Именно руга и являлась, по-видимому, основным источников существования насельниц монастыря в XVI веке. Данных о наличии у монастыря земельных вотчин и других недвижимых имуществ в этот период нет.
XVII век. Новый этап в бытовании монастыря наступает в конце XVI- начале XVII века, и связан он с переходом в Введенский девичий монастырь четвортой супруги Царя Иоанна IV, Анны Алексеевны Колтовской, в иночестве Дарии. «Царица-инокиня энергично принялась за устроение монастыря. Была возведена каменная церковь Введения Б.М. и другие постройки… Средства отпускались из царской казны». [3, с. 187]
В результате монастырь бурно растет. В 1604 году царица Дарья писала царю Борису Годунову: «… У Введения пречистой Богородицы… 45 стариц», т.е. мы можем отметить рост числа насельниц монастыря более чем в четыре раза. В Указе 22 июля 1604 года Борис Годунов пишет: «…мы царицу старицу Дарью пожаловали- книги к ней велели послать…и отца ея духовного черного попа Данила и стариц пожаловали, велели им денежное и хлебное жалование ругу дати… Пашню в деревнях Нижнем изсаде и Заболотье, а также деревню обжину Филисью Гору». [4, c. 182-186]
Таким образом, к началу XVII века во Введенском монастыре в качестве источника дохода. Помимо руги, появляются земельные владения.
Самой ранней из известных описей Введенского монастыря, является опись, датированная 1620 годом, то есть уже после шведского разорения. О том состояние монастыря через семь лет после нашествия шведских и литовских войск, опись монастыря 1620 года свидетельствует: «Пречистые бдцы на тихвине дечь мнстрь стоит на старинной на объжной тихвинской земли древни нижнего иссаду а в мнстре церковь каменная введения престые бдцы да два предела николае чудотворец да кирила белозерский да 5 келеи а в них блаженные памяти Гдря цря и великаго князя Иоанна Васил,евича всеа россии црца инока Дарья Алексеевна с старицами а церковное и монастырское строение строено при црцы иноки Дарии Гдревою казною и в 121 году (1613) немецкие и литовские люди тот мнстрь выжгли и церковь разорили и тот храм покрытъ изнова и келии строят внове после войны немецких и литовских людей црца инока Дар,я своею казною да за мнстремъ три места дворовые церковного причету да за мнстрем же у црцы в црицыне дворе с ей лудми вместе ненашенные бобыли…пашни пахотные мнстрские четверть с полуосминою да перелогом 3 чети без полуосмины в поле а в дву потомуж сена ставитца 3 копны да к мнстрю ж дано пустошь что была дрвня Заболотье а в неи 2 места дворовые аристка сидорова да ивашка киприянова дворы пожгли и скот побили немецкие и литовские люди в прошлом 121м году а аристко от немецкого и литовского разорения обнищал сошел безвестно в прошлом во 122 году». [5, c.9-10] Согласно описи, в монастыре к 1620 году есть земельные владения и покосы. Восстанавливается каменный храм, восстановлено пять келий. Все это- за счет средств Царицы Дарии. В то же время дворы монастырских крестьян сожжены, а большая часть людей покинула Тихвин и монастырскую слободку.
Как писал об этом периоде в жизни монастыря И. Мордвинов, «Первый царь из династии Романовых, Михаил Федорович, с уважением относившийся к царице-игумении назначил ей царское жалование и оказал монастырю щедрую помощь деньгами и строительными материалами. Быстрому восстановлению монастыря в немалой степени способствовали доходы с рыбной ловли на Волхове и с вотчины под Устюжной с пахотными и прочими угодьями. Все это было пожаловано царем игумении Дарии в личное владение. Через пять лет Введенский монастырь выглядел еще лучше, чем до шведского нашествия.
Незадолго до смерти игумения Дария составила «духовную грамоту», по которой передавала монастырь своей преемнице игумений Агафии. Грамота эта представляет собой своего рода отчет о деятельности бывшей царицы во славу Божию: «Мне шло царское жалование, – пишет игумения, – и что доходишки имела с вотчинишки и мы тем питалися и после разорения Литовского в монастыре в храмах устроено, и кельи, и житницы, и мельница, и конюшенной двор. И коровей, поповские и служебниковы дворы и всякое монастырское строение теми деньгами устроено». Из документа явствует, что управляемый игуменией Дарией монастырь составлял единое целое, куда входили и храмы, и хозяйство, и вотчинные владения. Обитель получала от правительства определенное денежное содержание, так называемую «ругу», кроме того, монастырь имел известные доходы от вотчинного хозяйства, а также от треб. Как и полагалось, игумения Дария оставила деньги на «помин души», завещав после своей смерти распределить немалую по тому времени сумму – 120 рублей – между храмами и монастырями вплоть до Новгорода. 5 апреля 1626 года игумения Дария, приняв схиму, скончалась». [6]
К 1647 году, когда монастырь был описан в следующий раз, хозяйство монастыря восстанавливается, растет число его насельниц: «Пречистые Богородицы на Тихвине девичь монастырь стоит на старой и на объжной на тихвинской земле, а в монастыре церковь каменная Введения Пречистые Богородицы да два придела Николы Чудотворца да Кирила Белозерского, а в монастыре келья игуменская да двадцать келей, а в них живут старицы да черной поп. Да за монастырем в слободке во дворе поп Микита Кузмин сын, у него дети Федька да Гаврилка да Якушка да Ивашко; во дворе дьякон Ивашко Микитин сын; во дворе казенной швец Евсейко Иванов сын; да монастырских детенышев: во дворе Васка Иванов сын Белоног; во дворе Максимко да Егупко Андреевы дети Кохнова; двор пуст Онисимко Евсевьева сын; да у святых ворот изба, а в ней живет сторож Никитка Иванов сын свечник, да у других ворот сторож Онтипко Михеев; да на мельнице два мельника Ивашко Никитин да Мишка Петров сын; да бобылей во дворе Ивашко Дмитриев сын Капуста с племянником с Ивашком Семеновым сыном Коковцевым, во дворе Якушко Иванов сын Мартинов; во дворе Илюшка Лукьянов сынъ кузнец, у него брат Петрушка Васильев сын, У Илюшки зять Афиногенко Мартемьянов сын; во дворе служка Тимошка Мартемьянов; двор конюшенной, а в немъ живут конюхи Пахомко Терентьев сын да Трошка Малафеев сын да два коровника Омоско Микитин сын да Савостьянко Федоров сын. У него дети Савостьянко да Парфенко; двор пустъ бобыля Ромашка Евдокимова сына Чмутова, а он сбежал в нынешнем во 155 году безвестно. Того ж монастыря в вотчине деревня Заболотье (7 душ муж) деревня Гостево в Юрьевичах; двор монастырской Деревня Загорье.. деревня Бурково; деревня Селище; деревня Борки; деревня Часовенская; деревня Падихина на реке на Тихвине, а в ней живут монастырские рыбные ловцы…; деревня Осоево (5 душ); И всего Тихвина девича монастыря в вотчине тринадцать дворов крестьянских, людей в них тридцать человек; да восемь дворов бобыльских, людей в них двадцать человек. И обоего крестьянских и бобыльских двадцать один двор и людей в них пятьдесят человек. Да тово ж девича монастыря слободка, а в ней служних два двора, а людей в них тож, да три двора детенышевы, а в них четыре человека, да три двора бобыльских. Людей в них шесть человек, и обоево служних и детенышев и бобыльских восем дворов, а людей в них двенадцать человек». [7, c. 1-12]
Монастырь обладает значительными земельными владениями, мельницами, у стен монастыря выросла значительная слободка, во владениях монастыря проживают десятки крестьянских семей.
Как отмечает И. Мордвинов, рассматривая вопрос о том, кем были в миру инокини и послушницы Введенского женского монастыря в XVII веке, «… в Введенском монастыре пострижены матери, сестры и другие родственницы монахов Большого Монастыря….». [8]
При этом в течении всего XVII века у Введенского монастыря идут бесконечные тяжбы о земельных владениях, рыбных ловлях и прочих владениях с Тихвинским Большим (Успенским) монастырем: «Запись по земельному делу Большого и Введенскаго монастырей. (1650г.) Се за Успения Прчитые Брцы и чудотворнаго Ея образа одегитрии Тихвина мнтря игуменъ семион да келарь старец селиверст з братьею что в прошломъ 156-мъ году был у насъ спор введенского тихвина двча мнтря сыгуменьею Евранеею да старицою Леонидою да старицою княжною Александрою Гагариных с сестрами о старинной их манастырской земли и о сенных покосах подле введенского ручья и в купленной их вотчине в юрьевичах на реке на рыбеже от рыбежна озера вниз по реке по рыбеже по левую сторону и о той земле и о сенных покосех и о пожне ланех что мы пожню называли своего тихвинского манастыря пожнею равдинным игуменья Евранея с сестрами на нас Гдрю Црю и великому князю Алексею Михайловичу всеа русии били челом…». [9, c. 120-121]