В то время Хагане приходилось бороться не только с внешними врагами, но и с внутренней еврейской оппозицией, в частности, с двумя правыми группами, которые считали, что процесс борьбы с англичанами за создание независимого Еврейского государства должен быть ускорен. Одна из этих групп, более крупная – «Иргун» («Организация» – в переводе с иврита) откололась от Хаганы в 30-е годы. В 38-м, когда британские власти повесили одного из активистов Иргуна за участие в террористическом акте, группа начала активно действовать против англичан. Однако через некоторое время от «Иргуна» откололась группа ультраправых активистов под руководством Яира Штерна – «ЛЕХИ», которая считала деятельность Иргуна недостаточно жесткой. (Более подробно об этой группе будет рассказано в очерке об Ицхаке Шамире в главе «Они сражались за родину».) С этими группами и предстояло бороться еврейскому дивизиону Шай. Когда Харел в него вошел, он состоял из начальника, технической секретарши и самого Харела.
Харел добился успеха не сразу. Однако когда через два года он возглавил Еврейский дивизион, накопил уже достаточное количество информации и материала об организациях, противопоставляющих себя Хагане, и ее членах. Тогда никто не представлял, что основное подразделение Шай, занятое делами, связанными с англичанами, полностью утратит свое значение после создания государства, так как англичане вообще покинули Палестину, а вот ранее самое непрестижное его подразделение – Еврейский дивизион, переименованный Бен-Гурионом в 1947 г. в Управление внутренних дел, станет единственным разведывательным подразделением, отвечающим требованиям текущего момента и политики нового государства. Когда государство было создано, руководитель «Иргуна» Менахем Бегин вышел из подполья и заявил, что отряды Иргуна вольются в состав вновь создаваемой Армии Обороны Израиля. Однако на деле все обстояло совсем не гладко. 11 июня 1948 г. руководство Израиля подписало Соглашение с ООН, по которому в страну «не будут ввозиться военные материалы». И именно в этот день из Порт де Бу близ Марселя отчалило судно «Альталена», которое Иргун купил у морского ведомства США. Оно было до отказа загружено оружием и боеприпасами и направлялось в Израиль. Кроме того, на борту находилось 800 добровольцев из Америки и Европы, готовых сражаться с арабами в рядах «Иргуна». Поначалу Бен-Гурион и Бегин договорились, что оружие поступит в различные группы вновь создаваемой армии. Однако Бегин, опасаясь предательства со стороны временного израильского правительства при заключении мирного соглашения с арабскими странами, выступившими войной против нового государства в день его провозглашения, изменил свое решение и послал в Кфар-Виткин, к берегам которого должна была причалить «Альталена», группу дезертировавших из армии бывших членов «Иргуна» с целью разгрузки корабля. Бен-Гурион не был согласен с таким поворотом дела. В результате «Альталена» была взята штурмом силами Хаганы, а затем потоплена.
Исер Харел получил приказ о расформировании «Иргуна». Агенты Харела гонялись за членами «Иргуна» по всей стране, разыскивали бывших его офицеров и тайники с оружием. Харел выполнял задание, как всегда, тщательно и аккуратно. Он лично беседовал с пойманными, убеждал их прекратить сопротивление и войти в состав новой регулярной армии. Кое-кто отказывался, большинство соглашалось. С Иргуном было покончено.
Но оставалась «ЛЕХИ». Ситуация с ней обострилась, когда 17 сентября 1948 г. близ Иерусалима был убит граф Бернардот, шведский дипломат, назначенный ООН посредником для разрешения противоречий между арабами и евреями. Харел представил Бен-Гуриону доказательства, что это убийство – дело рук «ЛЕХИ». Он предложил арестовать всех членов группы, благо у него имелись почти все адреса их местонахожения и мест хранения оружия и боеприпасов. Бен-Гурион дал добро, и той же ночью Харел начал операцию. Через 13 дней после убийства Бернардота организация «ЛЕХИ» перестала существовать. Интересно, что пройдет несколько лет и Харел в качестве руководителя Мосада убедит Бен-Гуриона в целесообразности привлечения к работе в Мосаде бывших членов «ЛЕХИ». Одним из первых был приглашен последний руководитель организации Ицхак Езерницкиий, впоследствии – будущий премьер-министр Израиля Ицхак Шамир. Пожалуй, с разгрома «ЛЕХИ» началось многолетнее непрерывное восхождение Исера Харела на вершины его служебной карьеры. Он отличился в борьбе с правой оппозицией. Через некоторое время он так же себя проявит и в борьбе с левой оппозицией. Ибо он обеспечил себе самое главное на тот момент: поддержку и расположение Бен-Гуриона.
30 июня 1948 г. в Израиле были созданы первые четыре организации разведывательного сообщества нового государства. Среди них – служба внутренней безопасности ШАБАК. Исер Харел был назначен ее руководителем.
Первой операцией Харела на новом посту было взятие под контроль деятельности коммунистов, которые в большом количестве проникали тогда в партию МАПАМ, главную силу, оппозиционнную партии Бен-Гуриона МАПАЙ. Задача была довольно сложной, так как в организации Харела ШАБАК работало много представителей партии МАПАМ. Сознавая пикантность ситуации, Харел создал новую, параллельную ШАБАКу специальную секретную организацию, единственной задачей которой было следить за деятельностью членов МАПАМ. Об этом секрете знали два-три человека в ШАБАКе и столько же в правительстве. Но вскоре секрет перестал быть секретом, разразился скандал. Харел как бы ушел в тень. «Как бы», потому что не в его принципах было отступать от поставленной задачи, особенно если эта задача была поставлена Бен-Гурионом. В ход шли разнообразные приемы: физическая слежка, установка тайных микрофонов (один из таких микрофонов был вмонтирован в рабочий стол руководителя МАПАМ) и многое другое. В конце концов, представители ультралевого крыла партии МАПАМ покинули ее и примкнули к коммунистам. Но Харел извлек из борьбы против правых и левых свои уроки, заявив Бен-Гуриону, что если ШАБАК и впредь будет принимать участие в политических играх в Израиле, израильская общественность откажет этой организации в своем доверии. ШАБАК должен быть выше этого и находиться вне подозрений. Тогда урок был преподан, и Бен-Гурион согласился с доводами Харела. Увы, в дальнейшей истории Израиля ШАБАКу приходилось неоднократно принимать участие в подобных играх. Например, до сих пор не ясны обстоятельства убийства премьер-министра Ицхака Рабина.
Как обычно, Харел прекрасно справлялся со своими обязанностями руководителя ШАБАКа и в какой-то момент он даже почувствовал себя способным на большее. Между тем дела в Мосаде шли не блестяще. Его руководитель Шилоах способствовал роспуску Иститута Алия Бет, передав его функции Мосаду, и политического отдела министерства иностранных дел, который ранее фактически выполнял функции разведывательного органа, и, таким образом, сосредоточил огромную власть в своих руках. Но, как оказалось, не смог ею достаточным образом распорядиться. К тому же из-за травм головы, полученных в результате автомобильной катастрофы, резко ухудшилось его здоровье. А сзади уже наступал амбициозный Исер Харел. 20 сентября 1952 г. первый директор Мосада Реувен Шилоах подал в отставку. Вместо себя он рекомендовал трех человек, в том числе Харела. Бен-Гурион выбрал именно его. Уже через час он позвонил Исеру Харелу: «Я хочу поручить тебе руководство Мосадом». Харел тут же согласился.
Итак, с 21 сентября 1952 г. в кабинете начальника Мосада воцарился новый начальник Исер Харел. Пожалуй, в этом случае слово «воцарился» отражает буквальный смысл того, что произошло в этом подразделении разведывательного содружества Израиля. На протяжении последующих десяти лет Харел действительно чувствовал себя царем – единоличным правителем, диктатором и справедливым отцом. Ему было всего 40 лет, но выглядел он на все 50. В своей будничной одежде он походил на рядового, несколько инфантильного банковского клерка. Однако этот вид был обманчив: он обладал поистине неутомимой юношеской энергией. Возможно, что на его вид влиял маленький рост – всего 155 см.