Подготовка к МРТ
Если не указано иное, то перед обследованием МРТ разрешается принимать пищу и лекарства. Обычно вас просят убрать вещи, которые могут повлиять на получаемое изображение, например:
Ювелирные украшения
Заколки для волос
Очки
Часы
Парики
Протезы
Слуховые аппараты
Бюстгальтеры на косточках
Косметику, содержащаю металлические частицы
Как проходит МРТ?
Во время теста
Вы ложитесь на подвижный стол, который продвигается в аппарат МРТ. Технолог следит за вами из другой комнаты. Вы можете говорить с человеком через микрофон.
Если у вас есть страх замкнутых пространств (клаустрофобия), вам могут дать успокоительное. Большинство людей легко переносят процедуру.
Аппарат МРТ создает сильное магнитное поле вокруг вас, а радиоволны направлены на ваше тело. Процедура безболезненная. Вы не чувствуете магнитное поле или радиоволны, и вокруг вас нет движущихся частей.
Во время МРТ-сканирования внутренняя часть магнита производит повторяющиеся постукивания, удары и другие шумы. Современные апараты обладают встроенной системой шумоподавления.
В некоторых случаях контрастный материал, как правило, гадолиний, будет вводиться внутревенно. Контрастный материал усиливает определенные детали. Гадолиний редко вызывает аллергические реакции.
МРТ может длиться от 15 минут до часа. Вы не должны двигаться, чтобы изображение не получилось размытым.
Во время функциональной МРТ вас могут попросить выполнить ряд небольших задач – например, двигать большим пальцем или отвечать на простые вопросы. Это помогает точно определить части вашего мозга, которые контролируют эти действия.
После теста
Вы можете возобновить свою обычную деятельность сразу после сканирования.
Результаты магнитно-резонансной томография
Подготовленный для интерпретации данных МРТ специалист (рентгенолог), проанализирует полученные при сканировании изображения, и сообщит о результатах. Ваш врач обсудит с вами следующие шаги.
Глава 2: Предварительная обработка изображений
2.1 Загрузка и отображение МРТ снимков
При работе с медицинскими МРТ снимками важно знать, как загрузить и отобразить их с помощью OpenCV. Мы рассмотрим основные шаги для загрузки МРТ снимков в формате DICOM (Digital Imaging and Communications in Medicine) и их отображения на экране. DICOM является стандартом для обработки, хранения и передачи медицинских изображений, и многие МРТ снимки используют этот формат.
Для загрузки и отображения МРТ снимков в формате DICOM с использованием библиотеки OpenCV вам понадобятся следующие шаги:
1. Установка библиотек: Убедитесь, что у вас установлена библиотека OpenCV. Вы можете использовать пакетный менеджер вашей операционной системы или установить OpenCV вручную.
2. Загрузка DICOM файлов: DICOM файлы медицинских изображений обычно представлены в виде серии файлов, хранящихся в одной директории. Вам потребуется функция для загрузки DICOM файлов. В Python вы можете использовать библиотеку pydicom для чтения DICOM файлов. Вот пример кода для загрузки серии DICOM файлов:
``` python
import os
import pydicom
def load_dicom_series(directory):
dicom_files = [os.path.join(directory, file) for file in os.listdir(directory) if file.endswith(".dcm")]
dicom_files.sort() # Сортируем файлы в правильном порядке
slices = [pydicom.dcmread(file) for file in dicom_files] # Чтение DICOM файлов
return slices
```
3. Извлечение данных из DICOM файлов: DICOM файлы содержат метаданные и пиксельные данные снимков. Вы можете извлечь пиксельные данные, а также другую информацию, такую как интенсивность окна, положение и ориентацию снимков. Вот пример кода для извлечения пиксельных данных из DICOM файлов:
``` python
def extract_pixel_data(dicom_slices):
pixel_data = [slice.pixel_array for slice in dicom_slices] # Извлечение пиксельных данных
return pixel_data
```
4. Отображение МРТ снимков: После извлечения пиксельных данных вы можете использовать функции OpenCV для отображения снимков. Примените масштабирование и настройте цветовую карту в соответствии с вашими потребностями. Вот пример кода для отображения МРТ снимков с использованием OpenCV:
``` python
import cv2
def display_images(images):
for image in images:
cv2.imshow("MRI Image", image)
cv2.waitKey(0)
cv2.destroyAllWindows()
```
Это основные шаги для загрузки и отображения МРТ снимков в формате DICOM с помощью OpenCV. Вы можете настроить код в соответствии с вашими потребностями, например, добавить функции обработки изображений или изменить способ отображения.
2.2 Улучшение контрастности и яркости
Часто МРТ снимки могут иметь низкую контрастность или неравномерное распределение яркости, что затрудняет их анализ. В этом разделе мы рассмотрим различные техники улучшения контрастности и яркости изображений с использованием OpenCV. Мы изучим методы гистограммного выравнивания, адаптивного эквализации гистограммы и применение фильтров для улучшения качества изображений.
Для улучшения контрастности и яркости МРТ снимков с помощью OpenCV можно использовать следующие методы:
1. Гистограммное выравнивание (Histogram Equalization): Гистограммное выравнивание является методом, который распределяет интенсивности пикселей по всему диапазону яркости для получения лучшей видимости деталей. В OpenCV вы можете использовать функцию `cv2.equalizeHist()` для применения гистограммного выравнивания. Вот пример кода:
``` python
import cv2
def enhance_contrast_histogram(image):
image_equalized = cv2.equalizeHist(image)
return image_equalized
```
2. Адаптивная эквализация гистограммы (Adaptive Histogram Equalization): Адаптивная эквализация гистограммы позволяет улучшить контрастность и яркость изображений с учетом локальных особенностей. Вместо глобального преобразования гистограммы, она разделяет изображение на небольшие блоки и применяет гистограммное выравнивание к каждому блоку независимо. В OpenCV вы можете использовать функцию `cv2.createCLAHE()` для создания объекта адаптивной эквализации гистограммы, а затем применить его с помощью функции `apply()` к изображению. Вот пример кода:
``` python
import cv2
def enhance_contrast_adaptive(image, clip_limit=2.0, tile_grid_size=(8, 8)):
clahe = cv2.createCLAHE(clipLimit=clip_limit, tileGridSize=tile_grid_size)
