков, написанных на бумаге.

В сокровищнице Симонопетры хранятся иконы, печати, гравюры церковные одеяния и головные уборы, серебряные изделия, антиминсы, клейми, а в костнице – многочисленные черепа и кости монахов. Стоит отметить, что весь сохранившийся материал является поствизантийского происхождения.