Крепость Карс должна была быть срыта, а её окрестности опустошены. Область вокруг Карса объявлена нейтральной.

В 1559 г. принц Баязид, сын Сулеймана Великолепного, бежал в Персию с четырьмя сыновьями и небольшой, но боеспособной армией. Он искал убежище при дворе персидского шаха Тахмаспа. Здесь Баязид был сначала принят с королевскими почестями и дарами, полагающимися османскому принцу. На это Баязид ответил шаху подарками, которые включали 50 туркменских скакунов в богатой сбруе и восхитившую персов демонстрацию верховой езды его кавалеристов.

Затем последовал дипломатический обмен письмами между послами султана, требовавшими выдачи или, на выбор, казни его сына, и шахом, который сопротивлялся и тому и другому, исходя из законов мусульманского гостеприимства. Сначала шах надеялся использовать своего заложника для того, чтобы поторговаться относительно возвращения земель в Месопотамии, которые султан захватил во время первой кампании. Но это была пустая надежда. Баязид был схвачен персами.

По договорённости принц должен был быть казнён на персидской земле, но людьми султана. Таким образом, в обмен на большую сумму золота шах передавал Баязида официальному палачу из Стамбула. Когда Баязид попросил дать ему возможность увидеть и обнять перед смертью своих четырёх сыновей, ему, принцу, набросили шнурок на шею и задушили.

Восстановив к 1578 г., вопреки договору, крепость Карс, турки перешли в наступление и захватили в 1578 г. восточную часть Самцхе-Саатабаго, 10 августа разбили персидские войска при Чилдыре, вторглись в Восточную Грузию и Восточную Армению, заняли Ширван. Но 27 ноября 1578 г. турецкая армия была разгромлена под Шемахой и изгнана из Ширвана.

С 1579 г. турецкая армия и 100‐тысячное войско крымского хана опять совершают набеги на Ширван и Восточную Армению. В 1583 г. они захватили Ширван и Баку. Опустошительные походы турецко-татарских войск в Закавказье продолжались до 1589 г. Значительная часть местного населения была перебита, угнана в рабство или бежала; города Тебриз, Гянджа, Шемаха и другие разорены.

По Стамбульскому мирному договору 21 марта 1590 г. Турция получала весь Азербайджан (без Талыша и Ардебиля), Восточную Армению, Восточную Грузию, значительные части Луристана и Курдистана, а также другие территории.

Победы турок над персами в XVI в. в первую очередь были обусловлены внутренними неурядицами и восстаниями в Иране, который к тому же не имел такой сильной артиллерии и постоянной пехоты, как Турция.

Персидский шах Аббас I Великий, создав регулярную армию, в начале XVII в. начинает новую войну с Турцией, которая была втянута в очередную войну с Габсбургами. Благо на престол взошел молодой султан Ахмед I, а в Анатолии бушевала джелялийская смута. В 1603–1604 гг. войска шаха, разбив турок в битве при Суфиане, взяли и разграбили Нахичевань, Тебриз, Джульфу, Ереван. В 1603–1607 гг. они также уничтожили турецкие гарнизоны в Азербайджане, завоевали Восточную Армению. Из Армении было переселено в глубь Персии более 300 тысяч армян. Так, например, был разорён и уничтожен крупный торговый центр Джуга на берегу Аракса, а его жители переселены в окрестности столицы Персии Исфахана, где они основали город Нор (Новая) Джуга. Были захвачены также Луристан, Восточная Грузия и Южный Курдистан.

Турецкая армия в 1609–1612 гг. неоднократно вторгалась в Азербайджан, пытаясь взять Тебриз, но всякий раз терпела неудачу. Стамбульский мирный договор от 20 ноября 1612 г. подтвердил завоевания Персии.

Но это был не мир, а перемирие. Персидско-турецкий договор от 29 сентября 1619 г. в основном подтверждал положения договора 1612 г. Добавлялось лишь то, что Турция предоставляла Персии свободу действий в Картли и Кахети, а также передавала ему санджаки Дерне и Дертенг.

В сентябре 1623 г. в Константинополе произошёл очередной переворот, психически больной султан Мустафа I был свергнут. На трон возведён 11‐летний Мурад IV. До 1632 г. фактическая власть находилась в руках его матери Кёсем-султан и её сторонников.

Воспользовавшись нестабильностью у соседа, шах Аббас I начал войну. В 1623–1624 гг. персы завоёвывают весь Ирак Арабский с городами Багдад, Неджеф, Кербела, а также Северную Месопотамию. В том же 1624 г. персидские войска в Грузии занимают Ахалцихе.

Однако в конце 1625 г. в результате ослабления иранского господства в Грузии, подорванного народным восстанием Георгия Саакадзе, турки возвращают себе Ахалцихе. За этот район в течение нескольких последующих лет происходила упорная борьба: в 1627 г. он был отвоёван у турок Аббасом I, в 1635 г. турецкие войска вновь занимают Ахалцихе, а также Ахалкалаки. В том же 1625 г. турки отторгли от Грузии Самцхе-Саатабаго, превратив его в турецкий пашалык. Турция вернула себе также Северную Месопотамию с Мосулом и Киркуком, но 9‐месячная осада Багдада (сентябрь 1625 – июль 1626 г.) успеха не имела. Потерпев вторую неудачу под Багдадом в 1630 г., турки сделали главным театром военных действий Западную Персию (разорив лежащий на востоке Персии Хорасан) и Закавказье. В 1638 г. турецкая армия во главе с султаном Мурадом IV взяла Багдад.

17 мая 1639 г. был подписан мирный Касре-Ширинский (Зохабский) договор, по которому между Турцией и Персией в основном подтверждалась граница, установленная договором от 1612 г.

Итак, Западная Армения вновь отходит к Турции, а Восточная Армения – к Персии. На протяжении долгого времени это положение не претерпело существенных изменений и в основном сохранялось до начала XIX в.

Западная Армения в соответствии с административным устройством Османской империи была разделена на эйалеты (пашалыки) – Эрзерумский, Карсский, Себастийский, Ванский и Диарбекирский. В Восточной Армении и Азербайджане были созданы ханства – Ереванское, Нахичеванское, Карабахское, Ширванское и др. Во главе этих административных единиц стояли паши (в Турции) и ханы (в Персии). Они назначались султаном, шахом и имели неограниченную власть.

«Попав под иго турецкой и персидской военно-феодальных деспотий, армянские народные массы подвергались как жестокому национально-религиозному гнёту и притеснениям, так и тяжёлой социально-классовой эксплуатации. Крестьяне отрабатывали кор и бегар (барщину), платили многочисленные тяжёлые налоги и подати чужеземным и местным угнетателям. Плодородные земли всё больше концентрировались в руках феодалов-землевладельцев, число неимущих увеличивалось.

Следствием социального гнёта были народные выступления против церкви, монастырей и землевладельцев-помещиков. К их числу принадлежит, в частности, движение в начале XVII века, возглавлявшееся монахом Мехлу. Этот монах-бунтарь призывал крестьян восстать и прекратить уплату налогов, разоблачал паразитизм духовенства, проповедовал имущественное равенство и т. п. Проповеди Мехлу, направленные против социальной несправедливости, нашли широкий отклик среди армянских и азербайджанских крестьян.

Не угасало и пламя освободительной борьбы. Армянские патриоты, будучи не в состоянии своими силами бороться с чужеземными захватчиками, посылали петиции римскому папе и европейским государствам, надеясь с их помощью освободить страну от ига ханов и пашей. Так, по решению состоявшегося в 1547 г. тайного совещания в Эчмиадзине, католикос Степанос Салмастеци отправился в Рим. В 1562 г. в городе Себастии (Западная Армения) состоялось новое совещание, после которого в Европу было отправлено специальное посольство во главе с Абгаром Евдокаци (Тохатеци). В 1672 г. в Париж прибыл купец из армянского города Битлиса (Западная Армения) Ходжа Мурад и подал письменное заявление королю Людовику XIV. Но эти обращения не дали никакого результата; и римский папа, и европейские короли проявили к ним полное безразличие. С XVII века с просьбами о помощи армяне обращались к усилившемуся Русскому государству»[3].

В 1554–1556 гг. русские войска заняли Астрахань. Было ли это актом агрессии? Астрахань – стратегический пункт юга государства Российского – форпост от вражеских нашествий и защита торговли. Вокруг Астрахани кочевали враждующие между собой ногайский орды. Они могли обеспечивать безопасность купеческих караванов на Нижней Волге.