Все участники «заговора военных» были реабилитированы. Убедившись, что обвинение Тухачевского и др. военачальников в тяжких государственных преступлениях необоснованны, а осуждение неправосудно, ГВП доложила своё заключение Генеральному прокурору СССР Р.А. Руденко. Вскоре от него последовало указание подготовить протест на постановление Специального судебного присутствия. 31 января 1957 г. Военная коллегия Верховного Суда СССР по заключению Генерального прокурора отменила приговор от 11 июня 1937 г., дело производством прекратила за отсутствием состава преступления, все проходившие по делу об участниках «антисоветской троцкистской военной организации» были полностью реабилитированы. 27 февраля 1957 г. Комитет партийного контроля при ЦК КПСС восстановил их в партии.

Последствия судилища и расправы над полководцами и последовавшие за ними массовые чистки командных кадров, отрицательно сказались на боеспособности Красной Армии. На несколько лет было приостановлено развитие мотомеханизированных (танковых) войск. Только в августе 1938 г. мехкорпуса были переформированы и переименованы в танковые, в связи с чем к концу 1938 г. в Красной армии уже имелось 4 танковых корпуса, 24 отдельные танковые бригады и 4 тяжёлые танковые бригады. Этим была создана хорошая основа для создания танковых объединений – танковых армий. Но в 1939 г. танковые корпуса были упразднены – исходя из опыта войны в Испании, где танки использовались в небольших масштабах из-за горной местности.

Продолжалось общее отставание Красной Армии в техническом и организационном отношении от западноевропейских армий и особенно от германского вермахта, что наглядно показали поход Красной Армии в Вост. Польшу и война с Финляндией 1939-1940 гг. Эти неудачные выступления побудили советское руководство снять Ворошилова с поста наркома обороны и заменить его на С.К. Тимошенко, который тоже являлся конником, приближённым к Сталину со времён Гражданской войны. Проводимые чистки и отставание Красной Армии инициировали планы агрессии фашистской Германии против Советского Союза. Сталин поручил Тимошенко провести реформы Красной Армии, а также привести стратегические планы в соответствие с новыми реалиями.

В своих мемуарах маршал М.В. Захаров вспоминал, что в довоенный период только с 1939 г. в нашей армии проводился поиск лучшей организационно-штатной структуры войсковых формирований, особенно в бронетанковых войсках. В соответствии с постановлением ГВС от 22 июля 1939 г. для пересмотра орг-штатной структуры создаётся специальная комиссия под председательством замнаркома обороны командарма 1-го ранга Г.И. Кулика. На заседании комиссии разгорелась жаркая дискуссия о судьбе танковых корпусов. Нарком Тимошенко предложил пересмотреть структуру танкового корпуса, включить в него вместо стрелково-пулемётной бригады сильную мотодивизию. Начальник Штаба Б.М. Шапошников и Г.И. Кулик настаивали на ликвидации танковых корпусов, как громоздких и трудноуправляемых. Последний договорился до того, что стал отрицать возможность использования танков для самостоятельных оперативных действий.

Е.А. Щаденко, С.М. Будённому и М.В. Захарову пришлось настойчиво доказывать и убеждать комиссию в том, что нельзя ликвидировать танковые корпуса, поскольку они играют большую роль при проведении глубоких операций и оперативном развитии прорыва. Начальник Автобронетанкового управления Д.Г. Павлов уклонился от изложения своей точки зрения и занял нейтральную позицию. В конечном счёте большинство членов комиссии пришли к твёрдому решению, что в танковых войсках надо иметь, с одной стороны, танковые бригады (4-х батальонного состава) 2-х типов: а) для самостоятельных действий – вооружённые танками БТ; б) для усиления стрелковых дивизий и корпусов – танковые бригады РГК; кроме них следовало сохранить 8 лёгких танковых полков для подготовки средних и младших командиров запаса; с другой стороны, сохранить в танковых войсках крупные танковые соединения в виде танковых корпусов. Одновременно рекомендовалось в наступлении при развитии прорыва направлять действия танкового корпуса в интересах пехоты и кавалерии, поддерживая с ними устойчивую связь и тесно взаимодействуя с артиллерией. Признавалось также, что танковый корпус иногда может действовать и самостоятельно, когда противник расстроен и не способен к обороне.

После ошеломляющей победы германского вермахта над Польшей в сентябре 1939г.,на заседании ГВС РККА 21.11.1939 в присутствии И.В. Сталина и В.М. Молотова было рассмотрено предложение комиссии по пересмотру орг-штатной структуры войсковых формирований, особенно в броне танковых войсках. Признано необходимым вместо 4 опытных корпусов создать в составе стрелковых войск 15 мотодивизий, а в танковых войсках иметь отдельные однотипные танковые бригады РГК. Моторизованная дивизия должна состоять из двух моторизованных стрелковых, танкового и артиллерийского полков и иметь на вооружении 475 пулемётов, 66 миномётов, 74 арторудия, 257 танков и 73 бронемашины.

Танковые корпуса, стрелково-пулемётные бригады и стрелково-пулемётные батальоны танковых частей подлежали расформированию. В танковых бригадах сокращались обеспечивающие подразделения. Много лет спустя, маршал М.В. Захаров, в связи с этой реорганизацией заметил, «что постановление ГВС осенью 1939 г. не имеет целью отвергнуть и не отвергало идею и наши взгляды на боевое применение крупных танковых и моторизованных соединений в современных операциях. Речь шла лишь о принятии более приемлемых оргформ подвижных войск с учётом боевого опыта начавшейся 2-й мировой войны, наличного парка боевых машин и уровня подготовки командных кадров. Начавшаяся советско-финская война отвлекла внимание на решение других задач. Весной 1940 г. (спустя полгода) проблема строительства бронетанковых войск вновь встала на очередь дня, и мехкорпуса были восстановлены, но уже на иных организационных началах. Однако факт попытки ликвидировать управления танковых корпусов нельзя признать оправданным, т.к. он не вызывался объективной необходимостью и противоречил прогрессивным взглядам советской военной теории на использование механизированных и бронетанковых войск».

К ним вернулись с учётом опыта войны на Западе. Перестройка в Красной армии коснулась всех родов войск, но особенно большие изменения произошли в бронетанковых войсках и авиации. Об этом вспоминает маршал Захаров: «В конце мая 1940 г. нарком обороны утвердил план формирования 8 новых мехкорпусов и 2-х отдельных танковых дивизий. В конце года в составе КиевОВО был сформирован ещё один мехкорпус. Таким образом, мехкорпуса были восстановлены, но в другой оргструктуре. В состав корпуса входили две танковые и одна мотодивизии. Танковая дивизия состояла из двух танковых, моторизованного и артиллерийского полков (375 танков). В мотодивизию входили танковый, два моторизованных и артиллерийский полки (275 танков). В целом мехкорпус должен был по штату иметь 1031 танк. Кроме того, командующим военных округов указывалось, что каждому корпусу целесообразно придавать авиадивизию в составе 2-х бомбардировочных, штурмового и истребительного полков. Эта рекомендация не применялась. Ранее существовавшие танковые корпуса до их расформирования состояли из 2-х танковых и одной стрелково-пулемётной бригад (560 лёгких и средних танков). В состав новых мехкорпусов включались 3 дивизии и значительное число корпусных частей; они действительно стали громоздкими и тяжеловесными. Управление таким соединением значительно усложнялось, так как не было хороших средств связи, маневренных средств тылового и боевого обеспечения. Требовалось длительное время и для подготовки командных кадров.

Комментируя после войны засекреченные материалы Совещания высшего комсостава РККА от декабря 1940 г., Г.К.Жуков писал: «Всеобщее внимание привлёк доклад командующего ЗапОВО генерал-полковника Павлова Д.Г. «Об использовании механизированных соединений в современной наступательной операции и ввод механизированного корпуса в прорыв». Дело в том, что до 1940 г. у нашего военно-политического руководства не было твёрдого понимания значения способов и форм применения крупных танковых и мехсоединений типа корпус—армия в современной войне. В своём хорошо аргументированном выступлении Павлов умело показал большую подвижность (маневренность) и пробивную силу танкового и мехкорпусов, а также их меньшую, чем других родов войск, уязвимость от огня артиллерии и авиации.