Межмолекулярные взаимодействия с участием мономеров представляют собой энергетические взаимодействия. Они разделяются на универсальные и специфические. Универсальные межмолекулярные взаимодействия, называемые также ван-дер-ваальсовыми, совершаются между любыми молекулами. Они подразделяются на ориентационные, т.е. диполь-дипольные, индукционные, дисперсионные и отталкивательные коннексии взаимодействия. Специфические межмолекулярные взаимодействия относятся к индивидуальным, присущим данной паре коннексирующих частиц. Специфические коннексии предстают прерывными взаимодействиями в виде упругих и неупругих столкновений, перманентными и лабильными водородными связями взаимодействия, а также ионными коннексиями, обусловленными переносом валентных электронов с одного атома на другой с образованием электростатически взаимодействующих положительных и отрицательных ионов.
Полимеры в отличие от мономеров характеризуются не только количеством атомов, хиральностью и конфигурацией, но конформационной72 и структурной многовариантностью.
Конформация полимера представляет собой пространственную форму, которая возникает при повороте её отдельных частей относительно друг друга вокруг устойчивых коннексий между ними. При переходе от одной конформации к другой расходуется энергия, конфигурация полимера при этом не меняется. Полимер может иметь много конформаций, но устойчивыми из них являются те, которые обеспечиваются минимальными количествами энергии.
Полимеры состоят из мономеров, имеющих в своём составе ковалентно коннексированные атомы водорода, кислорода, азота с частично некомпенсированным зарядом, которые способны взаимодействовать с ковалентно коннексированными в другом мономере атомами с образованием перманентного водородного взаимодействия.
Частичные заряды вне полимерных коннексий компенсируются при малых значениях энергии связями перманентного взаимодействия с молекулами воды.
Многоатомный состав, хиральность, конфигурация и конформация приводят к образованию перманентных, в основном водородных связей взаимодействия между повторяющимися и разными мономерами полимера, придавая его структуре пекулиарность73.
Полимер имеет конституцию74 и конфигурацию, находится в определённом конформационном состоянии и предстаёт пекулиарной структурой, обусловленной конституцией, конфигурацией, конформацией и взаимодействием с компонентами внешнего окружения, в частности взаимодействием с молекулами воды.
Конституция полимера представляет собой тип, количество, хиральность и связность атомов в нём. Связность предстаёт длинами связи и углами между смежными коннексиями.
Конфигурация есть расположение в пространстве атомов полимера заданной конституции без учёта всех иных расположений, получаемых из данного только вращением вокруг одной или нескольких простых связей.
Данная конституция полимера и его конкретная конфигурация не позволяют чётко зафиксировать положение атомов в пространстве, поскольку оно обусловливается также их вращением вокруг одной или нескольких простых связей взаимодействия. Под конформацией полимера данной конституции и конкретной конфигурации понимают расположение атомов вокруг всех коннексий, которое задаётся указанием величин и знаков всех торсионных75 углов. Торсионный угол есть угол между двумя коннексиями, расположенными в разных плоскостях.
Полимер предстаёт последовательностью соединённых ковалентными коннексиями мономеров-звеньев. Энергетическая особенность полимера заключается в том, что электроны межсубчастичных молекулярных орбиталей мономеров и электроны межзвенных молекулярных орбиталей способны поглощать кванты электромагнитной энергии и переходить на более высокие орбиты и затем высвобождаться. Возврат электронов в прежние состояния сопровождается излучением и/или переносом энергии по макромолекуле с поглощением и переходом полимера в активное кинетическое состояние.
Излучаемая электромагнитная энергия воспринимается электронами межсубчастичных молекулярных орбиталей мономеров и электронами межзвенных молекулярных орбиталей. Поглощённая энергия распространяется по макромолекуле и способствует образованию дополнительных, в основном водородных связей взаимодействия между мономерами одного полимера.
Антеорганоиды как органические полимеры предстают, прежде всего, пептидными76 и нуклеиновыми77 полимерами, которые являются носителями антесциенции.
Антесциенция полимеров представляет собой совокупности вещественно-энергетических знаков, которые при вхождении антеорганоидов в состав органоидов, способны участвовать в биотранскодинге.
В состав антесциенции входят следующие вещественно-энергетические знаки:
– нескомпенсированные, частично нескомпенсированные и временно скомпенсированные электрические заряды, их потенциальные, потоковые и полевые характеристики;
– конституция, в том числе хиральная, конфигурация, конформация носителей нескомпенсированных, частично нескомпенсированных и временно скомпенсированных электрических зарядов с их потенциальными, потоковыми и полевыми характеристикам;
– пекулиарная структура, обусловленная конституцией, в том числе хиральной, конфигурацией, конформацией носителей нескомпенсированных, частично нескомпенсированных и временно скомпенсированных электрических зарядов с их потенциальными, потоковыми и полевыми характеристикам и пространственным распределением.
Квазиорганоиды предстают супрамолекулярными78 соединениями антеорганоидов и других органических молекул, прежде всего, белков, нуклеиновых кислот, углеводов, липидов. В частности, к белковым супрамолекулярным соединениям относятся нуклеопротеины, липид-белковые комплексы и липопротеины, углевод-белковые комплексы, хромопротеины, фосфопротеины и др.
Супрамолекулярные соединения предстают системами, в которых её компоненты взаимодействуют друг с другом, при этом процесс взаимодействия допускает их относительное перемещение в пространстве.
Внешняя среда супрамолекулярной системы может находиться в следующих фазовых79 состояниях, или фазах: в газовой, жидкой, газовой и жидкой, газовой и твёрдой, жидкой и твёрдой.
Энергия межкомпонентного взаимодействия в супрамолекулярной системе коннексирует молекулы в целое, связанное с внешней средой и имеющее какую-либо стереоформацию80.
Межкомпонентное взаимодействие в супрамолекулярной системе является перманентным нековалентным межмолекулярным взаимодействием, которое имеет следующие разновидности: ван-дер-ваальсовое, водородное, электростатическое, ароматическое (стэкинг-взаимодействие), лиофильное81, лиофобное82.
Во всех супрамолекулярных системах коннексирующий компонент содержит места, или локусы83, коннексии, посредством которых происходит селективное84 связывание коннексируемого компонента, в том числе по образу «замочная скважина – ключ от замка».
Супрамолекулярные системы имеют несколько стереоформационных состояний с переходами между ними, имеющими низкие энергетические барьеры. Изменение стереосостояния супрамолекулярной системы вследствие изменений во внешней среде сопровождается изменением её вещественно-энергетических свойств.
