Однако в Тифлисе Иосиф Джугашвили задержался ненадолго. Он вернулся в Баку, где его ожидали неприятные известия. Еще в период его отсутствия неожиданно исчез заподозренный в темных махинациях за спиной организации наборщик типографии Александр Прусаков. А вскоре на имя его жены Козловской поступила телеграмма: «Я в Одессе... Собери побольше денег и приезжай по известному тебе адресу. Ваня».
По стечению обстоятельств эта телеграмма с интригующим посторонний взгляд текстом случайно попала в руки А. Хумаряна, и о ее содержании он рассказал Вано Стуруа. Когда же тот поинтересовался у Козловской, от кого телеграмма, то получил явно не откровенный ответ, что, мол, от матери, но уже на следующий день после этого разговора жена Прусакова тоже скрылась.
Эти события усилили циркуляцию слухов о грозящем провале типографии. Но о том, что возникшие опасения не были игрой воображения подпольщиков, Иосифу Джугашвили стало известно из более серьезного источника. О намерениях жандармов захватить типографию его предупредил сочувствующий революционерам работник ГЖУ. После этого типографский станок разобрали; детали и шрифт вывезли, укрыв в надежных местах.
Революционеры не подозревали, что об их действиях уже вскоре стало известно властям. 20 сентября Михаил донес в Бакинское охранное отделение, что «из дома № 66 по Бондарной улице типография (была) вывезена ночью 16 сентября и помещена в доме рядом; машина разобрана; часть ее и часть шрифта остались в доме № 64 по Бондарной улице, часть увезена в Армянскую слободку. Шрифт был там же, но вчера большая его часть в мешках, в которых он связан по отдельным литерам, помещена в квартире Петербуржца в д. 495 в Крепости, небольшая часть в Баилове».
Этот донос вскоре был продублирован другим агентом. Секретный сотрудник Фикус сообщал 27 сентября Губернскому жандармскому управлению: «... «Бочка» (Б. Мдивани) рассказал Роруа (3. Чодришвили), что к нему и «Кобе» явился неизвестный человек и передал, что жандармскому управлению типография известна и что управление собирается арестовать весь Бакинский комитет вместе с типографией, как только в ней будет преступлено к печатанию следующего номера «Пролетария». После этих слухов типографию постановили переместить и тогда же ее разобрали ночью и перенесли через крышу в соседний дом. Затем шрифт частями перенесли в разные места третьего дня. В пятницу. Разобранный станок на арбе из старой квартиры перевезли в Балаханы, где он теперь находится около промысла Шибаева. По окончании установки техники квартира ее станет известной».
Однако перемещение нелегальной типографии потребовало непредвиденных расходов. И, как вспоминал бывший подпольщик-рабочий И. Ванек, Иосиф Джугашвили вместе с Поликарпом (Буду) Мдивани пришли к нему на завод, поручив «срочно достать деньги, каковые в сумме 600 руб. мною были получены от либерального управляющего».
Обратим внимание, что кредитовавшим социал-демократов «либералом» был управляющий Биби-Эйбатского нефтяного общества Александр Манчо. Молдаванин, переселившийся после получения образования, в Баку, он в эти годы являлся также и заведующим нефтяной фирмой «Шибаев и К°», контрольный пакет акций которой принадлежал Сибирскому торговому банку и фирме «Братьев Нобель».
Уроженец Вены рабочий Иван Прокофьевич Ванек, длительное время являвшийся кассиром Бакинской организации РСДРП, позднее писал: «Мы часто брали у Манчо деньги для организации. В таких случаях ко мне приходил тов. Сталин», который «его хорошо знал».
Кто предупредил подпольщиков о грозившей опасности, досконально не установлено. Но существует предположение, что информацию Иосиф Джугашвили получил от работника, внедренного социал-демократами в охранное отделение. И возможно, что «неизвестным» был помощник начальника Бакинского губернского жандармского управления ротмистр Федор Зайцев, который уже с 1907 года — правда, не безвозмездно — стал «оказывать бакинским большевикам услуги, связанные с освобождением арестованных или смягчением им меры наказания». В любом случае очевидно, что сообщивший о намерении жандармского управления ликвидировать типографию «при приступлении к печатанию следующего № «Пролетария» имел доступ к секретам службы сыска.
Возглавив Бакинскую организацию, Иосиф Джугашвили не мог не сосредоточить свое внимание на мерах по разоблачению деятельности провокаторов, вербуемых властями в социал-демократической среде. В его непосредственное ведение вошли партийная «разведка и контрразведка».
И, человек аналитического мышления, прекрасно разбиравшийся в тонкостях и особенностях политической борьбы, он ясно осознавал, что действительно эффективной практика противодействия охранным службам станет лишь в том случае, если революционеры создадут собственную систему контрразведки и будут иметь своих людей в кабинетах карательных ведомств.
В его планах несложно разобраться, обратив внимание на агентурное донесение, полученное Тифлисским охранным отделением в ноябре 1909 года. «На Тифлисской общегородской конференции, — сообщал секретный сотрудник охранки, — присутствовал приехавший в Тифлис из Баку Коба (Сосо) — Иосиф Джугашвили, благодаря стараниям которого конференция решила принять меры к тому, чтобы партийные члены находились на службе в разных правительственных учреждениях и собирали бы нужные для партии сведения».
И осенью в сообщении агентуры указывалось, что «один партийный служащий» работает даже в канцелярии генерал-губернатора Тифлиса. Впрочем, то, что в охранке и полиции служили сотрудники, не только симпатизировавшие революционерам, но и помогавшие им, не является секретом для историков.
Действия, предпринимаемые революционерами для того, чтобы защитить свои ряды, вытекали из самой сути жизни. Провокаторство являлось ахиллесовой пятой подполья. От выявления внедренных в его среду агентов охранки зависела не только судьба отдельных участников, но и само существование организации. Поэтому, когда Джапаридзе получил сведения о связях с охранкой секретаря Союза нефтепромышленных рабочих Николая Леонтьева, вопрос был вынесен на заседание Бакинского комитета РСДРП. Обвинения в провокационной деятельности бывшему секретарю Союза предъявили Джапаридзе, Джугашвили и Якубов.
Конечно, для руководителей организации не все было ясно в хитросплетениях ходов служб полицейского сыска. Но далеко не безобидные события, взволновавшие бакинское подполье, требовали определенной оценки. И 28 сентября Михаил сообщил в охранное отделение: «В силу множества распространившихся слухов о провале техники Бакинский комитет решил выпустить прокламацию, отпечатав ее в частной типографии. Прокламация написана Кобой и содержит в себе изложение мер, принятых Бакинским) к(омитетом) для спасения техники и объявление о ряде провокаторов, обнаруженных в организации. Таковыми являются: бывшие наборщики в типографии Александр Прусаков, жена его Дуня Козловская, Фирсов Балаханский, Сашка Романинский и Николай Аеонтьев — бывший секретарь Союза нефтепромышленных рабочих».
Прокламация, в которой лица, перечисленные в доносе секретного сотрудника охранки, объявлялись провокаторами, появилась на следующий день. Она была отпечатана в типографии «Арамазд». В ней сообщалось, что «охранке удалось установить местонахождение подпольной типографии («техники») и она планировала захватить ее во время печатания «Бакинского пролетария». В прокламации указывалось: «Объявляется также провокатором бывший секретарь Союза нефтепромышленных рабочих Аеонтьев, недавно арестованный вместе с мирзоевцами и потом освобожденный. В Москве и за границей известен под кличкой Демьян».
Бывший секретарь Союза нефтепромышленных рабочих действительно был секретным сотрудником службы сыска, но не охранки, а ГЖУ. К агентурной работе Леонтьева привлек полковник Дынга, заступивший на должность начальника Тифлисского ГЖУ летом 1909 года. Историк Александр Островский установил, что, получив в управлении кличку Эстонец, первую информацию провокатор дал 27 сентября, а последнюю — 26 октября. Возобновив с 5 ноября передачу информации под кличкой Донской, Леонтьев продолжал передавать ее до 25 ноября 1910 г., пока не был убит.