Вероятно, в монастыре Люксёй вслед за уставом Колумбан создает и покаянную книгу, т.е. предназначенное для аббатов и приходских священников руководство, содержащее перечни разновидностей грехов и соответствующих им епитимий (духовных и физических наказаний как средств исправления и воспитания согрешившего), — «Пенитенциал св. Колумбана» («Poenitentiale Sancti Columbani», или «Regula coenobialis fratrum sive Liber de quotidianis poenitentiis monachorum», «Liber de poenitentiarum mensura taxanda»), текст коего подразделяется на две неравные части: А (из двенадцати пунктов) и В (из тридцати пунктов с отдельным Прологом). В пункте А 1 сказано: «Истинная епитимия — заслуживающее покаяния [наказания] не совершать, но совершенное оплакивать. Но поскольку это не исполняется слабостью многих, если не всех, - следует сообщить пенитенциальные меры. Порядок их поведан Святыми Отцами, дабы в соответствии с мерой грехов устанавливалась мера пенитенции»; в Прологе к части В: «Разница вины порождает различие пенитенции. Ибо и лекари тел составляют различного вида лекарства, ибо одним образом [готовят их] для лечения ран, другим - для болезней, иным - для нарывов [опухолей], иначе — для кровоподтеков, по-другому - из-за нагноения, иным образом для глазных болезней, по-иному для переломов, иначе - для лечения ожогов. Вот точно так же духовные лекари должны излечивать различного вида попечением душевные раны, болезни, провинности, скорби, печали, слабости. Но поскольку рассматриваемое [качество лекаря] имеется у немногих — познать, воистину безупречно, всевозможное лечение, как лечить и восстанавливать слабых к состоянию возобновления здоровья, — так или иначе хотя бы немногое [следует нам здесь] объявить согласно преданию древних и отчасти согласно нашему пониманию, — частью в самом деле пророчествуя, частью — зная». При этом предполагается, что в то время как часть А предназначена всецело для монахов, пункты 5 1 — 12 предназначены для белого духовенства, В 13—25 — для мирян, В 26—30 — вновь для монахов. Одновременно существуют разные точки зрения относительно того, какая из частей написана раньше, а какая позже, и в какой мере данный текст принадлежит непосредственно самому св. Колумбану, а в какой является позднейшей редакцией: так, например, вероятно, только ок. 608 г. в «Пенитенциал» были включены пункты Л 9-12, В 26-30 и так же, только в нач. VII в., были добавлены пункты В 24-25, ибо именно в то время в окрестностях Люксёя была наиболее распространена упоминаемая там ересь боносиан (bonosiani), отрицавших божественность Христа и являвшихся последователями Боносия — епископа Сардики (episcopus Sardicensis), т.е. Софии, противостоявшего, в свою очередь, учению о вечной девственности Марии.
Полагая наказания за убийство, насилие, прелюбодеяние, кражу, клевету, клятвопреступление, колдовство, непослушание, чванство, обжорство, пьянство и т.п., «Пенитенциал» касается даже самых мелких провинностей: «Если кто ограду открытой ночью оставит...» (В 26), «Если кто, желая бани, помоется один обнаженным...» (В 27), «Но если кто, даже еще сидя в бане, без необходимости смывания грязи обнажит колени или руки...» (В 28). Характерны также и различия в тяжести епитимий: «Если какой мирянин от другой жены породит ребенка, то есть совершит прелюбодеяние, ложе своего ближнего оскверняя, — три года пенитирует...» (В 14), «Однако, если какой мирянин предается разврату содомитским обычаем... - семь лет пенитирует...» (В 15), «Но если кто из мирян предается разврату... с вдовой - один год, если с девицей — пусть два года пенитирует..; однако если не имеет жены, но девственником соединится с девственницей, по благословению родителей пусть будет [она] его женой - до того, однако, пусть год пенитируют и тот и другая, и таким образом пусть соединяются» (В 16), «Но если какой мирянин предастся разврату с животным — пенитирует год, если имеет жену; если, однако, не имеет, - полгода. И так же пенитирует тот, кто, имея жену, собственными руками себя осквернит» (В 17). В целом же: «Болтуна следует наказывать молчанием, неуемного - кротостью, прожорливого - постом, сонливого — бодрствованием, гордого — темницей, покидающего - отвержением; пусть каждый претерпевает точно по своим заслугам, чтобы надлежаще продолжало жить благочестие» (А 12). Примечательно, что являясь древнейшим и особенно авторитетным в континентальной Западной Европе пастырским руководством по наложению церковных наказаний, «Пенитенциал св. Колумбана», дошедший до нас в двух кодексах Туринской национальной библиотеки: С. V. 38 (ІХ или Х в.) и С. VII. 16 (ІХ, Х или ХІ в.), тесно связан по духу как с предшествовавшим ему аналогичным сочинением св. Финниана, основавшего ок. 520 г. монастырь Клонард (Clonardum, Abbatia Clonardensis, Ленстер) и обучавшего там св. Комгалла (вышеупомянутого наставника св. Колумбана), так и с другим, более поздним ирландским пенитенциалом св. Куммиана. В то же время он сам стал, в свою очередь, основой для создания иных покаянных книг уже в галльском регионе, например, «Бургундского пенитенциала» («Poenitentiale Burgundense»), «Боббийского пенитенциала» («Poenitentiale Bobbiense») и др.
Своей неутомимой деятельностью Колумбан оказал значительное влияние на процесс христианизации европейского континента, развития там церковной жизни и пенитенциарной системы, превращения основанных как самим ирландским святым, так и его непосредственными и заочными учениками аббатств в важнейшие центры духовной и светской культуры (считается, что только из монастыря Люксёй вышли шестьдесят три миссионера и учредили свыше ста новых обителей в Западной и даже Центральной Европе). Так, например, монах из Люксёя св. Деикол, считающийся братом св. Галла, получивший образование еще в Бангоре и покинувший его вместе с самим св. Колумбаном, основал аббатство Люр (Luterhaa, Luthra, Франш- Конте) близ Безансона; и другой насельник из Люксёя, св. Урсицин, тоже основал обитель, названную позднее его именем - монастырь Св. Урсицина (Сент-Урсан, Monasterium Sancti Ursicini, Гельвеция) близ Делемона (Дельсберга). Вышеупомянутого св. Евстахия Люксёйского сам св. Колумбан направил «к бойям, которых ныне называют баварцами (ad Boias, qui nunc Baioarii vocantur)», и тот в 617 г. вместе со св. Агилом основал монастырь Вельтенбург (Monasterium Veltenburgense, Нижняя Бавария) близ Регенсбурга; обратив многих язычников и вернувшись в свою обитель, св. Евстахий вновь послал в Баварию «разумных мужей», продолживших там его начинание. Однако такой ученик св. Евстахия, как св. Аудомар — ок. 640 г. вместе со св. Бертином, св. Момелином и св. Эбертрамном — основал монастырь в другой части Европы, который позднее стал называться аббатством Св. Бертина (Сен-Бертин, Abbatia Sancti Bertini, Артуа), вокруг коего вырос город Сент-Омер, чье имя возникло уже непосредственно от имени самого св. Аудомара.
Далее, выходцами из Люксёя были основаны: монастыри Ставело (Stabulum, Льеж) и Мальмеди (Malmundarium, Льеж) близ Вервье — в 647/648 г. просветителем Арденн св. Ремаклем, будущим епископом Маастрихта (652—663); живущее под руководством общины ирландских монахов «в соответствии с нормой Отцов, господина Бенедикта и господина Колумбана (secundum normam Partum, domni Benedicti et domni Columbani)» аббатство Св. Мавра (Маурсмюнстер [Maursmiinster], Мармутьё [Marmoutier], Abbatia Sancti Mauri, Эльзас) близ Страсбурга — в 659 г. св. Леобардом; монастырь Дисентис (Desertina, Гельвеция) у истоков Рейна близ Иланца — в начале VIII в. св. Сигисбертом. Тогда же, в начале VIII в., на рейнском острове Хонау близ Страсбурга было основано аббатство Св. Михаила (Abbatia Honauensis, Monasterium Sancti Michaeli), которое в дипломах Карла I Великого (768—814) само фигурирует как «церковь скотов» (ecclesia Scottorum), или «монастырь скоттов» (monasterium Scottorum), а его насельники — как «странники-скотты» (peregrini Scottorum); а еще раньше, в VII в., монахи св. Колумбана из Боббио основали монастыри Помпозу (Pomposa, Monasterium Sanctae Магіае, Романья) близ Феррары и Бруньято (Bruniatum, Abbatia Bruniatensis, Лигурия) близ Специи.
