В 1956 году 20-й съезд КПСС сделал «теоретический» вывод о том, что социализм обеспечивает условия для полноценного развития и расцвета наций. Реализуя эти теоретические измышления, были проведены реформы управления экономикой. Тем не менее, центральные министерства и ведомства СССР контролировали более 80% промышленности Литвы. Как и прежде, не только важнейшие политические, но и экономические вопросы решались не в Вильнюсе, а в Москве. Поэтому Руководство ЛССР поддержало предложения по децентрализации управления советской экономикой, высказалось за расширение полномочий органов исполнительной власти в надежде, что эти меры помогут более оперативно и эффективно решать экономические проблемы и укрепят авторитет партийных деятелей ЛССР и их положение в иерархии партийной номенклатуры СССР. С другой стороны, руководители различных экономических предприятий и организаций, среди которых становилось все больше неравнодушных к делам своей страны литовцев, были заинтересованы в расширении прав министерств и других государственных учреждений. В 1956-1957 годах сложились относительно благоприятные условия для осуществления экономического самоуправления, поскольку тогдашнее руководство СССР выступало за определенную децентрализацию управления экономикой и расширение полномочий властей республик и других региональных единиц СССР.

Церемония открытия Каунасской гидроэлектростанции. Каунас, июль 1959 года.
В целях усиления местной экономической инициативы в 1957 году руководство Советского Союза приняло решение о создании региональных экономических советов вместо Министерств промышленности и строительства — управление промышленностью и строительством должно было перейти от отраслевого к территориальному. Это также означало повышение роли административных органов республик. Однако Хрущев отметил, что в деятельности всех органов управления и хозяйственных организаций необходимо сохранить приоритет государственных интересов СССР. В новых экономических условиях может стать очевидной тенденция к автаркии, так называемому регионализму и национальному эгоизму, поэтому роль Госплана СССР и Министерства финансов должна возрасти для обеспечения планового управления советской экономикой.
Восемь союзно-республиканских министерств и два республиканских министерства были упразднены. 443 предприятия, на которых производилось около 80% всей продукции, производимой в Литве, и было занято 76% всех рабочих, были переданы Народным экономическим советам (УИК). За семь лет работы PEC промышленное производство Литвы увеличилось в 2,3 раза, а национальный доход — в 1,8 раза. В стране развивались не только традиционные, но и новые отрасли промышленности — химическая, точное машиностроение, электроника и т.д. В 1955 году было начато строительство Каунасской гидроэлектростанции, которая в период с 1960 по 1962 год начала поставлять электроэнергию в Литву. Компания Elektrėnai Электростанция была построена в 1965 году. Производство электроэнергии увеличилось более чем вдвое, достигнув почти 4 миллиардов киловатт-часов в год. Начались поставки природного газа в Литву. Капитальные затраты в Литве достигли 2,5 миллиарда рублей, или в 2,3 раза больше, чем за весь послевоенный период до 1958 года. Однако экономическая система была ориентирована на потребности СССР (военно-промышленный комплекс и т.д.), и вся прибыль поступала центральному правительству, но впоследствии часть ее возвращалась в виде инвестиций.
В целом в эпоху Хрущева и в последующие годы Литва довольно быстро подвергалась индустриализации и урбанизации по советской модели, и в Литву были инвестированы огромные средства из бюджета Советского Союза (сформированного также из средств Литовской ССР). Индустриализация проводилась с использованием неэффективных, отсталых советских технологий, а производство потребительских товаров не соответствовало требованиям мирового рынка. Низкое качество продукции и закрытость советской экономической системы привели к тому, что экономика Литвы оказалась изолированной от мировой экономики. Из-за отсталых технологий, на основе которых развивались энергетическая и химическая промышленность, советской «гигантомании» и отсутствия достаточного внимания к охране окружающей среды экологические проблемы становились все более актуальными. Без установки водоочистных сооружений загрязнение крупнейших рек Литвы увеличивалось с угрожающей скоростью, грунтовые воды и атмосфера были загрязнены.
В своих стратегических военных планах кремлевское руководство оценивало Литву не только с экономической, но и с геополитической и военной точек зрения. Самый быстрый способ добраться до Западной Европы пролегал через Литву и Калининградскую область, кроме того, незамерзающие порты Клайпеда и Калининград также были важны, Москву меньше интересовало направление Скандинавии. Поскольку средства, вложенные в экономическую инфраструктуру Литвы, были связаны с военными целями, руководство СССР само было заинтересовано в развитии экономики Литвы. В АдминистрацияLSSR должна была рационально использовать предоставленные ей ресурсы, и она справилась с этой задачей. Вынужденный рост советской промышленности сделал Литву зависимой от инвестиций Советского Союза, особенно в сырье. Это полностью соответствовало военным и другим интересам Москвы, но не реальным потребностям литовского населения.
Производительные силы развивались и развертывались с учетом государственных интересов СССР. Быстрый промышленный рост был достигнут в основном за счет развития производства средств производства (например, производство машин за семь лет увеличилось в 4,4 раза). Однако индустрия потребительских товаров не удовлетворяла потребности населения ни по количеству, ни по качеству, ни по ассортименту. Многие товары легкой и пищевой промышленности были отправлены в СССР: в 1965 году продукция легкой промышленности (трикотаж, обувь, текстиль и т.д.) составляла 27,6% от общего объема производства. Крупнейшие города СССР, включая Москву и Ленинград, были основными потребителями продуктов питания. Средства на потребительские товары распределялись централизованно, и на литовский рынок поступало слишком мало продовольственных и промышленных товаров. ЛССР руководство критиковало эту ситуацию, но в принципе ничего не могло изменить. Тем не менее, в магазинах Литвы, в отличие от городов России, за исключением Москвы и Ленинграда, всегда были основные продукты питания и продукция легкой промышленности. Жители соседней Беларуси приезжали в Вильнюс даже днем, чтобы сделать покупки, а туристы из остальной части СССР забирали или отправляли по почте значительное количество продуктов.
За несколько десятилетий облик Литвы изменился до неузнаваемости. В Литве никогда раньше не было такого промышленного скачка или потрясения промышленности (велось масштабное строительство промышленных, общественных и жилых объектов, был развит мощный энергетический сектор, построены тысячи километров новых дорог и т.д.). Снечкус часто утверждал в Москве, что финансирование Литвы было необходимо по политическим и пропагандистским причинам — Запад должен был видеть разницу между Литвой «времен Сметоны» и «Советской Литвой». С другой стороны, пытаясь добиться различных средств и лимитов в Совете Министров СССР, Шумаускас сказал, что деньги, вложенные в Литву, окупятся быстрее, чем в других республиках. На самом деле, хотя на Литву постоянно оказывалось давление с целью добиться запланированных результатов раньше запланированного срока, обязательства в целом были выполнены.
В 1959 году после политической атаки ЦК КПСС против «прибалтийских региональных узколобых и националистических тенденций» в Москве все громче звучали требования обеспечить требуемый централизм в новых экономических условиях и планирование в национальной экономике, а также необходимость повышения роли политики Государственного планового комитета по всему СССР. Планирование и управление централизованной социалистической экономикой, основанной на государственной собственности и бюрократическом управлении, не дали желаемых результатов. В конце 1950-х — начале 1960-х годов экономическое развитие СССР замедлилось. Чрезмерные советские амбиции в области освоения космоса, гонка вооружений и масштабные инвестиции в новые отрасли промышленности способствовали замедлению экономического роста. Это полностью противоречило публично объявленным планам Хрущева к 1970 году не только догнать, но и превзойти США по общему уровню производства и объему производства на душу населения.