Возможности Аллена добиваться своего резко возросли после выборов в Конгресс в 1946 г., на которых республиканцы впервые за шестнадцать лет взяли под контроль обе палаты. Новый председатель сенатского комитета по международным отношениям Артур Ванденберг назначил в свой аппарат одного из старых товарищей Аллена по ОСС, Лоуренса Хьюстона. Хьюстон руководил многими тайными операциями и разделял любовь Аллена к ним. Вместе они разработали законопроект, предусматривающий создание Совета национальной безопасности для консультирования президента по вопросам внешней политики и Центрального разведывательного управления, уполномоченного собирать информацию и действовать в соответствии с ней. "Дикий Билл" Донован, бывший директор OSS, вызывавший всеобщее восхищение, лоббировал этот законопроект в Конгрессе, но некоторые члены Конгресса восприняли его неохотно. Некоторые из них хотели, чтобы контроль за тайными операциями осуществлял Государственный департамент, а не новое секретное агентство, но их доводы были ослаблены, когда государственный секретарь Маршалл заявил, что не хочет, чтобы его ведомство участвовало в таких операциях. Законопроект прошел через Конгресс в считанные недели. 26 июля 1947 г. Трумэн подписал его в качестве закона.

"Существовали серьезные возражения против создания единого ведомства, наделенного полномочиями как по сбору секретной разведывательной информации, так и по ее обработке и оценке для президента", - говорится в одной из исторических справок. "Возражения были преодолены, и ЦРУ стало уникальной организацией среди западных спецслужб, которые единообразно отделяют свои секретные операции от общей разведывательной деятельности".

Новый Закон о национальной безопасности содержал манящую оговорку, допускающую бесконечно гибкое толкование. Он уполномочивал ЦРУ выполнять не только обязанности, предусмотренные законом, но и "другие функции и обязанности, связанные с разведкой, затрагивающей национальную безопасность, которые Совет национальной безопасности может время от времени поручать". Это давало ЦРУ законное право предпринимать любые действия в любой точке мира при условии, что их одобрит президент.

"Страх, порожденный соперничеством с такой страной, как СССР, которая возвела контроль над всеми аспектами жизни общества в ранг науки, способствовал формированию в США убежденности в том, что им крайне необходимы военная мощь и контрразведка со стороны ведомств, способных превзойти советских шпионов", - писал историк Роберт Даллек. Дин Ачесон [сменивший Маршалла на посту государственного секретаря] имел "самые серьезные предчувствия" в отношении ЦРУ и "предупредил президента, что ни он, ни Совет национальной безопасности, ни кто-либо другой не сможет знать, что оно делает, или контролировать его". Но противиться созданию агентства казалось близким к измене".

Донован, обладавший всем необходимым опытом для руководства новым ЦРУ, не мог претендовать на эту должность из-за плохих отношений с Трумэном; он был архетипом ловкого юриста с Уолл-стрит, которого Трумэн не любил, а также олицетворял веру в секретность и тайные действия, которую Трумэн не разделял. Аллен, который также мог быть кандидатом, был отвергнут как республиканец, связанный с партийностью своего брата, хотя Трумэн и предложил ему стать послом во Франции, от чего тот отказался отчасти потому, что Фостер опасался, что работа брата на президента-демократа ослабит его республиканские полномочия. Вместо этого Трумэн выбрал на пост первого директора ЦРУ адмирала Роско Хилленкоттера, спокойного, уравновешенного офицера, работавшего военно-морским атташе в Москве.

Хотя ветеранам ОСС и не удалось поставить одного из своих сотрудников во главе ЦРУ, они добились почти всего, чего хотели. Разведывательная служба, которую они считали важнейшей для безопасности своей страны и для своей личной самореализации, была создана. Она была наделена большими полномочиями, чем любая из ее аналогов в западном мире. Единственным препятствием оставался президент Трумэн, который не проявлял склонности использовать ЦРУ так, как этого хотели Аллен и его друзья.

"Это не должно было быть "плащом и кинжалом"!" писал Трумэн в разочаровании много лет спустя. "Он был задуман просто как центр информирования президента о том, что происходит в мире".

Если это и было видение Трумэна, то оно почти сразу же померкло. Всего через полгода после создания ЦРУ оно испытало грубое потрясение, когда коммунисты в Чехословакии совершили "конституционный переворот", приведший их к власти. Это событие привлекло внимание к предстоящим выборам в Италии, где коммунистическая партия набирала силу. ЦРУ направило своих людей в бой, потратив 10 млн. долл. на операции, включавшие поддержку проамериканских партий, таких как христианские демократы, вербовку католических священников и епископов для разоблачения коммунистической угрозы, а также наводнение Италии письмами, брошюрами и книгами, предупреждающими об опасности коммунизма. Аллен взял тихий отпуск в Sullivan & Cromwell, чтобы помочь руководить этой кампанией. Возможно, это было недостаточно тихо, поскольку за десять дней до выборов в Италии в газете Boston Globe появилась статья о его участии под заголовком "Dulles Masterminds New 'Cold War' Plan Under Secret Agents". Однако результат оказался грандиозным: христианские демократы одержали оглушительную победу на избирательных участках.

Первые тайные операции ЦРУ проводились в Европе, где, как считалось, диверсионная угроза была наиболее актуальной. Первые две крупные операции - вмешательство в выборы 1948 г. в Италии и наем корсиканских гангстеров для подавления забастовки докеров под руководством коммунистов во французском порту Марселя - увенчались успехом. Однако примерно в это же время взрыв насилия, произошедший ближе к дому, поколебал предположения о том, что Европа станет главным полем битвы в разворачивающейся тайной войне.

9 апреля 1948 г. во время участия государственного секретаря Маршалла в работе девятой Межамериканской конференции в Боготе (Колумбия) было совершено убийство одного из самых популярных политиков Колумбии, вызвавшее массовые беспорядки, в которых погибли тысячи людей. Историки единодушно считают этот эпизод, известный как "Боготазо", частью обострения гражданской войны, которая сотрясала Колумбию на протяжении десятилетий. В Вашингтоне же его расценили как инспирированную Москвой попытку бросить вызов США, дестабилизировав ситуацию в Латинской Америке. Возмущенные политики и редакционные статьи требовали объяснить, почему не было сделано никакого предупреждения. В атмосфере страха той эпохи мало кто в Вашингтоне мог предположить, что "Боготазо" было вызвано исключительно конфликтами внутри Колумбии. Они полагали, что это часть заговора, затеянного в Кремле.

Вскоре после этих первых стычек "холодной войны" командующий союзными войсками в Европе генерал Люциус Клей направил в Вашингтон леденящее душу предупреждение о том, что советское нападение может произойти "с драматической внезапностью". Это повергло американских лидеров в состояние, которое впоследствии в сенатском докладе было названо "почти истерией". В ответ на это Совет национальной безопасности, просуществовавший год, издал секретную директиву NSC 10/2, одобренную президентом Трумэном, которая давала ЦРУ более широкие полномочия, чем когда-либо. Она была датирована 18 июня 1948 г. - через четыре месяца после прихода коммунистов к власти в Чехословакии и через два месяца после выборов в Италии и "Боготазо". Эти события, говорилось в документе, свидетельствуют о том, что Советский Союз начал "злобную" кампанию против США. В ответ на это СНБ уполномочил ЦРУ вести "пропаганду, экономическую войну, превентивные прямые действия, включая саботаж, антисаботаж, разрушение и эвакуацию, [и] подрывную деятельность против враждебных государств, включая помощь подпольным движениям сопротивления, партизанам и группам освобождения беженцев". Эти операции должны были быть "спланированы и проведены таким образом, чтобы ответственность правительства США за них не была очевидной для посторонних лиц, и чтобы в случае разоблачения правительство США могло убедительно снять с себя всякую ответственность за них".