В 1888 году открывается кафедра при Московском университете, которой с 1891–1902 года руководил создатель крупной научной школы клинико-физиологического направления – Нил Фёдорович Филатов. Он впервые выделил и описал ветряную оспу и скарлатинозную краснуху, выявил ранний признак кори на слизистой полости рта. Его лекции, записанные и изданные учениками, многократно переиздавались. В 1885 году в Санкт-Петербурге создаётся первое в России научное общество детских врачей под руководством Н. И. Быстрова, в 1892 г. – аналогичное общество в Москве под руководством самого Филатова.
В России формирование научной гигиены проходило во второй половине XIX века и одним из её основоположников был профессор Алексей Петрович Доброславин (1842–1889). В 1871 году он стал инициатором открытия первой в России кафедры гигиены, экспериментальной лаборатории в Петербургской медико-хирургической академии. Он является автором первых отечественных учебников по гигиене. В 1878 году Доброславин основывает Русское общество охранения народного здравия и издаёт журнал «Здоровье».
Вторая в России кафедра гигиены была создана в 1882 году в Московском университете и её возглавил профессор Ф. Ф. Эрисман (1842–1915 гг.): его деятельность заключалась в области общественной санитарии, практическом участии в разработке водопровода и канализации Москвы, обследование фабрик и заводов Московской губернии.
Середина 19 века стало временем расцвета российских медицинских школ. В области терапии особое место занимали две научные клинические школы: школа С. П. Боткина, положившая начало экспериментальному направлению в отечественной клинической медицине (в Военно-медицинской академии), и школа Г. А. Захарьина, олицетворявшая искусство клинической практики (в Московском университете). В 1887–1891 гг. усилиями профессоров факультета, медицинской общественностью, благотворительных обществ и меценатов на Девичьем поле (ныне Большая Пироговская улица) был создан Клинический городок, по тем временам один из лучших в Европе как отметили участники XII Всемирного съезда врачей, проходившего в Москве в 1897 году. В этот период в составе факультета были основаны новые институты, такие как фармакологии, гигиены, бактериологии, а также новые кафедры химии и физики, гистологии и эмбриологии, оперативной хирургии и топографической анатомии, общей патологии, гигиены, истории и энциклопедии медицинских знаний. Там же в Клиническом городке создавались научные общества, учреждались научные журналы, организовывались многочисленные научные съезды и конгрессы. Сам этот медицинский комплекс продолжает существовать и в наши дни, являясь крупным медицинским центром Москвы и архитектурным наследием России прошлого.
Стоит также сказать, что в 1803 году при Департаменте полиции Министерства внутренних дел был создан Медицинский совет, который начал основывать и содержать больницы и приюты для инвалидов и сирот вместе с приказами общественного призрения и Медицинскими советами, создававшимися в губерниях. А в 1802 году в Петербурге создано «Императорское человеколюбивое общество» под покровительством вдовствующей императрицы Марии Фёдоровны, в 1816 году – аналогичное общество. В Москве в 1804 году было создано Физико-медицинское общество, в задачи которого входило ведение метеорологических наблюдений, статистики заболеваний, рождаемости и смертности в Москве, изучение профессиональных заболеваний. А вот в 1859 году в Кронштадте было основано Общество морских врачей. Так, на рубеже XVIII–XIX вв. общее количество врачей в Российской империи увеличилось с 1 500 до 8 072, а в 1846 году треть этих докторов работали в армии и флоте7. Уже при императоре Александре Втором, при его реформах медицина в стране получила новое продолжение в плане доступности населению – это развитие земской медицины, которая должна была обеспечить равную доступность медицинской помощи всему населению страны и сотрудничать с фабрично-заводской медициной. А постановлением 1866 года было обязано владельцам промышленных предприятий не только организовывать, но и содержать больницы и амбулатории – тем самым работники предприятий получали медицинское обслуживание во благо своего здоровья.
Начиная с времени правления Петра Первого, первоочередной задачей в России было укомплектование русской армии врачами, и эта задача оставалась основной на протяжении многих десятилетий. На всём протяжении 18 века медицина в армии улучшалась и постепенно пополнялась полевыми врачами, появлялись новые методы лечения раненых. Само первостепенное значение развитие медицины среди армии в итоге оправдало себя при защите Отечества в 1812 году. Лечебно-профилактическая работа в госпиталях, которая развивалась все последние десятилетия, несмотря на исключительные трудности в первый этап Отечественной войны, в течение всей военной кампании была настолько успешной, что привела к весьма значительному возвращению выздоровевших солдат и офицеров в ряды армии. Общее число возвращённых в строй на протяжении Отечественной войны 1812 года колебалось в среднем около 60%, доходя в отдельных, хорошо устроенных группах госпиталей до 77%8. К числу последних выздоровевших и возвращённых в армию относились госпитали, которые находились в ведении (и лично им же были созданы) немецким доктором медицины Христианом Ивановичем Лодером. Лично Лодером были устроены госпитали в Касимове, Меленках и Елатьме, куда эвакуировали всех раненых с поля боя. За медицинскую организацию, лечение русских солдат и личное мужество Христиан Лодер был награждён орденом Святой Анны 2-й степени с бриллиантами. Сама же смертность во всех военных госпиталях в год войны колебалась в пределах 7–17%, что можно сказать о вполне успешной работе военной медицины. Пополнение из числа выздоровевших вливалось в армию на протяжении всего времени, начиная с первого, наиболее тяжёлого периода отступления русской армии. Так, перед сражением под Бородином ряды действующей армии пополнили около 13 000 солдат, вернувшихся из госпиталей. После поражения французов на Березине в наступающие полки влилось, по свидетельству современников, «множество выздоровевших». Приведённые выше сведения о числе возвращённых в строй воинов приближаются к цифрам, сообщённые в своё время генерал-интендантом русской армии Е. Ф. Канкриным: так, из опубликованных им сведений следует, что на конец марта 1814 года из общего числа 133 965 раненых и больных выздоровело 63,3% (84 805 человек), умерло 11,7% (15 748 человек), определилось инвалидами 2,3% (3 177 человек), остальные 29 841 продолжали оставаться на излечении в госпиталях9. Эти данные – наглядное свидетельство состояния и организации медицинской службы и её лечебно-профилактической деятельности, но они не характеризуют, конечно, в полной мере потери, которые понесла русская армия в первую Отечественную войну.
Военная медицина в годы Крымской войны 1853–1856 годов неразрывно связывается с талантливым русским хирургом Николаем Ивановичем Пироговым. В 1855 году во время войны Пирогов был главным хирургом осаждённого англо-французскими войсками Севастополя. Оперируя раненых, Пирогов впервые в истории мировой медицины применил гипсовую повязку, дав начало сберегательной тактике лечения ранений конечностей и избавив многих солдат и офицеров от ампутаций конечностей. Во время осады Севастополя, для ухода за ранеными, Пирогов руководил обучением и работой Крестовоздвиженской общины сестёр милосердия. Это тоже было нововведением по тем временам. Важнейшей заслугой Пирогова является внедрение в Севастополе совершенно нового метода ухода за ранеными. Метод этот заключался в том, что раненые подлежали тщательному отбору уже на первом перевязочном пункте – в зависимости от тяжести ранений одни из них подлежали немедленной операции в полевых условиях, тогда как другие, с более лёгкими ранениями, эвакуировались в тыл для лечения в стационарных военных госпиталях. Поэтому Пирогов по справедливости считается основоположником специального направления в хирургии, известного как военно-полевая хирургия. Кроме этого Николай Пирогов – создатель топографической анатомии и экспериментального направления в хирургии. Его создание топографической анатомии, или метод «ледяной анатомии», занимает важное место: так Россия стала одной из первых стран, где эфирный наркоз получил самое широкое распространение! Научно обосновал этот метод Пирогов ещё в 1847 году, когда он впервые в мире применил наркоз в массовом порядке на театре военных действий. Он провёл наложение первой гипсовой повязки в полевых условиях (1854), высказал идею о костной пластике (1854). В области военно-полевой хирургии Николай Пирогов впервые обосновал и осуществил на практике сортировку раненых на четыре группы: безнадёжные, тяжелораненые, состояния средней тяжести, легкораненые. Послеоперационные больные им были впервые разделены на две группы: чистые и гнойные. Пирогову принадлежит инициатива привлечения женщин для ухода за ранеными в условиях военного театра – это создание института медсестёр. Он стоял у истоков создания земской медицины, выдвинув основные организационные принципы её деятельности.
