Ученый рекомендовал употреблять для окулировки только хорошо приспособленный инструмент. Для надреза коры он советовал применять маленькие острые ножички, а для отворачивания ее - плоские костяные. Сам Андрей Тимофеевич производил прививку и инструментами собственной конструкции.

Большинство из правил, разработанных Болотовым, не устарело и поныне.

Андрей Тимофеевич указывал, что если подвой не достаточно «сочен и свеж», то следует ограничить его собственный рост для того, чтобы больше питательных веществ направлялось привою. С этой целью сразу же после прививки нужно удалить верхушку подвоя. Он писал также, что весной следующего года ствол подвоя необходимо срезать на вершок выше прививки и место среза замазать садовой смолой. Ученый также отмечал, что если на подвое ниже прививки появятся отпрыски, их следует удалить.

Самый ответственный период, по мнению Болотова, наступал, когда было необходимо приступить к формированию крон у молодых яблонь.

Он писал: «Мудрость в том не великая и нужно только спознакомиться короче со свойствами яблоней и груш и знать тот порядок, каким натура обыкновенно производит из них сучья, так прочее само собою оказываться начнет; ибо все дело состоит в том, чтоб, пользуясь сим знанием, натуре делать вспоможение и ее принуждать производить сучья там и такие, какие нам надобны, а не там и не такие, какие она по течению своему обыкновенно производит».

Андрей Тимофеевич считал, что этот прием необходим для получения хорошего урожая, и критиковал хозяев, которые не применяли его, боясь неправильной обрезкой испортить деревья. Вместе с тем ученый предупреждал, что для хорошего выполнения этой операции нужны аккуратность, сноровка и любовь к делу.

Он писал: «Обрезывание яблоней и груш достойно производимо быть не попросту без затей и по пословице говоря, как зря, но с хорошим и прилежным рассмотрением, и потому оное хотя и сопряжено с несколькими хлопотами и искусство сие не всякий садовник знает, но зато оно для охотника всего приятнее и увеселительнее быть может...» Андрей Тимофеевич в своих работах разъяснял, что у деревьев существуют ростовые и плодовые почки. Не все они развивают новые побеги в одном и том же году, некоторые из них остаются спящими. Обрезав побеги определенным образом, можно принудить спящие почки тронуться в рост и образовать нужную крону (по высоте и направлению). Если обрезку на молодой яблоне производить в течение 2-3 лет, она будет иметь кудрявую шарообразную крону. Это позволит дереву использовать солнечное освещение более рационально. Кроме того, отмечал ученый, регулированием закладки плодовых веток можно добиться более равномерного распределения плодов по скелетным сучьям.

Болотов, изучая формирование кроны у яблони, сделал интересные выводы. Он установил, что в годы с хорошим урожаем под тяжестью плодов обламываются чаще всего сучья, отходящие от дерева под острым углом. Учитывая это обстоятельство, Андрей Тимофеевич рекомендовал при формировании кроны удалять побеги «с узкой развилкой», а оставлять - отходящие под углом ближе к прямому.

Это важное открытие Болотова и в наше время принимается во внимание при формировании крон плодовых деревьев.

Куда бы ни приезжал Болотов, везде он не только закладывал новые сады, но и предпринимал меры по улучшению старых. Заводить же новые сады, когда старые запущены и дают плохой урожай, ученый считал варварством. Он подчеркивал, что в запущенных садах земля покрывается дерном, почва уплотняется и изолирует корневую систему деревьев от атмосферного воздуха. Ученый писал, что для получения хорошего урожая необходимо содержать почву рыхлой и очищенной от травы. Для этого Болотов рекомендовал содержать междурядья сада в виде черного пара или занимать их овощными культурами, требующими обработки.

Он писал: «А сколь облужалая земля не только для молодых садов, но и для самых старых плодовитых дерев вредна, того довольно изобразить не можно. Всякому примечательному охотнику до садов не трудно самому усмотреть великую разницу между растущими на облужалой и растущими в паханой, или по крайней мере в копаной земле. В сей последней всякое дерево растет и скорее и веселее, чище и здоровее; а при том и самых плодов приносит более и в лучшей доброте... По которой [рицине при всяком садоводстве за наиважнейшее правило почитать бы надлежало, чтоб отнюдь под плодоносными деревьями не терпеть никакого дерна и облужалого грунта».

Во времена Андрея Тимофеевича среди садоводов были широко распространены различные приемы искусственного принуждения яблонь и груш к более раннему плодоношению. Особенно это практиковалось по отношению к деревьям, выращенным из семян (они, как правило, приступали к плодоношению позднее привитых). Часто эти приемы заключались в грубом повреждении тканей деревьев вроде окольцовывания или надрезания коры, надрубания ствола, просверливания отверстий.

Болотов относился к этим приемам скептически. По его мнению, скороспелость яблонь - это «их натуральное свойство», и поэтому принуждать деревья к более раннему плодоношению, да еще такими варварскими способами, значит, заранее обрекать их на плохую продуктивность в будущем, а может быть и на полную гибель.

Нетерпеливым хозяевам, которые спешили поскорее увидеть плоды своего труда, Болотов советовал, подбирать при закладке сада специальные сорта, приходящие «скоро, часто и со многим плодом». Более верным способом ускорить наступление плодоношения у сортов позднеспелых по природе, ученый считал создание для них таких условий роста и развития, которые бы способствовали более раннему созреванию.

Впрочем Болотов протестовал только против таких искусственных приемов ускорения начала плодоношения, которые калечили растения. Он сам в ряде случаев применял искусственные примеры к тем яблоням, которые по каким-то причинам задерживались с плодоношением. Но Андрей Тимофеевич делал это, основываясь на знании биологических закономерностей процессов роста и развития деревьев.

Он излагал это так: «Вертеть, резать и другое делать - не диковинка, не диковинка и перепортить, а не надобно ли наперед знать, на что это все делают и какой собственно перемене должно произойти от таковых предприятий? Не надобно ли наперед рассмотреть все натуральное происхождение и обстоятельства, вникнуть в собственные причины, производящие плодородие и не плодородие яблоней, измерить действия насилий, нами им чинимых, и по тому же судить, достаточны ли они к поспешествованию первого, а к уничтожению последнего, и будет нет, то тогда уже помышлять далее о изобретении лучших способов».

Один из изобретенных им способов заключался в том, что на сучья яблонь, у которых было нужно ускорить наступление плодоношения, с помощью веревок навешивались грузы (чаще всего камни, завернутые в тряпки или обвязанные лыками). Результат своего опыта Болотов описывал так: «В сей первый год не было ничего. Яблонь моя была такова же неплодородна, как и до того времени, и я более ничего не приметил, кроме того, что побеги на ней были в сей год короче, да и меньше уже оных было. Но на другой год, к великому удовольствию моему, яблонь сия усыпана была множеством плода».

Окрыленный неожиданным успехом, Болотов не замедлил повторить опыт уже на нескольких деревьях. И снова не плодоносившие яблони стали приносить плоды.

Ученый писал: «... с того времени не только сия яблонь стала почти всякий год приходить с плодом, но и другие, с которыми я повторил сей опыт, меня таким же хорошим успехом обрадовали и довели до того, что я с того времени со всеми упрямыми яблонями и грушами то же делал и за упрямство их наказывал сим наказанием, и могу сказать, что я всегда и получал успех вожделенный».

Андрей Тимофеевич не только провел успешный эксперимент, но и дал ему научное обоснование. Он писал, что камни своей тяжестью вынуждают ветви яблони сгибаться дугой. При этом верхняя сторона коры растягивается, а нижняя сморщивается. И в том и в другом случае происходит сдавливание сосудов, нарушающее сокодвижение и «...сок, не имя уже прежней свободности течь безостановочно вдоль по суку до самых концов ветвей, принужден уже, разделясь по побочным сучьям, влезать в плодоносные и приуготовлять почку к предбудущему году».