Японский знак государственной принадлежности — хиномару (дословно «знак солнца») использовались как армейской, так и морской авиацией с самого начала их существования. Знак помещался в шести основных позициях: на верхней и нижней поверхности обоих крыльев и на бортах фюзеляжа. В морской авиации эта схема просуществовала до конца войны без каких-либо изменений. В армейской авиации в начале 1938 года перестали наносить хиномару на бортах, оставив их только на крыльях. Причина этого шага до сих пор не известна, можно только предположить, что это сделали для того, чтобы можно было быстро отличить армейские самолеты от морских во время совместных операций. В феврале 1942 года армейцы снова стали наносить хиномару на борта самолетов. Однако до конца войны встречались машины, несущие «восходящее солнце» лишь на крыльях. Цвет хиномару был красным (FS *1086). Со временем он терял блеск, выцветал и становился ржаво-розовато-коричневым (FS *1328). Сильнее выцветали хиномару, расположенные на верхних поверхностях крыльев и на бортах фюзеляжа.

Первоначально на самолетах Ки-43 хиномару наносили только на крылья. Центр «солнца» находился в 1,5 метра от конца крыла. В диаметре круг имел 1,1–1,2 метра, или 3/4 ширины крыла в данном месте. Иногда на нижней поверхности крыла хиномару наносили ближе к фюзеляжу, помещая центр знака в 2,5 метрах от конца крыла. Центр хиномару всегда располагался в центре крыла, считая его ширину вместе с закрылками.

На бортах хиномару появился лишь у Ки-43-II. Центр знака находился в 3,6 метра от заднего конца самолета (4/10 длины). По высоте центр приходился примерно на середину борта, диаметр знака 0,7 метра. Одновременно изменилось место расположения хиномару на крыльях. Теперь центр знака помещался в 2,1 метра от конца крыла (у Ки-43-II крылья были короче, чем у Ки-43-I), а его диаметр увеличился до 1,4 метра. Другими словами, край хиномару отлежал от края крыла на расстоянии диаметра знака. Появление заводского камуфляжа не изменило расположения и размеров знака.

Полевой камуфляж наносили так, чтобы не закрыть готовые знаки. Иногда можно заметить разницу в качестве хиномару и полевого камуфляжа. Бывало и так, что камуфляж не доходил до, «солнца» и чистый металл создавал эффект окантовки. С весны 1942 года хиномару наносили вручную на бортах тех самолетов, где их не сделали на заводе. Положение и размер знаков в этом случае мог колебаться в значительных пределах. Обычно импровизированные хиномару были заметно меньшего диаметра.

В июле 1943 года объединенный штаб морской и армейской авиации (Коку Хомбу) издал инструкцию, регламентирующую камуфляж и опознавательные знаки самолетов. Инструкция содержала в себе образцы камуфляжа и хиномару. В числе прочих нововведений, предписывалось наносить на переднюю кромку крыла от фюзеляжа до середины (отмеряя от продольной оси самолета) желтые полосы быстрой идентификации (FS *3538). Иногда полосы делали оранжевого цвета. Такие полосы появились уже в середине 1942 года. Кроме того, официально вводилась белая кайма вокруг хиномару на верхних поверхностях крыльев и бортах фюзеляжа. Кайма должна была иметь ширину 75 мм и добавлялась к диаметру знака, независимо от его первоначального размера. В армейской авиации инструкцию часто «творчески» переосмысливали, изменяя размеры в зависимости от типа самолета. Ки-43 часто имели кайму на хиномару чуть ли не за год до опубликования инструкции. Позднее кайму стали делать на заводе, однако до конца выпуска попадались экземпляры с хиномару без каймы. После появления заводского камуфляжа официально отменили кайму на бортовых хиномару, но вопреки приказу кайма имелась на многих машинах. На крыльях кайму практически никогда не делали.

В боевых частях, дислоцированных в Японии до середины 1942 года, хиномару обычно помещали на фоне белого пояса, нанесенного вокруг фюзеляжа и крыльев. Это были полосы быстрой идентификации, облегчавшие опознание своих самолетов с земли. Кроме того, такая полоса напоминала государственный флаг Японии. Ширина пояса была на 20 см больше диаметра хиномару. Такие полосы имели почти все самолеты, особенно тщательно правило соблюдалось ближе к концу войны. Лишь на самолетах, поступивших в части в 1945 году, такие полосы отсутствовали.

Другой характерной деталью самолетов армейской авиации в конце 30-х годов была белая полоса, наносимая на фюзеляж непосредственно перед хвостовым оперением. Во многих книгах эту полосу называют «боевой полосой» (combat stripe), служившей для отличия боевых машин от машин второго эшелона (транспортных, учебных, прототипов и т. д.). Однако в японских источниках такие подробности отсутствуют. Можно лишь утверждать, что появление полосы у хвоста по времени совпадает с отказом от нанесения хиномару на бортах фюзеляжа. После того, как хиномару снова стали изображать на бортах, от использования «боевой полосы» постепенно отказались. Мы ограничимся утверждением, что «боевая полоса» часто встречалась на Ки-43, особенно в первые месяцы его использования.

Дарственные надписи, так называемые хококу или аикоку, делались на самолетах, подаренных ВВС Японии частными лицами или общественными организациями. Армейской авиации самолеты дарили гораздо реже, чем авиации морской. Надписи делались вдоль обоих бортов фюзеляжа черными иероглифами высотой примерно 50 мм. На самолетах с темным камуфляжем надпись делали на фоне желтой или белой полосы. Надпись делалась иероглифами кандзи («Хо-Коку Дай» или «Аи-Коку Дай»), затем следовал номер дарственной и имя/название дарителя. Особого упоминания заслуживают Ки-43, переданные правительству Манчжурии (Манчжуко). Эти самолеты несли на крыльях хиномару, сделанные в маньчжурских цветах. Иногда на бортах фюзеляжа имелись патриотические лозунги, индивидуальные для каждого самолета.

Большинство внутренних поверхностей самолета, включая внутреннюю сторону щитка стойки шасси, внутренние поверхности закрылков, элеронов и рулей, и др., покрывались бесцветным защитным лаком. Иногда, в лак добавляли немного пигмента, чтобы можно было зрительно контролировать качество покрытия. Обычно добавляли зеленый или сине-зеленый пигмент. Это создавало эффект цвета металик, так как дюраль просвечивал через лак. В японской литературе этот эффект называется «аодаке» или «аодаке иро». Самолеты, выпущенные в конце войны, уже не имели лакового покрытия.

Кабина пилота изнутри окрашивалась светло-оливково-зеленой (FS *4255) или серо-зеленой (FS *4226) краской. У самолетов поздних выпусков применялась также серо-коричнево-желтая (FS *3448) краска. Обычно краской закрашивалась и приборная доска. У самолетов поздних серий доска могла быть черного цвета. Кабина под фонарем и за спиной пилота красилась черным цветом или красно-коричневым (у машин поздних серий). Отдельные органы управления, размещенные в кабине, были черные или темно-зеленые. Рычаги и переключатели (например ручка выпуска-уборки шасси) были красные. Регуляторы шага винта и состава топливовоздушной смеси — желтые, штурвал черный или темно-зеленый. Каких-либо доказательств использования цветной маркировки мы не имеем. Можно предположить, что с 1944 года окраске кабины стали придавать меньшее значение, а в конце войны от окраски внутренних деталей отказались совсем.

Единственным официальным идентификатором сентаев, а также большинства учебных частей, докурицучутаев и других нерегулярных отрядов, был номер. Номер не имел какого-либо дополнительного значения, а просто указывал на конкретную часть. Некоторые сентаи за выдающиеся заслуги получали собственные имена. Другие части носили неофициальные традиционные названия. Основные авиашколы номеров не имели, а назывались по месту своей дислокации.

Большинство сентаев и других частей имели эмблему, которую изображали на хвостовом оперении или, реже, на бортах фюзеляжа. Японские эмблемы весьма экзотичны и заслуживают отдельного рассказа. В большинстве своем эмблемы представляли собой стилизованные номера частей, причем в качестве основы использовались как арабские цифры, так и традиционные цифры кандзи и даже римские цифры. Эмблемы по начертанию были очень простые, но создавались с таким полетом фантазии, что часто лежали уже на границе с ребусами. Иногда вместо номеров в основу эмблемы клали традиционные японские геральдические мотивы, мифологических персонажей, природные или географические объекты. Иногда (особенно часто в летных школах) эмблема представляла собой стилизованное начертание названия части, выполненное знаками кандзи или катаканы. Некоторые сентаи время от времени меняли эмблемы, известен пример, когда часть в течение четырех лет пять раз меняла эмблему.