В горах большие площади заняты ягодниками — брусникой, черникой, жимолостью. Там произрастают два вида малины, два вида красной смородины. В лесах предгорий произрастает много сибирских цветов (огоньки, ирисы, лилии, марьины коренья, башмачки и др.).

Южнотаежная сибирская фауна имеет типично таежный характер. Здесь в реках Мана и Базилиха и их притоках обитает 22 вида рыб: тугун, чебак, елец, шиповка, таймень, язь, окунь, щука, налим, карась. А вот стерлядь почти исчезла, редкими стали таймень, ленок, сиг, хариус.

На заповедной территории встречается 130 видов птиц. Общее количество видов и подвидов птиц заповедника составляет 86 процентов всех птиц Восточных Саян.

Многочисленны рябчик, глухарь, которые в первые годы существования Столбов встречались в единичных экземплярах. А вот тетерева мало из-за того, что на территории заповедника отсутствуют лесолуговые и полевые ландшафты, и преобладает он в светлых хвойно-лиственных лесах предгорий. В горной тайге обитают дятел, кедровка, клесты, кукушка, пеночка-королек, дрозды, синехвостка, соловьи. Соловей красношейка — один из лучших певцов горной тайги, он прилетает в первых числах июня, а с середины августа здесь уже не встречается. В светлохвойных лесах предгорий гнездится иволга.

Хищные птицы представлены 12 видами. Многочисленны совы, среди них наиболее распространены длиннохвостая неясыть, филин и ушастая сова. В скалах гнездятся сокол-сапсан, стрижи, филин, орел-могильник, беркут, занесенный в Красную книгу. В предгорьях встречаются скворцы, малый и белоспинный дятлы, чечевица, зяблик и др.

45 видов млекопитающих селятся в большинстве районов заповедника. Для некоторых видов заповедник стал границей их распространения. Так, для марала и сибирской косули это северная граница распространения, для кабарги и пищухи — западная.

Самые массовые зверьки в Столбах — красные полевки. Водятся белка, колонок, суслик, бурундук, лисица. Соболь ко времени организации заповедника был в этих местах полностью истреблен. В 1951 и 1956 годах сюда привезли две небольшие партии витимских соболей. Сейчас они размножились и стали обычными обитателями заповедника.

Здесь живут медведи (15–17 голов), волки, лоси, росомаха, заяц-беляк, но редки горностай и ласка. Обитателей водоемов — выдры, норки, водяной крысы, ондатры — немного.

Одна молодая рысь, появившаяся на территории заповедника, положила начало организации маленького зоопарка при Столбах. Сейчас в живом уголке заповедника в вольерах содержатся и приручаются звери и птицы горной тайги.

Богат заповедник дикими копытными: маралами и кабаргой.

Кабарга — самый многочисленный вид копытных в заповеднике. Это типичный представитель горной тайги, маленькое оленеобразное животное, длина тела которого редко превышает 90 см, а вес — 17 кг. Она придерживается участков с крутыми скалами.

Второй по численности в заповеднике среди диких копытных — марал. Летом он селится в травяных борах, по склонам, зимой — в темнохвойной тайге.

На охраняемой территории диких копытных подкармливают зимой сеном, вениками; сооружают искусственные гнезда (дуплянки), которые охотно заселяются птицами.

Научные сотрудники составили „Летопись природы“ заповедника за двадцатилетие (1925–1945 гг.). Позже здесь начали вести годовые „Летописи“, в которых отражаются изменения, происходящие в природе горной тайги. Ученых интересуют условия восстановления кедровых лесов, образ жизни кабарги, состав почвы сиенитового массива, фауна пресных водоемов.

С Красноярскими Столбами связана история зарождения скалолазания в России. В 1851 году здесь состоялся первый подъем на первый Столб; альпинисты, которые покоряли здешние скалы, стали называть себя столбистами, для которых характерны не только оригинальная техника скалолазания, но свои обычаи, этика.

В. Зайцев пишет: „Существует несколько групп, или общин, столбистов. Каждая из них имеет свое название, своих лидеров и, главное, какую-то свою характерную особенность, передаваемую от поколения к поколению. Например, чтобы стать членом легендарной команды „Абреков“, нужно непременно уметь пить, петь под гитару и проходить без страховки определенные сложные ходы и лазы. „Грифы“ — это общество столбовских интеллигентов, бережно хранящих традиции старого доброго „романтического“ столбизма. А вот „Эдельвейсы“ — кузница профессиональных альпинистских кадров, они пользуются богатым арсеналом современной техники скалолазания — при этом, правда, каждую новогоднюю ночь, за несколько минут до прихода Нового года, устраивают „забег“ на вертикальную двадцатиметровую кручу… со связанными руками! Победителя наверху ждут звезды и бутылка шампанского, рекорд подъема — 45 секунд!“

Еще одна особенность — у каждой группы обычно на Столбах есть своя избушка с одноименным названием. Хозяйкой избушки считается та компания, которая построила ее. Но вход в нее не закрыт для любого пришедшего на Столбы.

Столбисты всегда отличались и своей экипировкой. Они носили когда-то брюки и шаровары с лампасами и разноцветными заплатами, белый крахмальный воротничок с бантиком на шее, оригинальный головной убор и красный кушак длиной 6–7 метров (кушак помогал при лазании и страховке). Хотя кушаки уже давно не пользуются популярностью у столбистов, но обыкновенные резиновые галоши по-прежнему остаются здесь самой удобной обувью для восхождения на скалы.

Заповедник занимает обширную территорию восточного побережья Камчатки. Своим возникновением он обязан отнюдь не красоте природы, а камчатскому соболю. Соболиным заказником у коренного населения он был уже в середине XIX века (в нем под страхом смерти запрещался промысел), а заповедником стал в 1934 году. Однако Кроноцкий заповедник несколько раз упраздняли. И, наконец, 1 января 1967 года его открыли в третий раз (на площади 964 тысяч га). Переорганизация заповедника сопровождалась перекраиванием границ. В это время в заповедную зону вторгались лесорубы, вели разведочные работы нефтяники. Богачевская геологическая экспедиция тоже внесла свою лепту в истребление лесов, зверей, птиц и других природных ресурсов. Потом сюда пришли энергетики…

На процесс разрушения заповедника оказал влияние и тайфун „Эльза“, обрушившийся на Камчатку 4 октября 1981 года. Дожди, порожденные тайфуном, не прекращались трое суток. Под сильнейшим напором воды сходили с места громадные валуны, разбивая и уничтожая все на своем пути. Тогда перестал существовать гейзер Большая Печка, самый опасный из гейзеров долины (он фонтанировал в горизонтальном направлении на высоте человеческого роста). Серьезно пострадал источник Малахитовый Грот.

В 1982 году к заповеднику была отнесена трехмильная акватория, таким образом его площадь увеличилась до 1099 тысяч га.

Любопытно, что когда на Камчатке был образован Кроноцкий заповедник, Долина гейзеров (таких всего четыре на планете), о которой тогда еще никто не знал, оказалась внутри заповедной территории.

О возрасте Долины гейзеров можно лишь догадываться. Древние жители Камчатки, жившие менее чем в 30 км от этой долины, боялись забираться глубоко в горы. Ничего не слышали о Долине гейзеров и первые исследователи Камчатки, участники экспедиции Беринга. В 1854 году путешественник Карл Дитмар прошел со своим отрядом всего в 14 км от долины, в 1909-м совсем близко от нее находился лагерь Владимира Комарова. Не дошел туда в 1933 году и известный исследователь термальных минеральных источников Камчатки В. И. Пийп.

Лишь в апреле 1941 года тайна Долины гейзеров была раскрыта. В начале 1940-х годов в заповеднике производилась инвентаризация угодий, и молодому научному сотруднику Татьяне Устиновой было предложено выяснить, почему река Шумная никогда не замерзает и откуда она берет свое начало. Устинова отправилась в путь на собачьей упряжке вдвоем с наблюдателем заповедника, проводником-ительменом Анисифором Крупениным.

Поднявшись от устья Шумной, исследователи обнаружили, что Шумная образуется слиянием двух рек. Обследуя русло Шумной, они вошли в узкий проход между скалами. Шли сначала на лыжах, потом пешком (более семи часов в пути!), а истока все не было видно. Они уже решили возвращаться к лагерю и ненадолго присели на снежном склоне — закусить перед обратной дорогой. Т. Устинова вспоминает: „Напротив нас на левом берегу у воды на лишенной снега площадке выбивалось несколько струек пара. Вдруг одна из них стала быстро увеличиваться, повалили клубы пара, и с грохотом вырвались косые струи кипятка, достигавшие подножия нашего правого склона реки. Их сопровождали поднимающиеся высоко вверх клубы пара. Мы перепугались, не понимая, что же происходит. Было такое чувство, что начинается какой-то катаклизм: как-никак мы были в окружении действующих вулканов… Извержение продолжалось около трех минут, потом прекратилось. Все стихло, исчезло, как не бывало. Мы сидели, совершенно ошеломленные. Потом меня осенило — ведь это же гейзер! Гейзеры в Азии, в частности на Камчатке, не были известны, и трудно было сразу сообразить, что к чему…“ Этот впервые увиденный в Кроноцком заповеднике гейзер назвали Первенцем.