Под Бородином генерал Николай Алексеевич Тучков расположил свой корпус около деревни Утица, прикрывая старую Смоленскую дорогу. Напор французов был велик. По приказанию Багратиона Тучков выделил из своего корпуса дивизию Коновницына, хотя имел право не выполнить приказа (его прямым начальником был Барклай-де-Толли). Это ослабило корпус, а противник усилил напор. Во время отражения атаки на высоту возле деревни Утица генерал Тучков находился впереди полка. Высоту отстояли, но командир корпуса был убит.

На помощь Багратиону Николай послал дивизию, в которой служил его брат Александр. Её бросили на отнятие Семёновских флешей у французов. На русские войска обрушился град картечи. Один за другим падали на землю окровавленные солдаты и офицеры. Русские дрогнули и остановились. Генерал Тучков поднял брошенное знамя и устремился на врага. За ним побежали другие. В этой атаке картечь поразила тридцатичетырёхлетнего генерала.

Узнав о гибели мужа, Маргарита Тучкова слегла. Но во второй половине октября отправилась на Бородинское поле и там, среди тысяч трупов, которые уже начали сжигать, искала тело мужа. Над полем стоял смрадный дым, и бродили среди груд тел женщина в чёрном и монах из Лужицкого монастыря. Она не нашла мужа. А вскоре потеряла и единственного сына.

По благословению митрополита Московского Филарета (Дроздова) вдова принимает монашество с именем Мария и становится настоятельницей основанного ею на поле битвы Спасо-Бородинского монастыря.

В армии и в народе ожидали, что после Бородинской битвы Кутузов даст второе сражение, чтобы защитить древнюю русскую столицу. Но Кутузову в ночь на 27 августа доложили, что русская армия потеряла более трети своего состава. Что же останется от неё после нового сражения? Новые части и вооружение не поступают, не хватает в войсках продовольствия.

1 сентября в подмосковной деревне Фили был созван Военный совет. За новое сражение высказалось большинство генералов — Д. С. Дохтуров, А. П. Ермолов, П. П. Коновницын, Л. Л. Беннигсен, П. С. Кайсаров, Ф. П. Уваров. За оставление Москвы без боя — Н. Н. Раевский, А. И. Остерман-Толстой, К. Ф. Толь и М. Б. Барклай-де-Толли, сказавший: «Главная цель заключается не в защите Москвы, а всего Отечества. Позиция невыгодна, и армия подвергнется несомненной опасности быть разбитой». Кутузов знал, каким будет его решение, но трудно было говорить об оставлении без боя Москвы… а это было единственно верное решение.

«С потерею Москвы не потеряна ещё Россия, — сказал фельдмаршал. — Первою обязанностью своею поставляю сберечь армию. Доколе будет существовать армия — до тех пор сохраним надежду благополучно завершить войну. Знаю, ответственность падёт на меня, но жертвую собою для спасения Отечества. Приказываю отступить».

Русские полки, растянувшиеся обозы с ранеными, уцелевшая артиллерия в ночь на 2 сентября двинулись через огромный город на восток. Генералу Милорадовичу удалось добиться обещания Мюрата дать русским войскам спокойно пройти через город.

Между тем жители первопрестольной оставались в полном неведении. Уже после Бородина в «Московских ведомостях» появилось объявление о представлении 30 августа в Большом театре спектакля «Наталья, боярская дочь», драмы в четырёх действиях, «после спектакля на оном же театре дан будет маскерад». Московский главнокомандующий граф Ф. В. Ростопчин в расклеенных по городу афишках уверял, что бояться нечего, что «француза до Москвы не допустят».

Однако город постепенно пустел. Лавки перестали торговать. Поутру 1 сентября улицы оказались заполнены каретами, колясками, дрожками и доверху гружёнными телегами, ехавшими в восточном направлении. Дворяне, мещане, купцы, ремесленники — уходили все. Москвичи, подобно жителям Вильно, Витебска, Смоленска, не хотели жить «под Наполеоном».

Александр I получил 7 сентября донесение Кутузова об оставлении Москвы без боя и был так поражён, что поседел в одну ночь. Впервые в жизни он взял в руки Евангелие, пытаясь из Священного Писания понять, за что Бог так карает его и его империю. В письме к шведскому принцу Бернадоту (ставшему из союзников противником Наполеона) Александр Павлович писал: «Случилось то, чего я боялся. Кутузов не сумел воспользоваться прекрасною победою 26 августа. Неприятель, потерпевший страшные потери, в шесть часов после обеда прекратил огонь и отступил за несколько вёрст, оставляя нам поле битвы. У Кутузова не достало смелости напасть на него в свою очередь».

А из Москвы на десятках телег уже вывезли сокровища Оружейной палаты и документы Государственного архива. Настоятели многих московских церквей и монастырей также собрали главные ценности и увезли в Нижний Новгород и Вологду.

Находившегося в Троице-Сергиевой Лавре митрополита Платона решили на всякий случай перевезти из Вифании в Махрищенский монастырь, хотя он уверял, что неприятель до Лавры не дойдёт. По его благословению вокруг Сергиева Посада 1 сентября совершили крестный ход при стечении множества народа.

В тот день дворянские кареты и мужицкие телеги всё тянулись и тянулись из Москвы. Опустели дворянские особняки, оставленные с богатой обстановкой, коллекциями картин и большими библиотеками. Купцы вывозили свои товары, кто что мог, ведь подвод не хватало. Бедные мещане, ремесленники, городская беднота бросали жалкие свои пожитки и с узелком уходили от врага. Из 280 тысяч осталось едва 6 тысяч человек. Огромный город опустел.