До сих пор мы принимали каноническое объяснение происхождения масонства и возникновения его связи с тамплиерами, которое более или менее хорошо увязывается с историческими событиями и существующими документальными свидетельствами. Но существуют и другие версии, гораздо дальше заходящие в своем эзотеризме.

Доисторическая мегалитическая культура отмечена строительством первых в истории человечества каменных памятников, и поэтому она была колыбелью первых каменщиков. Теория, которая до сих пор не опровергнута, утверждает, что эти примитивные сообщества обладали знаниями, принадлежащими разным областям науки, возможно, полученными от мифических допотопных цивилизаций, таких как Атлантида и Аркадия. Недавно появилось предположение, что в эпоху мегалитов астрологи и каменщики формировали особую герметическую касту, и магическая сила, которую давали им эти знания, не покидала ее пределов. Их способность предсказывать движения небесных тел и смену времен года казалась удивительной их современникам, поскольку позволяла им выбирать время сева и сбора урожая или предвидеть дожди, то есть обладать основными данными, необходимыми для того, чтобы сообщество прогрессировало и чтобы планировать ежедневную деятельность. Эта каста жрецов-ученых построила из камня несколько астрономических обсерваторий, например в Нью-Грейндже и Стоунхендже. Представляется очевидным, что, чтобы избежать разглашения секретов, они должны были включить каменщиков в свою элиту или, по крайней мере, заключить с ними союз.

Так называемая Книга Еноха, найденная в Кумране среди Свитков Мертвого моря, содержит описание научных принципов, использовавшихся в каменных обсерваториях, которые в ней называются «орудиями Уриеля». Известно, что «подлинные» масонские ложи связывают свое происхождение и традицию со Свитками Мертвого моря. Жрецы эпохи мегалитов, вероятно, предвидели столкновение кометы с Землей в 3150 году до н. э. и эмигрировали на Восток, унеся с собой свои тайные знания. Книга Еноха рассказывает, что комета действительно врезалась в нашу планету, вызвав ужасное наводнение, которое известно нам под именем Всемирного потопа.

Как говорится в одном из Свитков Кумрана, которые удалось расшифровать, многие члены братства каменщиков пережили катастрофу и сохранили свои тайные знания, передав их некоторым мудрым евреям, потомкам Ноя. Они были взяты за основу при создании мистериального культа саддукеев, который послужил нитью, связующей допотопную мудрость с родом царя Давида. Когда в 70 году н. э. римляне изгнали из Иерусалима жрецов-саддукеев, последним удалось спрятать свои документы и реликвии под развалинами Храма Соломона. Их потомки, предшественники масонов, которые, вероятно, и были рыцарями, основавшими в 1099 году Орден тамплиеров, по-видимому, раскрыли Великую Тайну. Для того чтобы тамплиеры возродили масонское братство, просуществовавшее не одну тысячу лет, было необходимо только, чтобы орден был запрещен и подвергся гонениям в начале XIV века.

Масонство сохраняет великое множество изображений и гравюр, которые сообщают о строительстве Храма Соломона в 945 году до н. э. каменщиками из города Тир. Некоторые авторы, основываясь на этом факте, возводят происхождение масонского братства к финикийским сектам, владевшим секретами искусства каменного строительства. Однако обработка камня в ту эпоху уже была известна многим культурам и цивилизациям, например: грекам, римлянам и византийцам. У древних египтян символом истины и справедливости был угольник, инструмент, который наравне с циркулем является универсальным масонским символом. Конфуций за 500 лет до Рождества Христова говорил о благе действовать «по угольнику», этот термин также использовал Аристотель, чтобы обозначить правильные действия. Однако было бы абсурдно считать их масонами, несмотря на то что угольник и циркуль были важнейшими инструментами, использовавшимися средневековыми каменщиками (maçons).

После того как легендарный король Англии Ательстан в 926 году н. э. поработил другие более мелкие британские королевства, он объединил самых искусных мастеров каменного дела в Масонскую Традицию Йорка, освященную Королевской Хартией. Этот документ позволял каменщикам собираться раз в году, и, похоже, что в число их обязанностей входил контроль над строительством многочисленных аббатств, замков и крепостей. Важность роли, которую Ательстан отводил масонам, отражается в самых в разных документах той эпохи, таких как поэма «Региус» и некоторые древние рукописи. Существуют также неоспоримые свидетельства того, что в Шотландии оперативные масонские ложи действовали начиная с 1057 года и что английские ложи, продолжавшие традицию Ательстана, получили официальное признание около 1220 года. Вскоре ложи, общества или товарищества, как их называли во Франции, а затем и во всей материковой Европе, распространились повсеместно. Их официальной функцией было находить ответственных и работоспособных каменщиков, способных выполнять амбициозные пожелания суверенов и церковных сановников. В ту эпоху, за исключением короля и духовенства, никто не мог себе позволить свободно перемещаться по Англии. Также были сильно ограничены средства связи. Масоны должны были разработать свои собственные формы контроля, позволявшие им избежать обмана и присутствия непрофессионалов в своих рядах, не прибегая к поездкам от одной постройки к другой. Тем не менее они обычно свободно получали подорожные для тех братьев, которые должны были следить за возведением двух и более конструкций одновременно. Все вышесказанное относится к области чистых спекуляций, многие историки вообще отрицают, что в Англии, в отличие от Шотландии, существовало организованное масонство. Любопытным образом, так называемый Шотландский обряд был создан много веков спустя, в 1737 году, во Франции группой шотландских масонов, бежавших под предводительством Эндрю Рэмзи.

Чтобы понять причины возникновения и историю шотландского масонства, необходимо вернуться к истории тамплиеров. Существует предположение, что, когда деятельность ордена была запрещена, некоторые рыцари морским путем добрались до земель на севере Великобритании, которые только что получили независимость под руководством Роберта Брюса, по причине чего он был отлучен от Церкви. Как мы увидим ниже, тамплиеры искали убежища, относительно безопасного от Ватикана и Инквизиции, чтобы продолжить исполнение своего плана. Несомненно, они привезли с собой свои сокровища, реликвии, тайны и ритуалы, что подтверждается документами, найденными в Росслинской часовне.

В 1583 году король Шотландии Яков VI (ставший затем Яковом I Английским) назначил Уильяма Шоу Главным Начальником строительных работ. Пять лет спустя Шоу выпустил свои знаменитые статуты, в которых определялись права масонов его ложи. В них же вводились санкции за некачественные постройки и налагался запрет на производство работ неквалифицированными масонами. Во вторых статутах от 1599 года Шоу впервые и все еще в завуалированной форме упомянул присутствие тайных знаний в каменных произведениях масонов. Также именно этот устав предписывал ложам вести письменный учет всех произведенных работ и собираться по крайней мере раз в году, введя в ритуал инициации Искусство Памяти.