Первый этап построения НСКС позволил начать работы по внедрению интегрированной системы электронного документооборота органов исполнительной власти и интеграции их веб-сайтов Единого веб-портала центральных органов исполнительной власти, создать условия для использования IP-телефонии и системы видеоконференцсвязи. Структура СИТС создаётся с учетом мирового опыта создания подобных систем и представляет собой транспортную магистраль для обеспечения защищённого доступа к государственным информационным ресурсам.

В 2006 году СИТС была создана в Киеве. Её инфраструктура позволила обеспечить функционирование автоматизированных систем, в которых циркулирует информация, как с ограниченным доступом, так и открытая информация, которая является собственностью государства. Также был организован доступ к единому веб-порталу, предполагается развёртывание системы видеоконференцсвязи и ресурсов ЦАЗИ, Центра сертификации ключей и предоставления ряда других услуг.

НСКС создала предпосылки и осуществила реальную возможность обеспечения защищённого обмена информацией с помощью механизмов электронно-цифровой подписи (далее — ЭЦП), реализованных с помощью Центра аутентификации НСКС — государственного аккредитованного центра сертификации ключей.

В НСКС с помощью криптографических, технических и организационных средств обеспечен обмен конфиденциальной информацией органов государственной власти (более 30 абонентских пунктов) и органов местного самоуправления. В плане оборудования абонентскими пунктами защищённой связи объектов критической инфраструктуры, в том числе предприятий атомной энергетики.

Указом Президента № 627 от 8 июня 2004 года ДСТСЗИ возглавил полковник Бойко Константин Владимирович.

Согласно распоряжения Кабинета Министров № 405-р от 24 сентября 2005 года «О создании специальной сети сотовой связи НСКС» разворачивание сети возложено на УСС. Наиболее реальным вариантом реализации этого проекта станет создание провайдера, который будет предоставлять услуги мобильной связи на базе существующих «GSM» — сетей.

Для защиты информации в НСКС планируется использовать только отечественные средства КТЗИ. Телекоммуникационное оборудование, которое планируется использовать в НСКС, может быть и отечественным, и импортным, но должно отвечать требованиям по обработке конфиденциальной информации, пройти обязательную экспертизу по вопросам защиты информации и получить соответствующее экспертное заключение.

В НСКС создаются сети сотовой и транкинговой радиосвязи, абоненты которых имеют возможность взаимодействовать между собой и с абонентами сетей стационарной связи НСКС в «закрытом» режиме (режиме шифрования), а также с абонентами сетей связи общего пользования в режиме открытой связи.

Планируется дальнейшее развитие специальной сети сотовой связи, модернизация стационарного телефонного компонента НСКС, развитие сети централизованного защищённого доступа органов государственной власти и местного самоуправления к ресурсам сети Интернет, создание единого защищённого информационного хранилища государственной информации.

Разработываются и внедряются средства КЗИ НСКС (защита цифровых потоков, многофункциональные средства защиты информации, средства абонентского засекречивания).

В конце 2005 года руководство ДСТСЗИ провело встречу с представителями отечественных средств массовой информации, впервые допустив журналистов в помещение, где функционируют коммутационные системы НСКС.

«Изюминкой» встречи с прессой была презентация ДСТСЗИ образцов мобильного терминала, который прошёл технические испытания в рамках создания в Украине специальной сети сотовой связи. Предварительные подготовительные этапы длились уже более трёх лет. На первом этапе были разработаны нормативные акты, которые определяли организационные основы, порядок создания и функционирования сети на базе ресурсов одного из отечественных операторов мобильной связи Украины.

Длительными были исследования собственно средств, которые могут обеспечить необходимый уровень защиты и качественного воспроизведения информации. Специалисты изучали параметры различных моделей мобильных аппаратов, прежде чем выбрали базовый образец, который впоследствии был конструктивно дополнен криптоалгоритмом (определённым украинским стандартом), обеспечивающим конфиденциальность телефонных разговоров.

Первые образцы защищённого мобильного терминала были созданы на базе импортной модели, содержавшая в себе самые современные технологические новации. Поэтому планируется выпуск отечественного аппарата. В перспективе неактуальной будет привязка к одному оператору мобильной связи. Аппаратами конфиденциальной сотовой связи смогут пользоваться не только органы государственной власти, но и другие юридические и физические лица.

Кроме того, журналистов допустили в «святую святых» — помещения, где функционировали коммутационные системы Государственной системы ПС Украины. Во время короткой экскурсии журналистам рассказали, на чём основывается надежность и безопасность систем специальной связи, защиты государственных информационных ресурсов в сетях передачи данных.

У корреспондентов была возможность почувствовать поступь технического прогресса, сравнив вид и масштабы оборудования, смонтированного в 1980-х годах прошлого века и современную технику, которая является сегодня «мозгом» так называемой «сотки» (АТС-100), обеспечивающей защиту телефонных разговоров руководителей государства.

Тем не менее при наличии современной автоматизированной цифровой техники на случай чрезвычайных ситуаций предусмотрен резервный ручной коммутатор П-209. С его помощью самые опытные специалисты с помощью прямых или резервных каналов ПС, почти мгновенно принимая решение, соединяют высших должностных лиц государства с требуемыми абонентами.

Конечно же журналисты, придирчиво наблюдая, как дежурный оператор «ворожит» над штекерами и кнопками, сразу же поинтересовались, не сможет ли телефонистка подслушать секретный разговор. Им тут же было продемонстрировано, что телефонный сигнал направляется только в одном направлении, а технический посредник в лице оператора с момента начала разговора автоматически от него изолируется и практически не может услышать разговор абонентов.

Кстати, вопрос прослушивания линий ПС благодаря политикам и их «консультантам» в период президентского правления В. А. Ющенко приобрело в Украине такой резонанс, что привело в конечном результате к выделению ДСТСЗИ из СБУ и созданию самостоятельной государственной службы.

Постановлением от 14 мая 2015 года № 303 Кабинета Министров утвердил «Положение о структуре НСКС и условиях ее использования для обеспечения безопасности обмена информацией».

НСКС базируется на собственных специальных телекоммуникационных системах и комплексах технических средств, использует ресурсы телекоммуникационной сети спецназначения и в случае необходимости ресурсы телекоммуникационных сетей общего пользования.

НСКС состоит из таких обособленных информационно-телекоммуникационных систем связи:

1) специальная транспортная сеть НСКС, предназначена для транзита трафика между системами НСКС;

2) специальные информационно-телекоммуникационные системы субъектов НСКС;

3) специальная сеть мобильной связи НСКС;

4) специальная информационно-телекоммуникационная система защищенной видеоконференцсвязи НСКС;

5) система защищенного электронного документооборота НСКС;

6) система защищенного доступа государственных органов к Интернету НСКС.

Создание и обеспечение функционирования систем НСКС осуществляется для:

1) обеспечения обмена открытой, служебной и конфиденциальной информацией между субъектами и/или абонентами систем НСКС и ее защиты;

2) создания технологической основы для интеграции распределенных информационных ресурсов в информационных системах, в которых циркулирует открытая и служебная информация органов госвласти и органов местного самоуправления, военных формирований, госорганов, государственных предприятий, учреждений и организаций;