Хьюз не говорил супруге Джин, где он. Он часто звонил ей, но отрицал, что живёт в студии у Носсека. Однажды он сказал, что болен, проходит лечение в больнице от недиагностированного заболевания. В конце лета 1958 года Хьюз внезапно вернулся в отель "Беверли Хиллз".

Вернувшись в своё бунгало, в полном уединении, оставаясь один на один со своими навязчивыми страхами, он пережил свой второй, и самый разрушительный, психический срыв. В дополнение к полному пренебрежению личной гигиеной теперь он мочился на дверь ванной комнаты. Хьюз метался в истериках и бессвязно бормотал, оставаясь вне досягаемости для всех. Однажды ночью Хьюзу позвонил его старый знакомый Джек Риал, руководитель авиастроительной компании Lockheed, знавший Говарда двенадцать лет. Двадцать пять часов Хьюз и Риал обсуждали по телефону тонкости работы авиационных двигателей и самолетов. Это стало шаблоном, повторяемым каждую ночь. Техническая болтовня с Риалом стала некой формой, столь необходимой Хьюзу терапии.

Со вторым крахом Хьюз прекратил практически все контакты с внешним миром. Он больше не встречался с банкирами или бизнесменами, не ездил на тайные переговоры. Он нанял Роберта Мехью, человека из ФБР, который был его глазами и ушами, который 12 лет вёл все встречи и переговоры от имени Хьюза. Но Роберт Мехью никогда не видел Говарда Хьюза. Даже женщины были исключены из его повседневной жизни. Он не видел Джин несколько месяцев. И единственная другая женщина в его жизни, Ивонна Шуберт, приходила в бунгало только однажды, 24 декабря 1958 года, в его пятьдесят третий день рождения.

Белое кожаное кресло вернули в отель "Беверли-Хиллз", и Хьюз почти всё время сидел в нём голым в центре гостиной – области, которую он называл “зоной, свободной от микробов”.

Его длинные ноги были вытянуты на соответствующей тахте, обращённой к экрану, он смотрел один фильм за другим. Мебель была отодвинута к стенам, а пол завален стопками старых киноплёнок, журналов и газет. Хотя он редко что-нибудь читал, Хьюз настаивал на получении каждого издания Лос-Анджелесских ежедневных газет. По мере накопления газет помощники складывали их так, чтобы проходы оставались достаточно широкими для одного человека. Каждый день Хьюз кропотливо вытирал салфеткой "Kleenex" пыль и микробы со стула, пуфика, тумбочки и телефона. Иногда он часами методично чистил телефон, перебирал наушник, мундштук телефона, основание и шнур с помощью салфеток, повторяя процедуру чистки снова и снова, бросая использованные салфетки в кучу за креслом.

К этому времени навязчивое поведение Хьюза, страх перед микробами и заражением и ритуалы, которые он придумал, чтобы справиться с этими страхами, доминировали в его жизни. Он продиктовал список меморандумов, направленных на предотвращение “обратного потока” или “обратной передачи” микробов ему.

В одной из трёх страниц меморандума по приготовлению фруктов, он объясняет, как должны быть открыты банки с фруктами, какое оборудование должно быть использовано для этой операции:

✓ 1 неоткрытая газета;

✓ 1 стерильный консервный нож;

✓ 1 большая стерильная тарелка;

✓ 1 стерильная вилка;

✓ 1 стерильная ложка;

✓ 2 стерильные щетки;

✓ 2 кусочка мыла;

✓ стерильные бумажные салфетки.

Шаги для открытия банки с фруктами:

1 шаг: закупка фруктовой банки,

2 шаг: подготовка стола,

3 шаг: мытьё банки,

4 шаг: сушка банки,

5 шаг: обработка рук,

6 шаг: открытие банки,

7 шаг: удаление фруктов из банки,

8 шаг: правила удаления осадка,

9 шаг: заключение операции.

Говард Хьюз подробно описал, как каждый шаг должен был быть выполнен. Если что-то сделано не по правилам, всё должно быть повторено ещё раз.

В шаге № 3 "мытьё банки” он написал:

"Ответственный человек включает кран в ванной, используя для этого голые руки. Он также регулирует температуру воды так, чтобы она не была ни слишком горячей, ни слишком холодной. Затем он берёт одну из щеток и, используя один из кусков мыла, создаёт хорошую пену, а затем очищает банку до точки в двух дюймах ниже верхней части банки. Он должен сначала замочить и удалить этикетку, а затем чистить цилиндрическую часть банки снова и снова, пока не будут удалены все частицы пыли, кусочки бумажной этикетки и в целом все источники загрязнения. Держа банку в центре всё время, он обрабатывает дно банки таким же образом, будучи очень уверенным, что щетина щетки тщательно очистила все небольшие углубления по периметру дна банки. Затем он ополаскивает мыло с цилиндрических сторон и дна банки. Когда фрукты уже выложены на тарелку, убедитесь, что ни одна часть тела, включая руки, не находится непосредственно над банкой или тарелкой в любое время. Если это возможно, держать голову, верхнюю часть тела, руки и т. д. по крайней мере в одном футе от фруктов и стерильной тарелки. Во время процедуры не должно быть абсолютно никаких разговоров, кашля, прочистки горла или каких-либо движений губ".

Чтобы быть абсолютно уверенным, что, за несколькими разрешенными исключениями, никто не вступит в контакт с каким-либо из припасов, хранящихся в соседнем бунгало для его использования, Хьюз издал чёткие приказы:

"Какой бы экстремальной и чрезвычайной не была ситуация, какими бы необычными не были обстоятельства, какие бы могли возникнуть, крайне важно для меня, чтобы никто не входил в любую комнату бунгало, ванную комнату или любые другие места, которые использованы для хранения любых вещей, которые используются для меня: продукты, техника, журналы, бумажные материалы, бумажные салфетки, несмотря ни на что. Для меня не менее важно, чтобы никто никогда не открывал дверь или двери в любую комнату, шкаф или гардероб, или что-нибудь, где хранятся мои вещи, даже на одну тысячную дюйма, на одну тысячную секунды. Я не хочу, чтобы пыль, насекомые или что-то в этом роде проникло внутрь".

Пример ещё одной, из многочисленных инструкций для обслуживающего персонала:

"… используйте стопку из шести или восьми салфеток Kleenex, вытащенных по одному из щели коробки, касайтесь дверной ручки через эту стопку салфеток, чтобы открыть дверь в ванную комнату. Дверь должна быть оставлена открытой, так что ничего не нужно будет трогать, выходя из ванной. Такой же сноп Kleenex может быть использован для того, чтобы повернуть дальше водопроводный кран и получить хороший напор тёплой воды. Эти бумажные салфетки должны быть уничтожены. Сноп от шести до восьми салфеток должен быть использован, чтобы открыть шкаф, содержащий мыло. Использовать только свежий кусок мыла, который никогда не был открыт. Все салфетки, использованные до этого момента, должны быть утилизированы. Руки должны быть вымыты с особой осторожностью, гораздо более тщательно, чем когда-либо прежде, прилагая большие усилия, чтобы руки не касались сторон раковины, кранов или чего-либо в этом процессе. Большую осторожность следует также проявлять при установке мыла на мыльницу или что бы там ни было, чтобы гарантировать, что руки не соприкасаются ни с чем. Стопка от пятнадцати до двадцати свежих Kleenex должна находиться рядом, чтобы выключить кран, и Kleenex затем должен быть выброшен".

5 апреля 1976 года Говард Хьюз умер в самолете при перелёте из Мексики в Хьюстон. Достоверных причин смерти не было установлено при вскрытии. Ему было 70 лет. Его многомиллиардная империя осталась без завещания. По информации, опубликованной в биографических изданиях, Хьюз выглядел ужасающе. Его вес составлял чуть более 40 кг, а волосы и ногти были невероятной длины. Его руки все были исколоты иглами от инъекций. Как минимум последние 30 лет Говард Хьюз самостоятельно делал себе инъекции из большого количества таблеток кодеина и каждый день принимал по 6 таблеток валиума.

Его империя была расформирована и распределена среди огромного количества его близких и дальних родственников [15].