Инструкция чрезвычайным пограничным комиссиям предусматривала основные мероприятия по обеспечению государственной безопасности на временной западной границе Советской страны.

Для разработки планомерной и стройной системы борьбы с контрреволюцией, спекуляцией и контрабандой в пограничной полосе ВЧК по указанию ЦК партии созвала 1 сентября 1918 г. в Москве конференцию представителей погранчека. К этому времени на западной границе существовало уже 34 погранчека и 60 комиссаров чрезвычайных комиссий над таможенными пропускными пунктами.

Строительство пограничных ЧК проходило в ожесточенной борьбе с левыми эсерами, проникшими в аппарат погранохраны Таможенного ведомства и провоцировавшими столкновения с немецкими войсками. В результате мер, принятых ВЧК, левые эсеры были изгнаны из таможенных учреждений, что значительно способствовало улучшению не только экономической, но и политической охраны границ.

Конференция признала необходимость придать ПЧК военную силу в виде вооруженных отрядов из состава корпуса ВЧК, уточнить границы округов, участков и пунктов пограничной полосы, ввести строгую централизацию в управлении пограничными чрезвычайными комиссиями[155].

Организационное укрепление пограничных чрезвычайных комиссий имело серьезное значение в борьбе с контрреволюцией в западных и северо-западных районах страны, особенное агентурой кайзеровской Германии.

Немецкая разведка отпускала значительные суммы на создание заговорщических групп, организацию шпионажа в Красной Армии, на формирование белогвардейских отрядов. Через своих дипломатических представителей немцы регулярно провозили в Советскую Россию оружие, которое передавали в руки заговорщиков. Петроградской чрезвычайной комиссии удалось однажды задержать девять ящиков с маузерами, привезенными в Петроград под видом «политической переписки»[156].

В оккупированных районах Воронежской губернии, граничащих с Украиной и Доном, немцы формировали так называемую «Южную армию», а в Псковском районе— «Северную армию». Обе эти армии должны были заменить германские войска в оккупированных областях и помешать восстановлению Советской власти в этих районах.

В конце сентября 1918 г. чрезвычайная комиссия Западной области получила сведения о существовании в Смоленске контрреволюционной организации, занимавшейся вербовкой и отправкой белогвардейцев в «Южную армию». После тщательных розысков чекистам удалось напасть на след преступной организации и арестовать главаря ее — генерала Дормана и многих агентов, разъезжавших с целью вербовки по Смоленской и Витебской губерниям.

По материалам, изъятым во время обысков, было установлено, что в оккупированном Киеве немцы создали союз под названием «Наша родина», от которого тянулись нити во все западные области. Организация имела этапные пункты, через которые завербованные белогвардейцы направились в главные пункты явки. Многочисленные курьеры «Южной армии» разъезжали по России и занимались вербовкой офицеров. Руководство формированием белогвардейских отрядов на советской территории исходило от германской миссии в Москве, во главе которой стоял майор Шуберт.

Сообщая о раскрытии Смоленского отделения союза «Наша родина», ВЧК писала, что теперь «становится ясным, с какой целью буржуазия стремилась увезти свои деньги и драгоценности и почему бывшие офицеры пробираются на Украину с подложными документами. Наши пограничные пропускные пункты, — подчеркивала ВЧК, — должны усилить надзор и бдительность и решительными мерами предотвратить увеличение кадров активных врагов трудового народа»[157].

Подрывную работу, аналогичную той, какую проводил союз «Наша родина», развернула и организация «Великая единая Россия» (ВЕР).

Несмотря на словесное отрицание соглашений с германскими империалистами, организаторы ВЕР находились в теснейшей связи с германской разведкой. При поддержке майора Шуберта они создали широкую сеть «трудовых артелей» для сбора шпионских сведений и вербовки белогвардейцев в «Северную армию». Как и «Южная», «Северная армия» целиком ориентировалась на немцев. Германское командование обещало выдать белогвардейцам 150 миллионов марок на формирование, а также обеспечить их оружием и снаряжением[158].

Благодаря бдительности ВЧК и пограничных чрезвычайных комиссий вербовка белогвардейцев как в «Южную», так и в «Северную армию» на неоккупированной территории была пресечена, хотя в районах, захваченных немцами, германскому командованию удалось все же сформировать несколько полков, которые впоследствии влились в армию Юденича.

На средства немецкой разведки существовала в Петрограде крупная монархическая организация во главе с известным черносотенцем Марковым И. В тесной связи с этой организацией находилась группа контрреволюционного гвардейского офицерства и группа немецких шпионов, пробравшаяся в Селигеро-Волжскую флотилию. Первая группа развернула свою шпионско-подрывную работу в частях 1-го Советского корпуса Красной Армии. Немецкий шпион фон Розенберг, обманным путем пробравшийся на пост начальника оперативного отдела штаба корпуса, подготовлял измену с целью захвата Петрограда. Вторая группа, руководимая офицером Билибиным, должна была оказать поддержку заговорщикам со стороны Ладожского озера силами Селигеро-Волжской флотилии.

Начальник флотилии Билибин вначале служил англичанам. По заданию английской разведки он должен был способствовать судами флотилии наступлению англичан с севера.

Однако надежды Билибина на быстрое продвижение англо-французов к Вологде и Петрозаводску не оправдались. Красная Армия задержала наступление интервентов на Севере. Тогда английский шпион предложил свои услуги немцам, полагая, что они быстрее продвинутся к Петрограду. С помощью начальника базы флотилии Лукина Билибин установил связь с организацией Маркова и стал выполнять задания немецкой разведки.

Осенью 1918 г. ВЧК раскрыла и ликвидировала этот  обширный заговор. Планы немецкой разведки полностью провалились.

В сентябре — ноябре 1918 г. ВЧК разоблачила и ликвидировала контрреволюционные заговоры в Рязани, Костроме, Вышнем Волочке, Велиже, Борисоглебске и ряде других городов.

В центре Советской республики — в Москве контрреволюционеры имели особенно много тайных организаций. Это и не удивительно, ибо в столице скопилось несколько десятков тысяч кадровых офицеров и офицеров военного времени. Здесь находился центральный государственный аппарат Советской власти, против которого заговорщики в первую очередь направляли свои удары.

ВЧК раскрыла в Москве «Сокольническую военную организацию», «Орден романовцев», «Объединенную офицерскую организацию» и т. д. Все эти контрреволюционные группы имели широко разветвленный шпионский аппарат. У них были свои агенты в таких советских учреждениях, как Центральное управление по делам пленных и беженцев (Центропленбеж), Красный крест, ВСНХ. Подобная система давала белогвардейским агентам возможность помимо маскировки быть в курсе основных мероприятий важных советских учреждений и собирать обширный шпионский материал.

ВЧК решительно рвала шпионскую паутину. Уже в первые месяцы осуществления политики красного террора часть контрреволюционных организаций вынуждена была временно прекратить свою деятельность. Некоторые организации распались в силу того, что из их рядов были вырваны и уничтожены главные заправилы. Многие белогвардейцы во избежание разоблачения постарались скрыться из центральных городов.

Деятельность чрезвычайных комиссий в первый период гражданской войны представляла собой непрерывную, напряженную борьбу. Чекисты боролись с врагом и учились приемам борьбы, не зная ни минуты отдыха.

Враги Советской власти вопили на всех перекрестках об «ужасах» ЧК. Антисоветские партии требовали ликвидации «чрезвычаек».