В единстве стран фашистского блока стали намечаться все более ощутимые трещины, а отношения СССР с союзниками укреплялись. Свидетельство тому – договоренности об открытии второго фронта и послевоенном сотрудничестве трех держав, достигнутые на Тегеранской конференции 1943 г.
1943 год ознаменовался дальнейшими успехами советского оружия. С августа по декабрь были освобождены половина территории Украины, ряд крупных промышленных центров в России и Белоруссии, включая Орел, Таганрог, Брянск, Смоленск, Новороссийск и Гомель. В следующем году, учитывая безусловное превосходство над противником, перед Красной Армией Верховным Главнокомандованием были поставлены задачи проведения крупных операций по всему фронту. Для наступления Генштабом были определены десять направлений, которые стали называться сталинскими ударами. В ходе их осуществления была полностью снята блокада Ленинграда, освобождены Украина, Одесса, Севастополь и весь Крым, Карелия и Молдавия, созданы предпосылки для выхода советских войск на территорию стран Восточной Европы. Война приблизилась к границам рейха и его сателлитов. Последний, десятый, удар в 1944 г. Красная Армия нанесла по захватчикам силами войск Карельского фронта и Северного флота в советском Заполярье.
После высадки армий союзников во Франции и выхода англо-американских войск к оборонительному немецкому валу, так называемой «линии Зигфрида», гитлеровская Германия была вынуждена воевать на два фронта. Боевой дух солдат вермахта и войск стран-сателлитов значительно упал. Постоянные и все усиливающиеся бомбежки городов, проводившиеся авиацией союзников, не добавляли оптимизма и сеяли панику среди немецкого населения, которое в большей степени стало испытывать все тяготы и невзгоды, вызванные войной. В декабре 1944 г. в Германии принимаются чрезвычайные законы в отношении «перебежчиков», согласно которым те приговаривались к смертной казни, а их семьи и родственники подвергались репрессиям. Главари рейха жестоко расправились с участниками заговора и покушения на Адольфа Гитлера, в числе которых оказались не только подпольщики, но и видные государственные и военные деятели: бывший руководитель Абвера Канарис, бывший посол в СССР Шуленбург, полковник Штауфенберг и др.
На тайном фронте противоборства соотношение сил все ощутимее склонялось в пользу антигитлеровской коалиции. Однако спецслужбы фашистской Германии оставались грозным противником, по-прежнему направляя основные усилия в своей подрывной работе против СССР.
Армейские чекисты полностью владели ситуацией, своевременно улавливали все изменения в поведении противника и его тактических действиях по подрыву Красной Армии и тыла. Об этом свидетельствовали регулярные доклады В.С. Абакумова в Государственный Комитет Обороны, Генштаб, СНК и другие высшие инстанции, директивы и приказы ГУКР «Смерш» НКО СССР, отчеты, сообщения органов военной контрразведки с фронтов.
В 1943–1944 гг. объекты разведывательно-диверсионных устремлений немецкой разведки на театре военных действий оставались прежними: штабные учреждения, войсковые резервы, места их сосредоточения. Немцев интересовали сведения о группировках советских войск, наличии укреплений и аэродромов, снабжении армии, коммуникациях к линии фронта и др. Однако при этом противник усилил заброску на советскую территорию качественно новых агентов и диверсантов, более тщательно подготовленных для действий в прифронтовой полосе и в тыловых районах СССР. Предпочтение отдавалось враждебно настроенным к советской власти агентам из числа белогвардейцев, националистов, членов профашистских организаций, предателей и изменников, карателей, пособников, уголовных элементов, зарекомендовавших себя практической работой в пользу рейха. Органы «Смерш» столкнулись с фактом использования немцами в качестве диверсантов специально обученных в Германии агентов-подростков, которые при задержании должны были называть себя эвакуированными беспризорниками.
Начиная с 1943 г. противник стал интенсивнее забрасывать свою агентуру через линию фронта на самолетах. При отступлении германских войск в тылу Красной Армии противником оставлялись агентурные группы, отдельные агенты-диверсанты со специальными заданиями, а также связанное с ними или действовавшее самостоятельно враждебное националистическое подполье.
С 25 октября по 1 декабря 1944 г. органами «Смерш» Действующей армии в расположении частей советских войск и на освобожденной территории было арестовано 776 агентов германской разведки и контрразведки, сброшенных на парашютах или оставленных немцами при отступлении.
В июле 1944 г. органами «Смерш» был захвачен зондерфюрер Эрвин Брониковский-Герасимович, который в качестве инструктора разведоргана при ставке германского военного командования объезжал резидентуры, оставленные при немецком отступлении на советской территории. Он был известен смершевцам как заместитель начальника Борисовской разведшколы, а затем школы радистов в местечке Нидерзее. Во время допроса Брониковский назвал 36 агентов, которые забрасывались в районы Москвы, Калинина (Твери), Тулы, а также были оставлены в Литве, Западной Белоруссии и Западной Украине. Используя эти сведения, чекисты арестовали 27 из них, а остальных объявили в розыск, причем некоторые из перевербованных агентов успешно использовались в радиоигре из района Москвы.
При осуществлении подрывной деятельности немецкие спецслужбы, не снижая активности на фронте и в прифронтовой полосе, все чаще стали переносить свои акции в глубокий тыл Советского Союза. В первую очередь, их интересовали все виды коммуникаций, промышленные предприятия и другие хозяйственные объекты, имевшие важное значение для обороны страны. В частности, уже со второй половины 1943 г. для сбора сведений о военной промышленности и о политико-моральном состоянии населения шпионы-радисты германской разведки забрасывались с задачей проникновения в Чкалов (Оренбург), Челябинск, Иркутск, Ташкент, Молотов (Пермь), Рязань, Свердловск (Екатеринбург) и Горький (Нижний Новгород).
Противник также обратил повышенное внимание на национальные районы СССР, где им были запланированы мероприятия по провокации вооруженных выступлений в тылу. Немцами были осуществлены переброски вооруженных отрядов и групп в Калмыкию, Казахстан, на Северный Кавказ, в Крым, а для распространения идей так называемого Национально-трудового союза нового поколения (НТСНП) – в Орловскую и Брянскую области. Эти формирования были ликвидированы совместными контрразведывательными и чекистско-войсковыми операциями территориальной контрразведки органов НКГБ, ГУКР «Смерш» НКО СССР и НКВД СССР.
Имели также место попытки установления местонахождения лагерей военнопленных для организации массовых выступлений. Кроме того, агентура врага постоянно получала задания по организации убийств офицерского состава армии и чекистских органов.
Летом 1944 г., по результатам проверки состояния розыскной работы на фронтах и в военных округах, в Москве собралось совещание начальников вторых отделов и отделений по розыску. На нем было определено, что данные оперативные мероприятия являются прерогативой не только этих подразделений «Смерш», но и всех оперативных сотрудников военной контрразведки. Подготовленную осенью 1943 г. Инструкцию по организации розыска агентуры разведки противника следовало знать всему оперативному составу. При этом особое внимание армейских чекистов было обращено на составление и использование специальных алфавитных списков, фотоальбомов и сборников с указанием биографических данных и примет разыскиваемых вражеских агентов, ориентировок по разведывательным органам, а также на применение опыта смершевцев-розыскников. Для оказания практической помощи по розыску на фронты выезжали помощники-направленцы начальника ГУКР «Смерш» и другие ответственные работники главка, а руководящие сотрудники фронтовых и армейских аппаратов – в корпуса, дивизии, бригады и другие соединения.
В феврале 1944 г. В.С. Абакумов докладной запиской в ГКО рапортовал И.В. Сталину об издании «Сборника материалов об органах германской разведки, действующей на советско-германском фронте». Он предназначался в помощь контрразведчикам-розыскникам, а также для информирования командующих и членов военных советов фронтов, армий и военных округов. В апреле 1944 г. в органы «Смерш» был разослан аналогичный сборник об органах финской военной разведки.