Иезуит А. Родригес назвал «Общество Иисуса» эскадроном, который бог послал для укрепления своей церкви. Игнатий Лойола предложил папе Павлу III создать «Христово воинство», готовое в любое время, в любом месте и любыми средствами сражаться с антихристом Лютером и его последователями. Реформе Лютера Игнатий Лойола противопоставил контрреформу.

Папе особенно импонировал четвертый обет, который требовал от членов «Общества Иисуса» посвятить свою жизнь постоянному служению «Христу и папе», исполнять военную службу под знаменем Христа. Устав, который Игнатий Лойола предложил папе Павлу III, начинался словами: «Кто желает быть членом нашего общества, которое мы называем именем Иисуса, кто желает сражаться под знаменем Христа и служить одному господу богу и его наместнику на земле, римскому папе, тот должен дать торжественный обет целомудрия и вечно помнить цели нашего общества».

Орден сложился как централизованная полувоенная организация. Наряду с обычными монашескими обетами (послушания, целомудрия, нестяжательства) иезуиты принимали обет повиновения приказам папы и генерала ордена.

Папа Павел III поручил ордену насаждать католицизм, используя публичные проповеди, духовные упражнения, обучение детей и взрослых христианству. Но этим «Общество Иисуса» не ограничило свою деятельность, а стало ударным отрядом католической церкви.

В 1541  г. Игнатий Лойола избирается генералом ордена. В выборах участвовали все 10 членов ордена, которые отдали свои голоса за Игнатия Лойолу. Он долгое время не соглашался, дабы показать свое смирение, а затем по настоянию своего духовника Игнатий Лойола принял этот пост. Его последователи стали именоваться воинами «Общества Иисуса». Лойола создал полувоенную организацию, которая занималась не столько религией, сколько политикой. Членов «Общества Иисуса» стали называть иезуитами лишь после завершения работы Тридентского собора (1545–1563).

По поручению папы Павла III в Тренто для участия в соборе были направлены иезуиты Д. Ленец – будущий генерал «Общества Иисуса» и А. Сальмерон. Затем к ним присоединились еще несколько иезуитов, которых инструктировал сам Игнатий Лойола. Иезуиты мало выступали на соборе, больше слушали. Игнатий Лойола приказал иезуитам, принимавшим участие в Тридентском соборе, собираться каждый вечер для обсуждения ситуации. Они вели главным образом закулисные переговоры с участниками собора. Генерал ордена советовал иезуитам выждать подходящий момент, для того чтобы навязать собору свою точку зрения. На соборе иезуиты выступали как ярые защитники прерогатив папы римского. Они ратовали за неограниченную власть папы, высказались против созыва вселенских соборов, так как опасались, что к последним будут обращаться с жалобами на пап. Представители «Общества Иисуса» отстаивали в своих речах и записках догмат о папской непогрешимости, о безусловной супрематии главы католической церкви над всеми епископами, о превосходстве его власти над светской. Иезуиты оказали определенное влияние на собор и его решения. Собор предал анафеме протестантизм, утвердив догматы о первородном грехе, чистилище.

Ареной исторической борьбы между католицизмом и протестантизмом стали Франция, Нидерланды, Германия. Эти страны были главным «театром военных действий» «Общества Иисуса». Здесь, выполняя воинственное призвание, оно неустанно боролось в течение почти двух веков и одержало наряду с серьезными неудачами свои наиболее крупные победы. В этих странах иезуиты втирались в доверие к монархам, диктуя свою линию в сфере политики, а именно подчинение ее интересам папского престола. Они были влиятельными при дворах многих европейских монархов, которые благоволили к ним, видя в «Обществе Иисуса» своего союзника. Этим пользовались солдаты Лойолы, которые фактически хозяйничали в некоторых странах. Так, духовниками короля Людовика XIV и членов его семьи были иезуиты. В 1670  г. король предоставил своему духовнику Ф. Лашезу (занимавшему эту должность в течение 36  лет) право предлагать кандидатов на все высшие церковные должности во Франции.

Однако усиление власти ордена иезуитов шло вразрез с интересами нарождающейся буржуазии, которая стремилась покончить с засильем иезуитов во многих сферах духовной и общественно-политической жизни, этой опоры феодально-католической реакции.

Орден иезуитов – одна из самых воинствующих организаций католической церкви. Не случайно именно в произведениях Игнатия Лойолы и его преемников на посту генерала ордена часто встречается военная терминология. «Общество Иисуса» было названо его основателем «компанией», т.  е. ротой, «когортой для борьбы против врагов христианства».

Журнал иезуитов США «Америка» в статье «Игнатий Лойола – солдат-святой», опубликованной в 1971  г., пытался доказать, что Игнатий Лойола не воспитывал иезуитов в воинственном духе. Основателя ордена часто называют, говорится в статье, солдатом и его военный опыт трактуется как ключ к пониманию его жизни и характера, который он придал ордену иезуитов. Его скорее учили быть придворным – танцевать, пользоваться шпагой и рапирой, сочинять сонеты и вести занимательную беседу. Почему же Игнатий Лойола назвал основанный им орден ротой Иисуса? Имел ли он в виду военное формирование? Автор статьи утверждает, что так в XVI  в. назывались религиозные общества, а вообще военная карьера Игнатия Лойолы была короткой. Однако она оказала определенное влияние на организованный им орден и его статут.

Лойола считал необходимым, чтобы организованный им орден приспосабливался к условиям времени и места. Этому отвечали его структура и устав, обеспечившие членам ордена большие возможности для маскировки и маневрирования. В отличие от других католических орденов, например доминиканцев, францисканцев, орден иезуитов был поставлен в особое положение. Для его членов не обязательно носить монашескую одежду и вести монашеский образ жизни. Устав обязывает их идти в мир, устанавливать связи в высших сферах общества, воздействовать на общественно-политическую жизнь, отстаивая интересы католической церкви. Иезуиты ответственны лишь перед орденским начальством. Они даже не имеют в соответствии с правилами, утвержденными Игнатием Лойолой, общей молитвы – каждый молится индивидуально.

Установка на борьбу против Реформации потребовала изменения традиционных правил, действовавших в религиозных орденах. Вместо монастырей были созданы так называемые резиденции. Иезуитам разрешалось скрывать свою принадлежность к ордену, в его интересах нарушать обязательства, налагаемые на них саном, клятвой и уставом, для приспособления к той среде, в которой им поручалось выполнять задания ордена. Иезуитам давалось право использовать любые средства, включая интриги, клевету, обман, подкуп, яд, кинжал, шпионаж. В петиции, представленной небольшой группой первых иезуитов по вопросу об избрании генерала ордена, говорилось: «В ордене иезуитов повиновение заменяет собой всякое побуждение или чувство, повиновение абсолютное и беспрекословное, без единой мысли или вопроса о целях или последствиях совершаемого». Одним из наиболее реакционных преемников Игнатия Лойолы был В. Ледоховский (1915–1942), стремившийся вернуть ордену дух времен Лойолы. Он предпочитал назначать на должности внутри ордена смиренных и почтительных, тем самым как бы напоминая, что первая заповедь иезуитов есть повиновение, более того, повиновение особого типа, превосходящее все грани вообразимого. О том, как Ледоховский обращался с членами ордена иезуитов, свидетельствует один бывший иезуит: «Он приезжал без предупреждения, без стука входил в комнаты, рылся в ящиках столов, передвигал мебель, отбирал вещи. Однажды после полудня я сидел за письменным столом и читал „Дрок“ Леопарди. Внезапно вошел генерал. Изумленный, я встал. Он подошел и увидел у меня в руках книгу стихов. Он побледнел, потом лицо его побагровело. Он вырвал у меня книгу и глухим голосом произнес: „Стихов у нас не читают, вы больше не будете читать подобных вещей“. Он повернулся и, не попрощавшись, вышел».