В середине 1927 г. прихожане Свято-Троицкого собора разделились на две части. Причиной раскола послужило отстранение митрополитом Платоном епископа Аполлинария, который отказался выйти из подчинения РПЦЗ. В день Вознесения Господня 2 мая 1927 г. открыли небольшой приход, который впоследствии получил название Свято-Богородицкого Скорбященского кафедрального собора. Он располагался на частной квартире и из церковного имущества имел только одну икону, крест и евангелие. Затем прихожане арендовали за 50 долларов небольшой дом по Сакраменто-стрит, где уже имелась церковная утварь, и пригласили священника. В первое время прихожан было всего около тридцати, но скоро их число стало быстро расти, и тогда дом переоборудовали под уютную домовую церковь, которая могла вмещать до трехсот человек.

Большим желанием прихожан было иметь собственное помещение, и оно осуществилось довольно быстро. Неожиданно представилась возможность купить по приемлемой цене старое здание, построенное из отборного леса на Фултон-стрит в 1880 г. для епископального прихода Святого Стефана. Всего за дом выплатили 3 тыс. долларов, а 12 тыс. погашали в течение трех лет. Освященный 5 октября 1930 г., собор стал кафедрой архиепископа Западно-Американского. Особенно много прихожан появилось в нем после приезда русских эмигрантов из Китая. Благодаря им собор пополнился русскими иконами из бывшей Алексеевской церкви.

В январе 1934 г. большой пожар частично уничтожил внутренние помещения. На страховку и пожертвования собор был переоборудован, куплена новая ризница, устроен нижний храм во имя Святителя Иннокентия Иркутского (открыт 10 июня 1934), сделаны новые обширные хора, просторный вход для удобства проведения крестных ходов, площадь храма увеличилась почти вдвое.

Большую роль в деятельности собора играл протопресвитер Василий Шапошников. Многие отмечали певучесть хора, которым заведовал выписанный из Харбина В. С. Лукша. При храме действовало и Общество ревнителей хорового пения, основанное 19 ноября 1939 г.

В дальнейшем был построен новый кафедральный Собор Пресвятой Богородицы «Всех скорбящих радости» (Holy Virgin Cathedral), или Свято-Скорбященский храм. Период строительства (25 июня 1961 — ноябрь 1964) был омрачен рядом конфликтов, которые привели к расколу прихода на две части. Сбор на постройку нового храма начался в 1954 г., но только 29 марта 1959 г. на экстренном общем собрании было принято решение о покупке земли под строительство храма. 26 августа 1960 г. городские власти утвердили проект, составленный архитектором О. Н. Иваницким, и выдали разрешение на строительство.

Храм заложили 25 июня 1961 г., а на следующий год владыка Антоний, назначенный управляющим епархией, признал, что средства собора тратятся с нарушениями. В это время приход раскололся на две враждебные части. Этот конфликт не был последним при строительстве храма. Архиепископ Иоанн (Максимович), пришедший на смену Антонию, отменил его заключение. После многомесячных дебатов и споров в мае 1963 г. строительство было возобновлено, и в ноябре 1964 г. состоялось торжественное освящение нового собора. При этом группа прихожан решила сохранить и прежнее здание. За это выступал и архиепископ Антоний, который предлагал выплатить часть суммы для окончания строительства нового храма. При соборе действовало Общество ревнителей православной иконы, основанное архиепископом Иоанном (Шанхайским) в 1965 г. Его основной целью являлось издание журнала «Наследие», посвященного православному искусству (иконописи, зодчеству, хоровому пению и т. д.), первый номер которого вышел в декабре 1968 г.

Свято-Скорбященский храм существует до сих пор, он находится в доме № 6210 по бульвару Гири (Geary Blvd). При нем деятельно работает Свято-Кирилло-Мефодиевская церковная гимназия, а также Академия имени Святителя Иоанна Шанхайского и Сан-Францисского чудотворца (Лицей Св. Иоанна = St. John Academy).

Старый Свято-Богородицкий Скорбященский собор сейчас имеет статус культурной ценности. Прихожанами там являются в основном пожилые русские, но приходят и американцы. Некоторые предпочли перейти в новый собор, в котором придерживаются григорианского календаря, а службы ведутся на староцерковном языке.

Основателями Казанского храма-памятника по убиенной Царской семье, или Церкви в честь Казанской иконы Божией Матери, или Церковь Казанской иконы Божией Матери = Church Of Our Lady Of Kazan (Church Memorial to Russian Royal New Martyrs), которая располагается в доме № 5717 по ул. Калифорния, стали в основном выходцы из Китая, которые отошли от прихода Свято-Скорбященского храма ввиду несогласия с деятельностью архиепископа Иоанна (Максимовича). Храм построили в 1949 г. по проекту архитектора В. С. Данилова и инженера В. В. Гранитова, которые провели все работы безвозмездно и посвятили 50-летию гибели семьи Романовых. Внешний облик храма изменялся трижды. Фрески для него выполнил архимандрит Киприян. Во внутреннем интерьере больше всего икон, связанных с представителями царской фамилии. Храм находится под юрисдикцией РЗПЦ. 13 июля 1968 г. его освятил Антоний, епископ Западно-Американский и Сан-Францисский.

Церковь Святителя Тихона Задонского (Church St. Tichon Of Zadonsk) по 15-й авеню, № 598, ведет свою историю с Шанхая, где в 1935 г. была основана одноименная церковь с сиротским приютом. После окончания Второй мировой войны церковь-приют перевели на Тубабао, а в январе 1951 г. воспитанники шанхайского приюта прибыли в Сан-Франциско. Для помощи приюту в США было основано Общество Святого Тихона Задонского, зарегистрированное в апреле 1951 г. Сирот разместили в купленном в рассрочку здании на углу ул. Бальбоа и 15-й авеню, названном Домом Святого Тихона Задонского. «Трудно приходится приюту, — писала «Русская жизнь» 4 декабря 1951 г., — дом требует выплаты, дети должны продолжить образование. Из воспитанников приюта только трое работают, один мальчик работает в конторе целый день, второй утрами возит газеты и одна девочка служит в семье няней и помощницей по хозяйству. Остальным детям надо учиться и главное изучить английский язык, чтобы стать на ноги».

Воспитателем в приюте работал Ф. Э. Бредов, председатель Объединения офицеров Лейб-гвардии Финляндского полка. Настоятелем церкви Святого Тихона Задонского являлся отец Владимир Востоков. В этой церкви жил и архиепископ Иоанн (в миру М. Б. Максимович), впоследствии канонизированный. Дом и поныне является резиденцией епископа.

Нечто вроде отделения Дома Святого Тихона Задонского — для тех, кто жил по соседству, — было открыто в 1959 г. в доме № 109 по 6-й авеню, где раньше располагалась Русская балетная школа. Затем этот приход стал Церковью Восшествия Христа. Сейчас здесь живет другой владыка. Как и Дом Тихона Задонского, сиротам помогал и Дом Владимирской иконы Божьей Матери.

Церковь Святого Сергия Радонежского (Church Of St. Sergius Of Radonezh) по 12-й авеню, № 1346, основана священником Церкви Казанской иконы Божией Матери И. Кляровичем, построившим ее своими руками в 1952 г. Сначала это был просто жилой дом священника, но в 1957 г. Клярович передал его прихожанам под церковь, и 22 сентября состоялось организационное собрание. Некоторое время священником прихода был отец Н. Польский, а старостой О. А. Дронникова.

Из других больших храмов в Сан-Франциско заслуживает внимания Свято-Николаевский кафедральный собор, или Кафедральный собор во имя Святого Николая чудотворца Марликийского Всероссийской патриаршей церкви (St. Nicholas Cathedral), входящий в юрисдикцию экзарха Московской патриархии, который в марте 1935 г. послал своего епископа в Сан-Франциско. Вначале храм располагался в доме № 443 по ул. Дивизадеро, пока 24 июля 1960 г. не освятили новое здание на 15-й улице (15th Street), № 2005. После того как была утверждена Американская автокефалия, прихожане предпочли остаться в ведении Московской патриархии.