Однако, не смотря на внутреннюю тягу к учебе, первые два курса дались очень тяжело. Сказывались болезни школьной поры и физическое отставание от товарищей по учёбе, которые загоняли Алексея в тяжелейшие условия жизни. Чтобы не быть отчисленным из училища по состоянию здоровья, ему приходилось постоянно скрывать свои частые недомогания что, конечно же, сказывалось на рабочем тонусе и качестве усвоения преподаваемых им дисциплин.

Но к счастью большое волевое и физическое напряжение не вылилось в тяжёлый стресс, а лишь оказало мобилизующее влияние на характер и организм молодого человека.

В конце концов, болезни удалось перебороть, и Алексей включился в процесс поглощения наук с удесятерённой энергией. Именно тогда он, пожалуй, впервые понял и реально ощутил силу сформированного родительским воспитанием и внешними условиями своего характера, которая позволила ему без лишней робости браться за выполнение самых невероятных заданий, планов и успешно их решать.

Последние курсы пролетели как один день. До того они были насыщенными и интересными. Курсантам читали специальные предметы по их будущей специальности, что было чрезвычайно интересно, преподаватели и командиры-воспитатели уже относились к ним как будущим офицерам, а на практике они выполняли функции младшего офицерского состава.

И вот на пятом курсе им всем, наконец-то было присвоено воинское звание «мичман», с получением права свободного выхода в город в увольнение, библиотеку или на спортивные соревнования.

С получением звания появилось чувство старшинства над остальными курсантами и ответственности за их судьбу и судьбу училища.

После выпуска из училища в звании инженера-лейтенанта Алексей Юрьевич Савин попал в один из лучших научно-исследовательских институтов страны — Институт теоретической кибернетики.

Это была настоящая школа жизни, оазис талантливых и неординарных людей.

Тогда в конце шестидесятых, и особенно в семидесятых годах, в СССР происходило бурное развитие оборонной науки, сравнимое с революционными преобразованиями.

Институты оснащались вычислительной техникой нового поколения, совершенствовалась экспериментальная база, была развёрнута система подготовки специалистов высочайшей квалификации. Институт теоретической кибернетики (позднее НИИ АС НИИ автоматических систем) не только не стоял в стороне от процессов мощного роста научного потенциала, он очень быстро завоевал лидирующие позиции в мировой оборонной науке в области авиационного вооружения.

Многие совершенные по тем временам проекты и идеи были рождены именно в стенах этого ставшего уникальным научного учреждения. Многие из ученых института были лауреатами Ленинских и Государственных премий. Ордена и медали украшали парадные костюмы не только мужчин, но и женщин, которые не терялись в когорте маститых сотрудников.

Огромные экспериментальные залы вмещали в себя кабины самолётов, вертолётов, образцы интеллектуального оружия и казались величественными космическими аппаратами из мира научной фантастики. Мощная вычислительная база, обеспечивающая исследования, была соизмерима со всем парком вычислительных машин Академии наук Советского Союза. Большое внимание уделялось отбору и подготовке молодых специалистов, чьё обучение начиналось ещё со старших классов средней школы.

Костяк сотрудников составляли выпускники Московского авиационного института, Московского физико-технического института, Московского университета и Московского высшего технического училища им. Н.Баумана.

К мнению института прислушивались и гражданские руководители и военные, а без заключения НИИ АС оружие просто не допускалось к испытаниям. В связи с этим частыми гостями института были различные крупные партийные, государственные и военные руководители, что придавало еще больший вес его работам и способствовало упрощенному решению организационных проблем, а так же вопросов связанных с материально-техническим обеспечением.

Особо следует сказать о военном представительстве, осуществлявшем контроль работ института, в котором после учебы проходил службу Алексей Юрьевич Савин.

Подобных коллективов и школ подготовки высококвалифицированных и преданных своему военному призванию офицеров он в своей дальнейшей службе уже нигде не встречал. Традиции творчества, ответственного отношения к делу, профессиональной смелости, постоянного поиска оптимизированных решений, заложенные руководителями военной приёмки В.П. Купцовым, В.А. Пресняковым, В.Г. Смирновым, живы до сих пор.

Алексею Юрьевичу посчастливилось служить в то время, когда эти традиции только формировались и оттачивались. Профессиональные и жизненные уроки, полученные в военном представительстве, впоследствии послужили не только хорошей стартовой площадкой для его карьерного и личностного роста, но и составили надёжный базис в системе изнуряющей психологической, интеллектуальной и физической нагрузки, которая легла на плечи Алексея во время работы в Генеральном штабе Министерства обороны.

Они же во многом оказали помощь и в процессе многих организационных и политических коловратностей, куда Алексей Савин оказался вплетён, попав в опасную близость к переплетению политических интриг и событий, происходивших в стране.

Безусловно, тайны «подковёрной» борьбы постигались не в военном представительстве. Но способность к мобилизации в напряжённые периоды и умение просчитывать множество вариантов развития событий закладывалась именно здесь. Ведь ответственность командиров за исход важных испытаний и судьбу многих проектов, выходящая, порой, за рамки обычного понимания, в какой-то степени распространялась и на него, заставляя прикладывать большие усилия и концентрировать волю для достижения необходимого результата.

Именно служба в военном представительстве дала ему возможность увидеть мир с самых неожиданных для сторон. Суметь сформировать собственное миропонимание и даже занять в современной мировой гуманитарной науке определённое положение.

Но самое главное, что он смог ощутить себя не безликим винтиком в глобальных процессах всеобщего развития, а дерзнуть на их представление в контексте своего собственного участия, равно и как участие любого другого человека в необратимом созидательном природном движении к ноосферному миропорядку (по В.И.Вернадскому).

Этот вывод для Алексея Савина стал, пожалуй, едва ли не самым важным в его жизни. Он смог дать ощущение космического полёта, бессмертия и способности сотворения невозможного по обычным обывательским меркам.

В научно-исследовательском институте он проработал 16 лет, закончил аспирантуру по кафедре системного анализа (теория вероятностей, теория игр, исследование операций, анализ больших систем и др.), написал ряд научных работ по развитию боевой авиации. Но сразу защитить диссертацию не удалось, так как А.Ю. Савин принял предложение занять должность старшего офицера Управления вооружения, Министерства обороны СССР.

Безусловно, ему было бесконечно жалко уходить из военного представительства и института, к которым он «прикипел» всей душой. К тому же Алексей Юрьевич хорошо понимал, что ни в каком другом месте уже не найдет такого созвездия талантов. Но ему, как военному человеку был необходим служебный рост, и, ощущая открывающуюся пред ним особую перспективу, Алексей Юрьевич Савин решительно перешёл на новое место службы.

С переходом на работу непосредственно в Министерство обороны в жизни Алексея Юрьевича Савина начались события, которые впоследствии не только привели его к вершинам военной власти, но и позволили создать уникальную в своем роде специальную часть 10003.

Вот как сам Алексей Юрьевич в своих дневниках рассказывает об этих днях своей жизни.