До самого нападения на Советский Союз Гитлер еще не принял твердого решения относительно управления оккупированными странами Балтии. Он колебался между немецким протекторатом и аннексией. После успешного начала войны на совещании 16 июля 1941 года во время обсуждения целей оккупационной политики и сфер компетенции учреждений также обсуждалось управление оккупированными территориями. В своей вступительной речи Гитлер подчеркнул, что Прибалтийские страны, Белостокская область, Крым, Галиция, Баку, Саратовская область и Кольский полуостров должны быть присоединены к Германии. «Все страны Балтии должны стать частью Рейха». Гитлер сказал. Более того, он посоветовал, что цели войны с Германией не должны объявляться открыто, но необходимо придерживаться линии действий и проводить все необходимые «работы», такие как массовые расстрелы, депортации и т.д. Большинство присутствовавших на встрече согласились с планом Гитлера ввести прямой немецкий оккупационный режим, а не восстанавливать национальные государства на оккупированной территории СССР.
Репрессивные органы Германии (СС, Полиция безопасности и SD) были озабочены не только безопасностью нацистского государства и правительства, разоблачением врагов, но, что наиболее важно, разрабатывали и приводили в исполнение глобальные планы по уничтожению и германизации завоеванных народов. Еще до нападения на Советский Союз руководство Третьего рейха решило осуществить массовое уничтожение евреев, цыган, людей с неизлечимыми заболеваниями или психическими расстройствами, политических комиссаров, должностных лиц советского правительства и коммунистической партии, а также участников движения сопротивления.
Военное оккупационное правительство Германии
Немецкая армия оккупировала Литву в первую неделю войны. С продвижением вермахта дальше на восток Литва стала армейским тылом (Rückwärtiges Heeresgebiet). Генерал Карл фон Рокес, командующий армейским тылом, был главой военной администрации Прибалтики. Генеральный штаб базировался в Каунасе до 17 июля 1941 года, но позже был переведен в Ригу. Военной администрации было запрещено решать какие-либо важные политические вопросы.
Две полевые комендатуры военного правительства (Feldkommandantur) были размещены в Литве — в Каунасе и Вильнюсе. Западная часть Литвы находилась под контролем полевой комендатуры 821-й группы армий «Север» в Каунасе. Первоначально ее возглавлял генерал-майор Роберт фон Пол, бывший австрийский военный атташе в Берлине. Каунасская полевая комендатура контролировала 609-й (в Каунасе) и 307-й (в Шяуляе) охранные батальоны. 403-я охранная дивизия группы армий «Центр» под командованием Вольфганга фон Дитфурта оккупировала районы восточной Литвы и соседней Белоруссии. В Вильнюсе была создана 749-я (позже она стала 814-й) полевая комендатура. С конца августа 1941 года вся территория Литвы находилась под командованием коменданта Роберта фон Поля из службы безопасности армейского тыла в Литве. 1 ноября 1941 года Эмиль Жюст, бывший военный атташе Германии в Литве, был назначен комендантом вместо Поля. Он подчинялся генерал-лейтенанту Фридриху Брамеру, Главнокомандующий вооруженными силами в Остланде, базирующийся в Риге. Местные комендатуры действовали в небольших городах Литвы. В полевых комендатурах военного правительства было 12 офицеров и 40 унтер-офицеров и рядовых, в то время как в местных комендатурах было 2-3 офицера и 12-20 рядовых. В крупных городах полевые комендатуры контролировали 1-2 батальона безопасности, а местные комендатуры контролировали войска безопасности. Более того, подразделения тайной полевой полиции и жандармерии также подчинялись полевым комендатурам. Военные органы должны были поддерживать мир за линией фронта, обеспечивать безопасность, защищать военные объекты и железные дороги, а также бороться с повстанцами и саботажниками. Литва управлялась военной администрацией до введения гражданского правительства Германии (25 июля 1941 года). По приказу военных комендантов были взяты заложники, расстреляны гражданские лица и военнопленные, разграблены государственные и кооперативные склады, установлены цены и курс валюты, захвачены здания и квартиры, реквизированы лошади и запасы продовольствия, установлен комендантский час и т.д. Военно-полевые коменданты обладали неограниченной властью на подчиненной им территории. В первые дни оккупации (25-26 июня) немецкие военные коменданты в Каунасе и Вильнюсе установили обменный курс между маркой и рублем (1 марка Рейха [RM] была равна 10 рублям). Всем магазинам было запрещено повышать цены. Таким образом, немецкая армия и военная администрация также установили условия, позволяющие им покупать товары в литовских магазинах и на складах по очень низким ценам, и литовский народ снова был ограблен.
Правление немецкой военной администрации закончилось 28 июля 1941 года, в тот день в Каунас прибыл рейхскомиссар Остланда Ханс Хинрих Лозе, который издал прокламацию о введении гражданского правительства Германии в Литве. Месячное военное правление Литвы закончилось. Хотя военная администрация не признала Временное правительство Литвы, она не отказалась сотрудничать с литовскими правительственными учреждениями. Военные власти меньше вмешивались в работу местных учреждений, чем позднее гражданское правительство Германии. Военные власти Германии больше всего заботились о поддержании безопасности и снабжении вооруженных сил. В результате при рассмотрении гражданских дел литовские власти обладали относительно большой свободой.
Гражданское правительство во время оккупации
Секретным указом от 17 июля 1941 года «Об управлении недавно оккупированными восточными территориями» Гитлер объявил об учреждении гражданского правительства в оккупированных восточных регионах. Оккупированные территории были разделены на рейхскомиссариаты, которые подразделялись на общие области и округа. Гитлер назначал рейхскомиссаров и генеральных комиссаров, в то время как Розенберг — руководителей основных подразделений рейхскомиссариатов и окружных комиссаров.
Указом от 17 июля 1941 года было объявлено, что рейхскомиссариат Остланд был сформирован «из бывших независимых стран Литвы, Латвии, Эстонии» и Беларуси. Верховный президент и гауляйтер провинции Шлезвиг-Гольштейн Хинрих Лозе был назначен рейхскомиссаром гражданского правительства Остланда. Его резиденция находилась в Риге. Рейхскомиссариат Остланд был разделен на генеральные округа Литвы, Латвии, Эстонии и Беларуси. Генеральные комиссары (Теодор Адриан фон Рентайн, Отто Дрехслер, Карл Лицманн и Вильгельм Ими управлял Куб соответственно). Они подчинялись рейхскомиссару Остланда Лозе. Границы генеральных округов не всегда совпадали с границами бывших советских республик. Например, восточная часть Беларуси оставалась под военным управлением на протяжении всего периода немецкой оккупации. Генеральный округ Литвы был разделен на четыре сельских округа (Landgebiet) — Вильнюс, Каунас, Шяуляй и Паневежис, и два городских округа — Вильнюс и Каунас. Власти округов подчинялись окружным комиссарам (Gebietskommissare). Хорст Вульф был комиссаром Вильнюсского округа, Ханс Хингст — города Вильнюса, Арнольд Ленцен — Каунасского района, Ханс Крамер — города Каунас, Ханс Гевеке — Шяуляйского района и Вальтер Нойм — Паневежисского района. Окружной комиссар обладал исполнительной, законодательной и судебной властью региона; ему подчинялись полиция порядка и жандармерия. Полиция безопасности и СД не подчинялись окружным комиссарам.
Лозе принял руководство Остландом 25 июля 1941 года, а три дня спустя (28 июля) выпустил воззвание «К литовцам!», в котором объявил, что указом Гитлера от 17 июля 1941 года он был назначен рейхскомиссаром Остланда, а доктор А. Т. фон Рентайн — генеральным комиссаром Литвы. Лозе приказал населению Литвы полностью выполнять все приказы правительства Рейха. Он призвал жителей Литвы сотрудничать с немецкими властями и совместно бороться против мирового врага (Weltfeind) большевизма.
