В качестве «превентивной меры» в ноябре 2004 года Генпрокуратура по решению суда арестовала 34,5 % акций «Сибнефти», принадлежащих «ЮКОСу». «Сибнефть» получала возможность отказаться от финансовых выплат. Так что на эти 3 млрд. «ЮКОС» также не может рассчитывать.
Для того чтобы акционеры и менеджеры «ЮКОСа» были более сговорчивыми и не упрямствовали в борьбе за спасение корпорации, вдобавок к налоговым претензиям «силовики» применили весьма действенную тактику уголовного преследования ключевых фигур в «ЮКОСе». Арестом Ходорковского все не ограничилось. Наоборот, по мере приближения финала «дела «ЮКОСа» давление на акционеров и менеджмент компании только росло.
Крупнейшие акционеры «ЮКОСа» стали спешно покидать Россию еще в конце 2003-го — начале 2004 года. К февралю в совете директоров НК «ЮКОС» не осталось ни одного крупного акционера компании. Михаил Ходорковский и Платон Лебедев к этому времени уже находились в СИЗО, а Леонид Невзлин, Владимир Дубов и Михаил Брудно к моменту предъявления им обвинений в январе 2004 года — за границей. После этого следствие объявило их в международный розыск. Еще один из совладельцев компании — Андрей Голубович — до осени 2004 года официально не был объявлен в розыск, но следственный комитет при МВД России в июне заявлял, что подготовил материалы для предъявления ему обвинения. Голубович «на всякий случай» также покинул страну.
В конце 2004 года поползли слухи о том, что страну покинули и пятеро последних крупных акционеров «ЮКОСа»: Сергей Муравленко (имеющий депутатскую неприкосновенность, но, видимо, понимающий, что она не является слишком надежным «щитом»), Виктор Иваненко, Виктор Казаков, Юрий Голубев и уже осужденный Василий Шахновский. Шахновский был признан виновным в уклонении от уплаты налогов в особо крупном размере путем предоставления заведомо ложных данных о доходах и расходах еще в феврале 2004 года. Суд назначил ему наказание в виде одного года лишения свободы, однако освободил от его исполнения «в связи с изменением обстановки». По всей видимости, пример Шахновского должен был стать сигналом для остальных акционеров. «Силовики» показали, что при отказе от сопротивления наказание может быть не столь суровым. Ведь Шахновский не стал спорить со следствием, признал факт сокрытия доходов и выплатил долги по налогам на сумму более 53 миллионов рублей, что в итоге было признано смягчающим обстоятельством. Акционерам продемонстрировали: нужно отказаться от своей собственности, и это позволит сохранить или вернуть личную свободу.
В поле зрения правоохранительных органов оказались и менеджеры «ЮКОСа» — причем как действующие, так и уже не работающие в концерне. Правда, многие менеджеры также в спешном порядке покинули Россию. Следствие попыталось «достать» их и за границей. 18 октября 2004 года в Лондоне начались слушания по делу об экстрадиции двух фигурантов «дела «ЮКОСа»: Натальи Чернышевой и Дмитрия Маруева. Бывшего заместителя главного бухгалтера нефтяной компании Дмитрия Маруева и бывшего начальника управления регионального бизнеса ЗАО «Роспром» Наталью Чернышеву заочно обвинили в хищении 76 млрд. руб.г которые должны были пойти в бюджет Волгоградской области. 17 ноября был арестован заместитель управделами «ЮКОС-Москва» Алексей Курцин, а также объявлен в международный розыск начальник юридического управления НК Дмитрий Голобов. Последний сразу улетел в Лондон и предпочел в Россию не возвращаться. За границу быстро отправились первый вице-президент «ЮКОСа» Анатолий Трушин и старший вице-президент компании Александр Темерко, которым предъявили обвинения в рамках дела о присвоении 22 млн. руб., предназначавшихся Фонду инвалидов Удмуртии. Именно по этому делу был арестован Алексей Курцин. А президент «ЮКОС РМ» Петр Золотарев, также входивший в правление опальной НК, срочно попросил об отставке.
Поначалу «силовое» давление не касалось иностранных менеджеров «ЮКОСа». Но осенью 2004 года ситуация изменилась. В ноябре Генпрокуратура направила повестку на допрос финансовому директору НК Брюсу Мизамору. Формально претензий к менеджеру не предъявлялось. Но тот факт, что Мизамор приступил к работе в «ЮКОСе» еще в тот период, когда нефтяная компания активно использовала механизмы оптимизации налоговой базы, должен был насторожить финансового директора. Он принимал непосредственное участие в управлении и распределении финансовых потоков НК. Таким образом, при определенных обстоятельствах и Брюс Мизамор мог бы испытать на себе всю тяжесть российского правосудия, Мизамор решил не испытывать судьбу: прилетев в Лондон на заседание правления компании, он отказался возвращаться в Россию. Председатель правления «ЮКОСа» американец Стивен Тиди также на всякий случай покинул Москву.
В условиях психологического давления акционеры приступили к последней попытке защитить свою собственность, назначив на 20 декабря в Лондоне собрание акционеров «ЮКОСа». Ранее на нем планировалось обсудить антикризисный план спасения компании. Но после новых арестов и вызовов на допрос было решено оставить в повестке дня лишь два вопроса: банкротство или ликвидация «ЮКОСа». В этом случае долги перед бюджетом должны погашаться далеко не в первую очередь. А ведь значительная часть кредитов «ЮКОСу» была выдана дружественными акционерам компании структурами Например, только MENATEP Group «ЮКОС» должен порядка 3,9 млрд. долларов — а именно MENATEP является основным акционером «ЮКОСа». (Структура владения «ЮКОСом» такова, что контрольный пакет акций принадлежит MENATEP Group, которая, в свою очередь, через ряд других фирм контролируется Ходорковским и его компаньонами).
Однако план спасения «ЮКОСа» вряд ли будет реализован. Ведь задень по собрания акционеров может пройти решающее событие в «деле «ЮКОСа»: аукцион по продаже его ключевого нефтедобывающего предприятия — «Юганскнефтегаза».
«Дочки «ЮКОСа» давно стали объектами налоговой «охоты». Например, в начале ноября Федеральная служба по налогам предъявила «Юганскнефтегазу» (он обеспечивает порядка 62 % добычи всего концерна) акт налоговой проверки за 2001 г. с претензиями на сумму 67,5 млрд. рублей. Также было предъявлено решение по проведенной дополнительной проверке за 2002 г. с требованием погасить задолженность по уплате налогов на сумму 29.6 млрд. рублей. Ауправлениепо налоговым преступлениям УВД Томской области возбудило уголовное дело в связи с уклонением компании «Томскнефть», входящей в НК «ЮКОС», от уплаты налогов на сумму 1,05 млрд. рублей. В целом сумма налоговых претензий к «Юганскнефтегазу» достигла к концу ноября 2004 года 4 млрд. долларов. Это при незакончившейся проверке за 2004 год, которая должна «добавить» еще 1 млрд. долларов к сумме долга. Кроме того, ЮНГ выступает гарантом по двум кредитам самого «ЮКОСа» на общую сумму в 2.6 млрд. долларов, непогашенный остаток по которым составляет 1,5 млрд. долларов. Так что к моменту продажи общий долг «Юганскнефтегаза», по всей видимости, составит чуть менее 8 млрд. долларов, что вполне сопоставимо с его начальной стоимостью в 8,6 млрд. долларов.
Вообще идея распродажи дочерних компаний «ЮКОСа» была выдвинута еще летом 2004 года. В июле входящая в Министерство юстиции служба судебных приставов оценила наиболее ценный актив «ЮКОСа» — ОАО «Юганскнефтегаз» — в смешные 1,7 млрд. долларов. Ведь «Юганскнефтегаз» добывает более 50 млн. тонн нефти в год. А запасы компании оцениваются в с тридцать пять миллиардов долларов. Двумя другими значимыми активами «ЮКОСа» являются «Томскнефть» и «Самаранефтегаз», но они представляют меньший интерес. Например, запасы «Томскнефти» оцениваются в 5,4 млрд. долларов, что примерно в 6,5 раза меньше ЮНГ.
Первоначальная цена ЮНГ вызвала большой скандал, что заставило пойти на процедуру независимой оценки. Правда, независимой она оказалась лишь относительно. Экспертизу стоимости «Юганскнефтегаза» было поручено сделать немецкому инвестиционному банку Dresdner Kleinworth Wasserstein, известному своими тесными связями с «силовым» «Газпромом». Но все же после оценки первоначальная стоимость компании поднялась до 246 млрд. 753 млн. 447 тыс. 303 рубля и 18 копеек, что составляет примерно 8,6 млрд. долларов). Затем Российский фонд федерального имущества объявил о проведении 19 декабря аукциона по продаже 76,79 % уставного капитала компании (100 % голосующих акций ЮНГ).