Выполненный в ходе пандемии трехмерный высокого разрешения анализ коронавируса показал, что тонкая ножка шипов внедрена в мембрану с помощью особого гидрофобного участка. Кроме этих шипов имеются белки, тоже встроенные в саму мембрану, но не образующие шипов. На конце шипов располагается агрегат белков, включая и таких, которые не встроены в липидную мембрану вируса. Кристалл окружен биологической двухслойной липидной мембраной, в который закреплены белковые комплексы, имеющие сходство с зонтом. Ножка зонтообразного шипа коронавируса погружена в липидный двойной слой.

Вирусная липидная (жировая) мембрана окружает особый белковый агрегат, который включает в себя также цепь РНК, в которой зашифрована наследственная информация а именно, строение белков коронавируса. То есть, коронавирус SARS-CoV-2 относится к РНК-содержащим вирусам, то есть его геном состоит из РНК. Для того, чтобы вирус начал размножаться, необходимо, чтобы геномная РНК была преобразована в более короткие матричные или информационные РНК, с которых уже считывается информация во время синтеза этих белков. Было подтверждено наличие 9 предсказанных информационных РНК, каждая из которых несет в себе информацию о строении одного вирусного белка, и определено, на каком месте общей геномной РНК находится каждый из генов (7).

Информация о переносе коронавируса в ходе развития пандемии очень противоречива. То ли коронавирус попал в Италию через Германию и Сингапур, то ли из Ирана. Были попытки реконструировать маршруты распространения инфекции на севере Италии. Но они не увенчались успехом. Я не буду приводить детали. Оми мало интересны. На данный момент до конца так и не понятен источник и происхождение вируса SARS-CoV-2. Сначала власти Китая утверждали, что вирус распространился не из пробирок ученых, а из организма змей. Затем некоторые китайские ученые высказали предположение, что смертельно опасный коронавирус мог появиться на свет в исследовательской лаборатории, расположенной в шаговой доступности от печально известного рынка диких животных в городе Ухань, откуда и началась нынешняя эпидемия. В лабораториях центра удерживали зараженных животных, включая 650 летучих мышей. Наконец, были проанализированы 254 генома (полных последовательностей нуклеотидов РНК) коронавирусов, в том числе те 244 генома SARS-CoV-2, которые были изолированы у людей. Еще девять были найдены в китайских панголинах, которых подозревают в качестве промежуточных хозяин. Один геном был найден в Rhinolophus affinis – одном из видов летучих мышей. Коронавирус человека соответствует вирусу Rhinolophus affinis. на 96, 2 %. Генеалогическое древо показывает, что вирусы превратились в 3 различных типа. Тип А больше всего похож на коронавирус летучих мышей. Тип B вскоре развился из типа А. Вирусы отличаются 2 мутациями. Еще одна мутация привела к развитию типа С типа В. Согласно анализу генеалогического древа, тип B преобладал в Ухане. Это наиболее распространенный тип в Восточной Азии. Типы A и C распространились в Европе, Австралии и Америке. Тип C также распространен и в Сингапуре (8).

По мнению китайских учёных (Journal of Medical Virologyruen от 22 января 2020 года), новые вирусы появились ориентировочно два года назад от летучей мыши и китайских змей. Однако ряд исследователей в статье, опубликованной в журнале Nature, оспаривает подобный вывод китайских учёных и утверждает, что вирус произошел от млекопитающих и птиц. Это говорит о том, что убедительных доказательств естественного происхождения вируса нет. Оказалось, что геном вируса, выделенного у группы пациентов с атипичной пневмонией из Уханя, на 89 % совпадает с вирусом летучих мышей под названием SARS-like-CoVZXC21 и на 82 % – с человеческим вирусом SARS-CoV-1, эпидемия которого случилась в 2002–2004 годах. По этой причине вирус получил название SARS-CoV-2. Также геном вируса совпадает на 96 % с геномом вируса летучих мышей RaTG1 (9, 10). Однако затем ученые из Глазго в Шотландии показали, что летучие мыши как носители коронавирусных инфекций не представляют большей угрозы по сравнению с другими животными (11)

За время распространения по миру коронавирус мутировал (изменился). Исходный тип вируса оказался наиболее распространен в Австралии и США. Ученые назвали его «типом А». Позже он мутировал в «тип В», который и вызвал эпидемию в Китае. У жителей Европы чаще встречается «тип С», который является дочерним от «типа В» (12).

Считалось, что РНК вирусы имеют очень высокую частоту мутаций по-сравнению с ДНК-вирусами, то есть теми вирусами, у которых наследственная информация записана в ДНК. И это, мол, одна из причин того, почему так трудно сделать эффективную вакцину для предотвращения болезней, вызываемых РНК-вирусами. Однако оказалось, что SARS-CoV-2 мутирует в восемь-десять раз медленнее вирусов гриппа. Пока ученые зафиксировали всего 11 изменений на 30 тысяч нуклеотидный пар. Поэтому симптомы и тяжесть протекания заболевания определяются не штаммом вируса, а больше зависят от состоянии здоровья и иммунной системы. Таким образом,"мягкой версии" коронавируса, скорее всего, не существует (13, 14).

Другие ученые выяснили, что с момента вспышки коронавируса в Китае в декабре 2019-го появилось восемь новых штаммов."Вирус мутирует так медленно, что его штаммы очень похожи друг на друга", – сказал профессор кафедры медицины и инфекционных заболеваний Калифорнийского университета в Сан-Франциско Чарльз Чиу.

По данным специалистов, коронавирус мутирует (изменяется) в 8-10 раз медленнее вирусов гриппа (15).

Такую же информацию также озвучила главный санитарный врач РФ А. Попова во время ее интервью Познеру (она там чуть ли не на библии клялась), и эта же информация прозвучала в Италии в официальных пресс-конференциях по поводу коронавируса – мутации в этом вирусе практически не идут. С другой стороны, когда китайские врачи передали несколько десятков штаммов вируса, выделенных за время эпидемии в стране, в них уже было 149 мутаций, но, скорее всего, эти мутации были заменами только одного нулеотида, которые часто не вызывали изменений в строении белков, а если и вызывали то в тех участках полипептидной (белковой) цепочки, которая не важна для функции белка.

Вот все, что пока достоверно (то есть, на базе сведений, опубликованных в научных статьях) известно о самом вирусе. Поскольку сейчас в биологической науке господствуют молекулярные биологи, то большинство таких ученых забыли базовые сведения по гистологии и патанатомии. Поэтому стандартные эксперименты по взаимодействию клеток в пробирке в вирусом и вируса с клетками дыхательных путей почему то не проводятся. А жаль. Наконец, исходя из неких общих закономерностей, считается, что коронавирус ослабнет исходя из общих законов природы, принципов эволюции. Паразит не должен убивать всех своих хозяев (16).

Мои попытки найти научную информацию о том как новый коронавирус взаимодействует с клетками, не дали значительного результата. Корейские ученые обнаружили вирусные частицы SARS-CoV-2 диаметром 70–90 нм в вакуолях, расположенных внутри клеток Vero (это опухолевые клетки) (17). Однако подробного анализа механизмов проникновения, образования транспорта и выделения коронавируса в статье нет. В журнале Наука (Science) приводится схема жизни коронавируса в клетке, высосанная из пальца. Между тем необходимо провести исследование взаимодействию всех известных вирусов с человеческими клетками и ин ситу на животных. Другие базовые вопросы взаимодействия вируса SARS-CoV-2 с клетками практически не изучены от слова совсем. Это свидетельствует, о том, что в клинической вирусологии преобладает грубая эмпирия. Более того, очень мало известно и взаимодействии клеток с другими вирусами, механизмах попадания вирусов в клетки, Это особенно важно, но не изучено для клеток не в культуре ткани, а в органе.