28 августа была получена радиограмма коменданта береговой обороны главной базы И. А. Кустова: «Город и порт Палдиски нами оставлен, надо снять 50 саперов майора Степанова, оставленных на островах Большой и Малый Роге для подрыва батарей».

В Палдиски были направлены три катера МО под командованием капитана 2-го ранга М. Д. Полегаева. Катера пришли в Палдиски около 10 утра. Рейд пуст. На пирсе — брошенные четыре 45-мм пушки. Порт и город словно вымерли. Катера подошли к маленькому пирсу на восточном берегу острова Малый Роге. На пирсе — большая толпа эстонцев, главным образом женщин. Когда катера ошвартовались, подошла колонна саперов. Многие женщины просили взять их на катера. М. Д. Полегаев не решился, он же шел не в Кронштадт, а на Ханко.

Доставив саперов на полуостров, М. Д. Полегаев попросил разрешения сходить еще раз в Палдиски — за брошенными пушками. При подходе к порту сигнальщики катеров разглядели между зданиями на берегу пулеметы, а возле них немецких солдат. Пришлось повернуть обратно.

При эвакуации Таллина, 29 августа транспорт № 510 «Вахур» доставил на Ханко из Палдиски 46-й отдельный инженерный батальон численностью 1100 чел. Командир батальона капитан Н. Н. Мендрул. На переходе транспорт сопровождала канонерская лодка «Лайне» из ОВРа главной базы (Таллина).

На подходе к базе корабли были встречены катерами МО и истребителями. Вблизи самой базы (при следовании фарватером) корабли подверглись артобстрелу батарей противника с острова Эрэ. Катера МО поставили дымзавесы, и корабли без повреждений вошли в гавань. Строительный батальон был довооружен, и из его состава создана ударная группа как резерв командира базы. Канлодка «Лайне» и транспорт «Вахур» поступили в распоряжение командования Ханко.

До вступления Эстонии в состав Советского Союза «Лайне» входила в эстонский военный флот. По сути дела, это был хороший мореходный буксир, переоборудованный и вооруженный двумя 75-мм орудиями и несколькими пулеметами. Командовал ею старший лейтенант Н. Г. Антипин.

На Ханко канлодка была перевооружена. Старые трехдюймовки сняли. На баке установили 76-мм орудие, зенитное вооружение составили 45-мм орудия и пять пулеметов ДШК. На корме установили бомбосбрасыватель для глубинных бомб. В феврале 1941 г. «Лайне» была переименована в «Гангутец».

«Лайне» была единственным боевым кораблем в базе, который на протяжении всего последующего периода нес совместно с катерами МО дозорную и конвойную службу в базе.

«Лайне» и «Вахур» были последними кораблями, пришедшими на Ханко. Защитники базы начали экономить на всем, в том числе и на питании. 1 сентября норма выдачи мяса была сокращена до 33 граммов в день на человека. Масло отпускалось только госпиталям и донорам. Труднее всего было экономить бензин.

В начале сентября была предпринята попытка доставить на Ханко грузы на подводной лодке. 7 сентября 1941 г. на основании директивы Военного совета флота штаб бригады подводных лодок предложил командованию отдельного учебного дивизиона подводных лодок разработать план операции по доставке грузов осажденному гарнизону Ханко, используя при этом лодки IV серии (типа «Правда») — наиболее крупные лодки, находившиеся в строю КБФ. На следующий день начальник штаба дивизиона капитан 2-го ранга В. А. Касатонов представил четыре варианта приемки и перевозки грузов. В тот же день начальник штаба флота контр-адмирал Ю. А. Пантелеев утвердил документы на переход.

8 сентября подводная лодка П-1 капитан-лейтенанта И. А. Логинова перешла из Ораниенбаума в Кронштадт. Выгрузив торпеды, она приняла 154 ящика консервов, 200 100-мм и по 100 76- и 45-мм снарядов, до 2 т медикаментов и другие грузы, всего 19,6 т. 9 сентября подводная лодка вышла из Кронштадта в сопровождении двух тральщиков, а после Гогланда продолжала движение самостоятельно. Переход планировалось осуществлять со скоростью 18 узлов в надводном положении. В последний раз «Правду» видели в 21.30 9 сентября западнее острова Гогланд. С тех пор лодка на связь не выходила, и в точке рандеву с катерами и тральщиками ВМБ Ханко она не появилась ни в основное время встречи (6 часов утра 11 сентября), ни в резервное (2 часа ночи следующих суток). 17 сентября она была официально объявлена «пропавшей без вести при выполнении боевого задания». Вероятно, лодка подорвалась на мине и погибла.

Все южное побережье Финского залива до Лужской губы было занято противником. На Карельском перешейке финские войска 9 сентября вышли к государственной границе 1939 г.

Немцы готовились к решительному наступлению на Ленинград. С выходом немецких войск на южное побережье Финского залива они совместно с финнами приступили к созданию оборонительного рубежа на линии Юминда — Калбодагрунд с задачей всячески затруднить выход наших кораблей в западную часть Финского залива и Балтийское море и, в частности, отрезать Ханко, Моонзундские острова и Осмуссар (остававшиеся нашими форпостами на западе) от баз флота и Ленинграда.

В день оставления Таллина 28 августа командующий Северо-Западным направлением К. Е. Ворошилов и член военного совета А. А. Жданов обратились к начальнику Генерального штаба о необходимости эвакуации Моонзундских островов и Ханко. На этот раз Ставка согласилась, и в тот же день поздно вечером начальник Генерального штаба Б. Шапошников по поручению Ставки Верховного Главнокомандования направил директиву Военному Совету Северо-Западного направления об эвакуации войск с островов Сарема (Эзель), Хиума (Даго) и полуострова Ханко. Но в конце августа и сентябре командованию флота и фронта было не до островов и Ханко. Главной задачей становится отражение штурма Ленинграда. К тому же командование флота еще не отошло от шока после ужаса Таллинского перехода.

Отступление советских войск из Прибалтики, оставление ими Таллина и уход флота в Кронштадт резко изменили условия, в которых предстояло действовать гарнизону ВМБ Ханко.

Боевые задачи военно-морской базы Ханко оставались прежними: находясь в глубоком тылу, в окружении, ее гарнизон должен не только продолжать оборону северного фланга минно-артиллерийской позиции (которую пока никто не атаковал, не пытался прорываться, хотя теоретически такая попытка не исключалась), но и оборонять полуостров Ханко.

Кроме того, еще 10 июля командующий флотом, прибыв на Ханко, поставил ее командованию еще одну задачу. Финские войска, наступая на Карельском перешейке, создавали угрозу непосредственно Ленинграду. Задача базы — оттянуть на себя как можно больше войск противника, своей активностью заставить врага усилить противостоящую Ханко группировку.

Для выполнения такой задачи необходимо было перейти к активным действиям, прорвать оборонительную полосу на сухопутном фронте. А что дальше?.. Увеличится территория — возрастет протяженность фронта. Для его обороны нужны силы, новые силы. А на новые силы рассчитывать не приходилось.

Напрашивается сравнение Ханко с Севастополем. Черноморская база, находясь в глубоком тылу немецких войск, сковала на южном фланге фронта целую 11-ю армию, перемалывая ее в течение 250 дней (более 8 месяцев), задержав наступление противника на Кавказ.

Но оборона Севастополя была главной задачей Черноморского флота. Его корабли не только обеспечивали снабжение осажденного города, но своей артиллерией участвовали в его обороне. Основной задачей КБФ осенью — зимой 1941 г. была оборона Ленинграда. Корабли флота своей артиллерией сдерживали наступающие войска противника, подавляли батареи, обстреливающие город. Тысячи моряков в составе бригад морской пехоты ушли на сухопутный фронт.

Боевые корабли и транспорты постоянно доставляли в Севастополь пополнения войск, боеприпасы, продовольствие и другое снабжение. Порты Кавказа, через которые шло это снабжение, были связаны со всей страной.

Ленинград же сам с сентября находился в блокаде и испытывал острую нужду как в продовольствии, так и в боеприпасах, топливе и т. д. Конечно, проводить наступательные операции на перешейке и далее, вглубь территории Финляндии, в таких условиях было невозможно.