Во время первого оледенения Европы (плейстоцен около 150 тыс. лет тому назад) в Сибири, возможно, не было льдов, но влияние сказалось понижением температуры и господством хвойной тайги. К началу плейстоцена флора на территории России приняла сходный характер с современной действительностью.
Первое оледенение на территории Сибири произошло около 120 тыс. лет тому назад, следы которого относятся к эпохе миндельской. Во время, первого отступления ледника устанавливается субарктический климат с растительностью кустарниковой тундры с ивами, приземистой березкой, позднее появляются древесные породы: кедр, сосна и лиственница. В первую межледниковую эпоху кедр, встречался на равнине в Польше, а в межледниковые эпохи, когда ледники отступали, наблюдалось расширение области распространения кедра в Западной Европе и Сибири.
Кедровые леса Русской равнины и Урала являются молодыми, по сравнению с кедровниками Западносибирской низменности, которые образовались в результате переселения кедра из предгорий Саяно-Алтайских хребтов. Горные цепи после освобождения их из-под ледника начали заселяться кедром и пихтой, к которым присоединились ель и сосна. Во время начала фазы еловых лесов, когда климат стал суше, получили распространение степи и их остатки можно видеть в настоящее время в лесной зоне, в виде участков со многими степными элементами в средней части Якутия Саха, на Алтае, Ангаре. Эти степные элементы, являясь реликтовыми, обязаны своим происхождением теплому и более сухому периоду. Возможно, что останки сайги, тигра, лошади и марала, отмеченные в посттретичных слоях Новосибирских островов, должны относится к этому времени, как и неоднократно наблюдавшиеся в почве в разных частях тундры Сибири пни деревьев.
После изменения климата в сторону большего увлажнения, степи стали заниматься лиственничными лесами, которые были вытеснены кедровниками. Остатки лиственничных лесов сохранились в верхней части лесного пояса, в виде узких полос во многих местах Алтая, так как кедр не успел вытеснить их. В процессе филогенетических смен, кедр и входящие в состав его фитоценозов растения не оставались неподвижными, а претерпевали изменения, приспосабливались к изменяющимся климатическим условиям. Наиболее древними типами являются мшистые кедровые леса, которые в измененном виде существовали в конце третичного периода и занимали более северные широтные районы и более высокие части гор. Кедровники из корейского кедра являются очень древней формацией, сохранившейся с третичной эпохи в Уссурийском крае, который не испытал непосредственного влияния ледникового покрова. Из семейства брусничных, в кедровниках Европы и Сибири, встречаются всего четыре вида, а в тропических странах Америки и Южной Азии количество родственных форм достигает свыше 300.
Из мшистых кедровников выделяются типы с баданом (Bergenia crassifolia), который является древним вечнозеленым растением, приспособившимся к кедровым лесам с третичного периода. Сфагновые кедровники являются молодой послеледниковой группировкой, т.к. сфагновые мхи являются молодыми, они отсутствуют в третичных отложениях. «Доледниковая» флора, в которой обнаружены сфагновые мхи, относятся к первому межледниковому периоду. Эти кедровники в послеледниковое время получили развитие в сосново-березовую фазу, когда в Западной Сибири наблюдался быстрый рост болот. В это время с востока пришел кедр, а с запада сосна, образовавшие сосново-кедровые леса на болотах. В фазу еловых лесов во время сухого и теплого периодов образовался пограничный горизонт; многие болота подсохли, и площадь сфагновых кедровников сократилась. С увлажнением климата болота получили распространение в Западносибирской низменности и сохранились до настоящего времени.
Лишайниковые кедровники являются молодыми типами, возникшие в послеледниковое время в субальпийском поясе на крупно- щебенчатых почвах.
Широкотравные кедровые леса являются молодыми группировками, возникшими в верхней части лесного пояса после ухода ледника, на почвах, достигших определенной мощности. Самыми молодыми фитоценозами являются приручейниковые и прибрежные кедровники, которые не обладают устойчивостью и под влиянием экогенетических смен переходят в мшистые типы. Молодыми являются кедровники равнинные с подлеском из рябины.
Сравнительно молодыми послеледниковыми ассоциациями являются кедровники с подлеском из крупнолистной березы. Областью распространения круглолистной березы являются Северная Монголия, Саяны, и Алтай, где в бассейнах рек Бии и Катуни на гольцах и в субальпийских кедровниках образует сплошные заросли.
После ухода с хребтов Алтая ледника, их заняли заросли круглолистной березы, которые получили широкое распространение вместе с кедровыми лесами. Постепенно занимая горы, они способствовали уменьшению площадей, занятых ассоциациями круглолистной березы.
Кедровники с подлеском из кедрового стланика являются молодыми послеледниковыми фитоценозами. Обычно кедровый стланик приурочен к лиственным лесам, в послеледниковое время, когда кедр стал вытеснять во многих районах лиственницу, он встретился со стлаником и образовал ряд типов. Молодыми группировками являются кедровники с подлеском из даурского рододендрона, который в своем развитии был больше связан с сосняками и лиственничниками, чем с кедровыми лесами.
Анализ ареала видов кедра, относящихся к секции Cembra, позволяет утверждать, что они образовались на юго-востоке Азии и во второй половине третичного времени распространились на Алтае в Саянских горах. Более молодыми видами являются сибирский кедр и кедровый стланик. Сибирский кедр проник в Европу в третичное время. В эпоху максимального оледенения кедр в Сибири и Западной Европе нашел убежище в предгорьях горных цепей, не подвергавшихся оледенению. В послеледниковое время кедр стал распространяться с Саяно-Алтайских гор на запад и восток. С середины сосново-березовой фазы кедр с пихтой появляются в равнинной части Западной Сибири, где в следующую эпоху широколиственных лесов получил господство и подошел к Уралу. В начале фазы еловых лесов он приходит на западный склон Урала и Русскую равнину. В последнюю фазу еловых лесов на Западносибирской низменности кедровники стали преобладающими. В конце этой эпохи наблюдается уменьшение кедровых лесов, так как на сцену выступает человек, способствующий уничтожению темнохвойных лесов.
Сколько не разгаданных тайн хранит кедр, лишь легенды коренных народов Севера и Сибири что-то сохранили о кедре, в виде эпосов и сказаний.
Например, такое сказание: «Кедр вылечил».
Шорский народ состоит из сеоков. Сеок переводится как кость. Вот и получается, что народ состоит из отдельных костей—сеоков. У каждого сеока было своё священное дерево. И народ считал, что кости людей сеока сделаны из породы священного дерева сеока. Так народ считал и глубоко верил в это. Верил народ также в то, что каждое дерево имеет своё чула, и каждый человек имеет своё чула. Чула – это невидимый глазу двойник. И каждое дерево понимает человека именно через этого двойника.
Жил, говорят, один человек. И очень сильно он заболел. Боль была нестерпимая, а врачей в то время в горах Горной Шории не было. И вот, не выдержав боли, задумал он умереть. Рос там, на берегу речки один кедр. Крона, которого касались облака. И вот решил тот человек, что пойдёт он сейчас к тому кедру и умрет возле него. И пусть кости его лежат под тем могучим кедром. Так ему захотелось. Потому что люди верили, что душа человека по дереву уходит на небо.
Превозмогая боль, пришёл тот человек к кедру обнял его и стал ждать, когда он умрёт. Долго он стоял, плача рассказал он кедру всю свою судьбу. Дни сменялись ночами, а ночи утренними туманами. В один жаркий день жажда замучила того человека и пошёл он к реке написаться, но от слабости не устоял на берегу и упал в речку. Хорошо, что речка была не большая. Самое глубокое место доходило ему лишь до колена. Полежал человек и в прохладной воде поднялся, и вернулся к своему кедру. Обнял его и стал просить, чтобы избавил он его от боли.