Пока «Морган» стоял в одиночестве вне полосы тумана, немецкая подводная лодка, следившая за ним всю вторую половину дня, вышла на позицию для атаки. Это была «U-88», потопившая утром «Карлтона». Перезарядив торпедные аппараты, она погрузилась в нескольких милях в стороне и теперь сблизилась с «Дэниелом Морганом», идя в подводном положении. Как раз в тот момент, когда капитан-лейтенант Бохман хотел уже выстрелить торпеды, американское судно неожиданно дало ход. Другие суда к этому времени уже вошли в полосу тумана, поэтому «Морган» также лег на курс, ведущий к полуострову Адмиралтейства на Новой Земле. Бохман вынужден был отставить атаку, а затем всплыть и начать преследование снова.
Около 15.00, продолжая идти на восток, «Дэниел Морган» вышел из полосы тумана с другой стороны и увидел справа от себя шедший параллельным курсом «Файрфилд. Сити». «Морган» по-прежнему не знал, что его преследует подводная лодка, но зато Бохмай видел его хорошо. Когда «U-88» начала обгонять судно, чтобы занять позицию для атаки, над судами появились три самолета «Юнкерс-88», маневрировавшие для нанесения удара по «Файрфилд Сити». «Морган» еще раз открыл по ним огонь, но безуспешно. Первая серия бомб взорвалась рядом с правым бортом «Файрфилд Сити», а второй самолет, пролетая над судном вне дальности действия зенитного огня, сбросил еще одну серию и добился прямого попадания в кормовую часть палубы. Третий самолет сбросил бомбы прямо на крыло ходового мостика; взрывом были убиты все находившиеся на мостике, кроме рулевого, которого сильно ранило, и двух человек, укрывавшихся в камбузе. С горящего судна спустили три спасательные шлюпки, причем одна из них была сильно повреждена, и «Файрфилд Сити» вскоре затонул вместе с грузом, состоявшим из танков.
Спасательные шлюпки начали свой длинный путь к Новой Земле, а «Дэниел Морган» исчез за горизонтом.
Появились еще три «юнкерса», которые вместе с первыми тремя в течение часа несколько раз атаковали «Дэниела Моргана». Капитан судна умело маневрировал, а зенитные орудия вели огонь с максимальной скорострельностью, поэтому ни одному из бомбардировщиков пока не удалось добиться попадания. Моряки «Моргана», находившиеся на боевых постах беспрерывно в течение двадцати восьми часов, начали проявлять признаки явного перенапряжения. После кратковременной передышки, которую они использовали для перезарядки кассет с боеприпасами, появилась еще одна группа из пяти «юнкерсов», которые атаковали судно в быстрой последовательности. Артиллеристам удалось добиться попадания в первый самолет.
Охваченный пламенем, он скрылся за горизонтом; сброшенные им бомбы упали в воду на расстоянии пятидесяти метров от правого борта. Атаки второго и третьего самолетов оказались также безуспешными. Однако четвертый сбросил бомбы настолько близко к правому борту, что их взрывами повредило обшивку корпуса в районе между четвертым и пятым трюмами. Судно сразу же накренилось на правый борт и начало оседать кормой. Вышло из строя рулевое управление. Бомбардировщики прекратили. «U-88» Бохман заметил, что судно плохо удерживается на курсе, и правильно предположил, что рулевое устройство на нем повреждено.
Нагруженный 2800 тонн стали, продуктов, взрывчатки, танков и автомашин, «Дэниел Морган» оборонялся упорнее, чем другие, но теперь он фактически стал беззащитным. Один моряк был убит взрывом; в перегретом патроннике 76-мм пушки заклинило патрон, и она вышла из строя; большая часть боеприпасов к 12,5-мм автоматам была израсходована. Начальник военной команды судна лейтенант Мортон Вулфсон доложил обо всем этом капитану. Приказав радисту передать в эфир сигнал бедствия в результате воздушной атаки с указанием координат «Моргана», капитан Сулливан распорядился, чтобы экипаж находился в готовности покинуть судно на спасательных шлюпках. Мортон и два артиллериста все еще пытались вытащить заклиненный патрон из патронника орудия, но безуспешно. Многие моряки решили, что происшедшего с них достаточно, и без дополнительного приказа спустили спасательные шлюпки и отошли в сторону; на борту судна осталась приблизительно половина экипажа и большая часть военной команды. Одна шлюпка опрокинулась, и все находившиеся в ней оказались в воде. Управляя судном с помощью машин, капитан развернул его так, чтобы дрейфующие шлюпки оказались у борта. Шлюпки подтянули к борту и загрузили их по норме, при этом случилось так, что в результате паники и неразберихи утонули два человека, включая помощника капитана. Как только аа три спасательные шлюпки погрузили все необходимое, экипаж покинул судно. Кто-то, по-видимому, заметил и второго противника — подводную лодку, поскольку в эфир был передан сигнал бедствия, предваренный словами «подводная лодка», с указанием координат «Дэниела Моргана». Услышав звуки металлических ударов, оператор гидрофонной аппаратуры на «U-88» доложил о них Бохману. Командир подводной лодки решил, что на судне осталась часть экипажа, которая пытается отремонтировать рулевое управление. Бохман выстрелил торпеду из первого аппарата в левый борт судна и видел, как из его корпуса взвился столб серого дыма. Через несколько минут Бохман выстрелил еще одну торпеду из четвертого аппарата, которая взорвалась в машинном отделении «Моргана». Командир лодки увидел через перископ белые столбы пара — результат взрыва котлов. Судно начало оседать в воду, затем медленно поворачиваться на борт, потом неожиданно опрокинулось и скрылось под водой, оставив на поверхности три спасательные шлюпки. Бохман записал в свой журнал: «Потопил судно двумя торпедами в то время, когда на нем производили ремонт».
Находящиеся на шлюпках американские моряки видели, как неподалеку от них из воды вынырнула огромная немецкая подводная лодка. Приблизившись, немцы сфотографировали шлюпки. Немецкий офицер, говоривший по-английски с едва заметным акцентом, спросил американского капитана: «Как называется ваше судно? Какое водоизмещение? Какой груз?» Сулливан, не задумываясь, ответил, что судно доставляло генеральный груз, состоящий из продуктов питания и кожи. Немцы грубо заметили, что не верят ему, однако на этом допрос закончился. Американцы спросили в свою очередь курс на ближайшую землю. Им ответили, что надо идти на юг. Некоторое время подводная лодка держалась вблизи шлюпок, затем, увеличив скорость, отошла прочь в поиске новых жертв.
Приблизительно в то же время, когда «юнкерсы» атаковали «Дэниела Моргана» и заставили его остановиться, недалеко в стороне невидимый подводный противник догонял американское грузовое судно «Хоному», трюмы которого были загружены 7500 тонн стали, танков, боеприпасов и пищевых продуктов. К «Хоному» приближалась подводная лодка «U-334» под командованием капитан-лейтенанта Хилмара Саймона. Торпедисты подготовили к стрельбе первый, второй и четвертый торпедные аппараты.
Судно представляло собой идеальную цель для атаки: соблюдая полное радиомолчание и имея на вахте десять человек, оно шло устойчивой 10,5-узловой скоростью, не пытаясь применять никаких зигзагов. К 15.00 5 июля «U-334» заняла позицию впереди намеченной жертвы, ожидая, когда судно войдет в сектор обстрела. В 15.28, когда ничего не подозревавший «Хоному» появился. на перекрестии нитей перископа, командир подводной лодки выстрелил веером три торпеды с расстояния семи кабельтовых. Оператор гидрофонной установки следил за шумом идущих торпед в течение шести минут. Взрыва не последовало — все три торпеды прошли мимо.
Саймон быстро развернул лодку на 180° и в 15.36 выстрелил по «Хоному» торпеду из кормового аппарата. Однако еще за несколько секунд до выстрела Саймон увидел через перископ, как из третьего трюма судна вырвался высокий столб дыма и оно начало заметно оседать. Когда шум взрыва стих, оператор гидрофона уловил шум выстреленной из кормового аппарата торпеды, которая все еще шла где-то в стороне от цели. Значит, «Хоному» торпедировал кто-то другой. Несколько минут спустя последовал второй взрыв, после которого судно скрылось в облаке дыма и начало погружаться еще быстрее.