14 декабря 1987 года в городе Газа шейх Ахмед Ясин (1916-2004 объявил о создании „Движение Исламское Сопротивление” или „Хе́ракет эль-Мука́уамат эль-Ислами́я”, сокращённо ХАМАС. В него вошли две культурно-просветительские и благотворительные ассоциации "Крыло братьев-мусульман Западного берега реки Иордан и Сектора Газы" и "Исламский Джихад – Палестина". Обе организации долгое время пользовались поддержкой Израиля, который видел в них противовес влиянию ООП и другим палестинским националистическим, а также коммунистическим организациям. Однако, шейх Ахмед Ясин на учредительном съезде объявил, что – любого еврея можно считать военным поселенцем, и наша обязанность – убить его, освобождение всей Палестины от моря и до Иордана – наша стратегическая цель, и нет цели более святой и важной. После освобождения от израильского господства Палестина станет центром арабского и мусульманского мира.

В основе идеологии ХАМАС лежит "Исламская хартия" (Пакт Исламского движения Сопротивления), принятая 18 августа 1988 года. В ней не признается право Израиля на существование и ставится цель создания палестинского государства на всей территории, которую занимала подмандатная Палестина до образования Израиля в 1948 году. Интерпретируя её положение, ХАМАС призывает к физическому уничтожению евреев, преследует христиан, левых деятелей, отстаивающих светский путь развития, арабов, сотрудничающих с Израилем.

ХАМАС имеет политическое (легальное) и военное (нелегальное) "крылья". Военное крыло состояло из нескольких структур "Батальоны Изз ад-Дина аль-Кассам", "Бригада ал-Насира Садах ад-Дина" и с 1996 года инженерная часть ”ученики инженера Яхъя Айаша”. Политическое крыло ХАМАС создано в августе 1988 года. Легальное "крыло" занимается ведением пропаганды и вербовкой новых членов через мечети и социальные учреждения. Оно опирается на комитеты поддержки, лагеря беженцев и пропагандистские структуры (в США – Исламская организация Палестины, благотворительные организации в Виргинии и Флориды, Holy Land Foundation, в ФРГ, Бельгии, Нидерланды, Франции, Румынии, Дании, Аргентине, Парагвае и др. странах ЮА). Легальными политическими организациями, представляющие ХАМАС, являются Партия исламского спасения и Исламский фронт действия. Они представляют собой зонтичные организации, представлявшие ХАМАС в органах власти.

Помимо духовного лидера ХАМАС возглавляет Политбюро в составе 18 чел. В него первоначально вошли секретарь, руководители отделений в Палестине, Сирии и Иордании, командующий, официальный представитель организации. Пост председателя Политбюро (позже Исполнительного Комитета) в 1992-6 гг. занимал М. Абу Мурзук, в 1996-2016 гг. Х. Машааль и с 2017 г. И. Хания. Администрацию Сектора Газа представляет консультативный совет (Меджлис аль-шура), в который входят наиболее известные лидеры движения. С 2006 по 2017 год его возглавлял И. Хания, которого сменил Я. Синвар. До 2001 года штаб-квартира партии находилась в Аммане, в 2001-2012 г. – в Дамаске, а с 2012 г. – в Дохе.

В конце 1995 года, на переговорах ХАМАС и ООП в Каире, выявились разногласия между лидерами ХАМАС, находящимися в Газе, с одной стороны, и зарубежными центрами движения (Тегеран, Бейрут, Пакистан, Амман) – с другой. "Газовцев", возглавляемых Исмаилом Ханией и полевыми командирами, стали называть прагматиками, их оппонентов, тесно связанных с „Братьями-мусульманами” Египта – экстремистами. Их лидерами крыла являлся Халед Машааль и М. Абу Мурзук, установившие с Египтом, Катаром и Турцией. Ориентируясь на них, фракция разорвала отношения с Башаром Асадом и Ираном. После свержения президента Мурси экстремисты потеряли поддержку Египта и в 2017 году уступили руководство прагматикам. Их гражданское крыло возглавил

премьер-министр Исмаилом Хания, который предлагает сосредоточиться на внутренних проблемах и не ввязываться в посторонние конфликты. Военное крыло прагматиков во главе с  Махмулом аз-Захаром и лидерами военных подразделений ХАМАС имеет давние связи с Ираном и ориентируется на него.

„Крыло братьев-мусульман Западного берега реки Иордан и Сектора Газы" представляла собой отделение египетской исламистской организации «Братья-мусульмане». Она представляла собой международную религиозно-политическую ассоциацию, основанную в марте 1928 года в египетской Исмаилии. С 1933 года штаб-квартира организации была переведена в Каир. Её основатель Хасан Аль-Банна охарактеризовал движение так: салафийское движение: «ортодоксальный путь, суфийская реальность, политическая организация, спортивная группа, научное и культурное общество, хозяйственная компания и социальная идея». К концу Второй мировой войны  она  насчитывала около 500 тысяч членов. После смерти Хасана Аль-Банна в 1949 году. В 1950 году одним из идеологов движения стал литератор Сейд аль-Кутб (казнён в 1966 г.), который придал движению экстремистское направление и выдвинул лозунг захвата политической власти.  Ассоциация имеет своих приверженцев во многих странах мира и наиболее влиятельна в Египте, Иордании, Сирии и Турции.

„Палестинский исламский джихад” (ПИД) основан в конце 1970-x в Египте палестинцами, сочувствующими движению Братьев-мусульман. После убийства египетского президента Садата в 1981 году, его руководство перебралось в Сектор Газа. Во время первой интифады (1987- 1991 гг.)  лидеры Исламского джихада перебрались в Ливан, где установили прямые контакты с Хезболлой и через неё с Ираном. В 1989 году лидер ПИД Шкаки (убит в 1995 г.) перенёс штаб-квартиру в Дамаск.  На Восточном береге реки Иордан её поддерживают 3% населения, в Секторе Газа – 5%. Организация делится на четыре фракции, три из которых не осуществляют террористических операций. В 2002 году численность военного крыла ПИД не превышала пятьсот человек, применявших стрелковое оружие и инженерные боеприпасы в борьбе с израильскими силами безопасности. После создания ХАМАС ПИД в силу своей специфики не слился с Сопротивлением, но продолжил тесно сотрудничать. Его боевые отряды участвовали во многих операциях ХАМАС в Секторе Газа и не только.

Народный фронт освобождения Палестины (НФОП)– леворадикальная военизированная организация марксистского толка, которая выступает за создание независимого Палестинского государства.. Она была основана в 1967 из трёх слившихся групп палестинских арабов ЧС леворадикальной идеологией. До распада советского блока его основным источником финансирования были европейские леворадикальные организации и собственные производственные и коммерческие структуры в Ливане. В начале первой интифады в ней состояло около 800 боевиков, из которых около сотни (бригада „Абу Али Мустафы”) действовали на территории Палестины. Основные их базы располагалась на территории Сирии и Ливана, где формировались батальоны и артиллерия, оснащённые советским оружием. Другая часть движения – главное командование- в начале первой интифады насчитывало 600 боевиков, включая дельтапланеристов и боевых пловцов. К началу второй интифады НФОП располагало только тремя сотнями бойцов, но затем их число выросло за счёт присоединения отколовшихся в 90-е годы групп Специального Командования. На вооружении состояло стрелковое оружие, миномёты и РПГ. Бойцы НФОП активно пользовались средствами воздушной инфильтрации – планерами, мотто-дельтапланами и воздушными шарами. Особенностью НФОП является наличие у него в 2001 г. подконтрольных СМИ—радиостанции, интернет-портала и информационного центра „ал-Кудс”. НФОП считается террористической организацией  в США, Канаде, ЕС, Великобритании и Израиле .

На выборах в Палестинский законодательный совет  II созыва ( 25.01.2006) НФОП занял третье место и вступил в коалицию с ХАМАС. В дальнейшем боевые отряды НФОП стали совершать террористические рейд против Израиля с территории Сектора Газа, что превратило его в союзника военного крыла ХАМАС.