Несмотря на успешное распространение шведской системы среди высших кругов русского общества, капитулу Феникса не удалось объединить под своим руководством все масонские ложи России. Более того, в самом ордене начались раздоры. Среди отечественных каменщиков возникло определенное недовольство первоначально принятой строгой зависимостью от герцога Карла Зюдерманландского, и русские масоны стыдились «покорения российского братства братству шведскому».

Екатерина II настороженно и подозрительно относилась к масонской деятельности. Она не желала распространения власти Швеции на родовое дворянство России, а также и усиления влияния масонов на цесаревича Павла.

Императрице стало известно, что шведские масоны прислали русским братьям достаточно крупную сумму денег, что вызвало ее негодование. В 1780 году в печати появилась сатира на масонов под названием «Тайна противонелепого общества», принадлежавшая бойкому перу самой иператрицы.

В Москве же, по далее от глаз сиятельной и Великой Екатерины, в конце 1780 года была организована «тайная и сиентифическая» масонская ложа «Гармония», в состав которой вошли князь Н. Н. Трубецкой, Н. И. Новиков, М. М. Херасков, И. П. Тургенев, А. М. Кутузов, И. Г. Шварц, князь А. А. Черкасский, князь П. Н. Энгалычев. «Тайный» характер ложи состоял в том, что о ее образовании не было известно не только непосвященным, называемым в масонских кругах профанами, но и многим масонам; термин «сиентифический» указывал на поиски данной ложей истинной «формы масонства». Ложа «Гармония» объединяла в своих рядах представителей различных масонских систем, стремившихся приобрести самостоятельность в решении вольнокаменщических вопросов. По этой причине ее называют в исследовательской литературе также «эклектической».

Ритуально-обрядовая сторона масонства не являлась обязательной для членов ложи «Гармония». Организация этой ложи явилась своеобразным прологом последующих просветительских преобразований московскими масонами. Она в определенной мере примирила представителей различных «масонских конфессий». Но не только. Значение деятельности ложи Гармонии состояло в том, что было положено начало теоретической разработке мировоззрения отечественных масонов, а вместе с этим и прокладывает свой путь русское масонство как национальное явление в общественной жизни России 18 столетия.

Одна из проблем, стоявшая перед «эклектическим» союзом братьев, – это формальная зависимость от Верховного стокгольмского капитула. Масоны не терпели самозванства в своей среде, и требовалось официальным путем преодолеть создавшуюся ситуацию подчинения всех каменщиков России Швеции. Другая сторона обозначенной проблемы состояла в том, что вера в возможность получения «истинного Света» не была потеряна. В результате И. Г. Шварц, профессор Московского университета, ставший уже известным в масонских кругах, отправился по коллективному решению ложи Гармонии на поиски «истинной формы» масонства за границу.

Ему был дан акт о том, что он является единственным верховным представителем «Теоретической степени Соломоновых наук» в России, посвящен в таинство розенкрейцеров и только ему разрешено организовывать русское розенкрейцерство. Тот же акт назначал Н. И. Новикова рангом ниже – главным надзирателем теоретической степени. Тогда же И. Г. Шварц познакомился с бароном Шредером, который впоследствии приехал в Россию и стал на короткий срок одним из главных лидеров ордена злато-розового креста.

Весной 1782 Шварц вернулся в Москву, а летом того же года состоялся Вильгельмсбадский конвент, на котором Россия была признана VIII совершенно свободной и самостоятельной провинцией масонского мира. Общемасонский конвент принял постановление, по которому отмежевывался от ордена тамплиеров. Место IX провинции осталось вакантным: конвент надеялся, что шведские масоны раскаются и присоединятся к единому масонскому братству.

Московские братья приобрели независимость от шведского масонства в решении вольнокаменщических вопросов, и с этого момента отечественное масонство приобретает самостоятельность. Результатами конвента воспользовались и братья шведской системы масонства в России – они присоединились к вновь образованному союзу. Если «эклектическая» ложа Гармонии положила начала к систематической разработке масонского мировоззрения, то решения Вильгельмсбадского конвента документально утвердили саму возможность подобного рода деятельности. С этого момента можно говорить о начале русского масонства как национального явления.

В конце 1782 года московскими братьями было получено постановление конгресса, и сразу же началась работа по организации провинциального капитула и Директории.

В капитуле приором был назначен П. А. Татищев, канцлером – И. Г. Шварц, казначеем – Н. И. Новиков. В Директории президентом стал Н. И. Новиков. Должность великого провинциального мастера в капитуле осталась свободной. Как полагают, эту должность берегли для наследника престола Павла Петровича. Четыре ложи – «Трех Знамен» П. А. Татищева, «Озирис» князя Н. Н. Трубецкого, «Латона» Н. И. Новикова и организованная князем Г. П. Гагариным ложа «Сфинкс» – получили право на самостоятельное образование новых лож.

Поставленная цель – приобретение независимости – была достигнута, и московские братья постепенно отходят от герцога Брауншвейгского, сохраняя связи с берлинскими розенкрейцерами. Иными словами, Шварц организовал тайный круг розенкрейцеров.

В основание розенкрейцерской деятельности было положено общемасонское вероучение трех иоанновских степеней.

В 1783 году на основании указа о вольных типографиях члены «Дружеского общества» открыли две типографии – одну на имя Н. И. Новикова, другую – на И. В. Лопухина, третья типография, состоявшая из двух печатных станков, размещенных в доме Шварца, предназначалась исключительно для «внутреннего пользования», и ее издания в продажу не поступали.

В сентябре того же года была учреждена «Типографическая компания», из 14 членов которой 12 были розенкрейцерами. Началась просветительсвая деятельность вольных каменщиков в России.

С началом 1785 внимание правительственных кругов к деятельности московских братьев становится более пристальным. Граф Я. А. Брюс, назначенный после смерти графа 3. Г. Чернышева главнокомандующим Москвы, вынудил И. В. Лопухина выйти в отставку. Затем последовала серия указов Екатерины II об осмотре в Москве частных школ и училищ, многие из которых находились под попечительством масонов, об испытании архиепископом Платоном Н. И. Новикова в Законе Божьем и рассмотрении напечатанных им книг. Непосредственной причиной, вероятно, были иностранные связи русских масонов и, главное, их попытки через В. И. Баженова установить связь с Павлом Петровичем. Платон, как известно, признал Новикова «хорошим христианином», но это не остановило императрицу. В 1786 были запрещены все частные школы и больницы, вышел запрет на печать в частных типографиях книг духовного содержания.

В 1784 деятельность русских розенкрейцеров была приостановлена в связи с объявлением высшими орденскими начальниками «силаниума», то есть молчания (на масонском языке). Затем в конце 1786 через барона Шредера пришло первоначально устное предупреждение, а затем официальное сообщение о приостановке с начала 1787 деятельности орденских собраний в связи с распространением «пронырств иллюминатов». Однако это не исключало активного изучения масонами тех материалов, которые были уже получены от берлинских розенкрейцеров и, прежде всего «Теоретической степени Соломоновых наук».

Таким образом, на момент выхода объявления о силаниуме в отечественном масонстве сложилась следующая ситуация: во-первых, главные масонские системы, получившие распространение в России, в своем основании имели три степени – ученика, товарища и мастера. Иоанновское масонство было «массовой формой» мировоззрения русских братьев и именно оно составляло основу системы ценностных ориентации вольных каменщиков.

Во-вторых, существовала тесная взаимосвязь между обрядами и ритуалами в первых степенях масонства «первого Елагина союза», лож барона Рейхеля, «гагаринских лож» и братьев Новиковского кружка. При всем разнообразии масонских систем выделяется исходное внутреннее единство масонства в России.