Во второй половине 1940 г. массовые поставки "Хадсонов" позволили в значительной мере перевооружить патрульные эскадрильи на новую технику. Этот процесс закончился в 1941 г. Напоследок разрешенную для "Энсона" бомбовую нагрузку довели до 500 фунтов (227 кг); обычно брали две глубинных бомбы по 250 футов. При этом взлетный вес самолета дошел до 4218 кг. "Энсоны" продолжали летать над морем до 1942 г., но уже в составе спасательных эскадрилий ВВС. Некоторые из них оснастили радиолокаторами ASV для обнаружения надводных целей. Подобную доработку производили и в Австралии.

Но основной сферой применения "Энсонов" в это время давно уже стали учебные подразделения. Вскоре после принятия в декабре 1939 г. совместного учебного плана ВВС стран Британского содружества "Энсон" избрали в качестве стандартного учебного многомоторного самолета. Надежный, экономичный, дешевый и простой до примитивности "Энсон" хорошо подходил для этих целей. Большая часть учебных машин вооружения не имела. В общей сложности, 2476 "Энсонов" I собрали без пулеметов. Именно без пулеметов, поскольку купол турели "Армстронг- Уитворт" обычно оставляли – он был очень удобен для обучения штурманов астронавигации. 313 самолетов выпустили для обучения воздушных стрелков с гидрофицированными турелями Бристоль B.I MkVI (от бомбардировщика

"Бленхейм"). С новой турелью самолет весил 4388 кг, что уже было многовато для маломощных моторов "Энсона". Двигатели часто перегревались. В связи с этим на некоторые машины ставили обеспечивавшие лучшее охлаждение гладкие цилиндрические капоты, сделанные по образцу капотов самолета Эйрспид "Оксфорд" для тех же двигателей. Учебные "Энсоны" I, выпущенные в 1940-42 гг., имели посадочные фары в крыльях вместо одной носовой, устанавливавшейся ранее. Некоторые из них имели дополнительные блистеры над местом штурмана, оборудовались радиокомпасами различных типов с открытыми кольцевыми или заключенными в обтекатели антеннами.

Производство "Энсонов" не только не уменьшалось, но и возросло. В 1939 г. ВВС выдали заказ на 1500 самолетов, а затем еще на 800. В 1943 г. к выпуску "Энсонов" подключился новый мощный завод в Иедоне. "Энсон" оставался основной учебной машиной для подготовки пилотов, штурманов и стрелков бомбардировочной авиации всю войну.

В ходе боевых действий продолжался и экспорт "Энсонов". В дополнение к ранее поставленным 48, в 1939-40 гг. 40 самолетов отправили в Австралию. Там на этих машинах летали 2-я, 4-я и 6-я бомбардировочные эскадрильи. Австралийские "Энсоны" в 1941-42 гг. принимали участие в войне на Тихом океане. Австралийские ВВС использовали их для патрулирования побережья, а затем как учебные и легкие транспортные самолеты. В последнем качестве они прослужили всю войну, затем находились до 1948 г. в консервации. Последний из них списали в 1963 г. Некоторое количество самолетов ушло в Южно-Африканский Союз. Ими укомплектовали одну эскадрилью (60-ю) и три отдельных звена, ранее вооруженные Юнкерсами Ju86Z-7 – переоборудованными пассажирскими самолетами. Их использовали для патрулирования побережья. Один "Энсон" в Южной Африке оснастили поплавками. Он стоял на авиабазе Конгелла как нелетающий учебный гидросамолет.

Со второй половины войны "Энсон" начал активно применяться и как легкий транспортный самолет. Сначала это были разоруженные машины, снятые с вооружения боевых эскадрилий (несколько таких передали и американским частям, базировавшимся в Англии), а затем и специальные модификации. Первой среди них явилась модификация X, выпущенная в 1943 г. Она представляла собой "Энсон" I с усиленным полом кабины для перевозки грузов. Поскольку они рассматривались как самолеты двойного назначения (учебно-транспортные), то некоторые из них сохраняли вооружение (турели Бристоль B.I MkVI). Последние "Энсоны" X собирались с гладкими круглыми капотами.

В 1944 г. выпустили специальные военно-транспортные варианты "Энсона" – модификации XI и XII. Предполагалось, что они будут использоваться как штабные, связные, санитарные и легкие грузовые самолеты. "Энсон" XI, совершивший свой первый полет 30 июля 1944 г., внешне отличался от модели I увеличенной высотой кабины. Моторы "Чита" XIV (заключенные в гладких круглых капотах) вращали металлические винты постоянного шага "Фэйри-Рид". На нем впервые у английских "Энсонов" ввели гидропривод шасси и щитков (на канадских модификациях, о которых будет рассказано позже, это новшество ввели на три года раньше). Чуть позже, 27 октября, поднялся в воздух первый "Энсон" XII. Он отличался от предыдущего варианта мотоустановкой – моторами "Чита" XV (420 л.с.) с винтами "Ротол". Первый опытный самолет и за ним 16 серийных переделали из машин модификации I. Последние "Энсоны" XII серии 2 выпускались с цельнометаллическими крыльями. Всего самолетов типа XI изготовили 90, а типа XII – 246. Все они эксплуатировались в Великобритании, за исключением одного "Энсона" XII, направленного после войны в Австралию.

Значительный вклад в производство "Энсонов" в период 2-й мировой войны внесли канадские заводы. В июле 1940 г. правительство Канады поручило фирме "Федерал эйркрафт" освоить выпуск машин этого типа для учебных целей. Конструкция машины была доработана применительно к имевшимся в Канаде комплектующим и технологии. В итоге, появилась модификация "Энсон" II. Первая опытная машина взлетела 21 августа 1941 г. "Федерал эйркрафт" переделала ее из привезенного из Англии "Энсона" I. На ней стояли американские моторы Джекобе L6MB по 330 л.с. От своих английских собратьев самолет отличался также измененным остеклением, прессованной носовой частью из фанеры, пропитанной синтетическими смолами (что-то вроде нашей "дельта-древесины"), иной конструкцией шасси и введением гидропривода для управления шасси и щитками. Впоследствии с привлечением шести субподрядчиков изготовили в общей сложности 1050 "Энсонов" II. 50 из них в 1943 г. передали ВВС армии США как АТ-20. На них стояли моторы Джекобе R-915- 7 (военный вариант того же L6MB).

С теми же двигателями "Джекобе" строили самолеты для Канады и английские заводы. Выпущенная с ними партия "Энсонов" I получила наименование модификации III. Еще 223 машины изготовили с моторами Райт R-760- Е1 "Уирлуинд" в 300 л.с. ("Энсон" IV).

В 1942 г. на конвейерах канадских заводов появились "Энсоны" V. Вместо сплошных полос остекления внедрили отдельные круглые окна, а главное – фюзеляж теперь весь изготовлялся как фанерная скорлупа (монокок) без несущей стальной фермы. Вооружения на них не ставили. Эту модификацию также в больших количествах (1070 штук) делали три фирмы – "Федерал эйркрафт", "Кэнедиэн кар энд фаундри" и "Макдональд бразерс эйркрафт". На ее базе выпустили также вариант для обучения воздушных стрелков – "Энсон" VI с турелью Бристоль B.l MkVI. В обоих случаях устанавливали моторы типа Пратт-Уитни R-985-AN 12В "Уосп Джуниор" в 450 л.с. с винтами фиксированного шага "Гамильтон" или "Гувер". "Энсоны" V эксплуатировались канадскими ВВС до конца 50-х гг.