В первой четверти 1901 г. линкоры 1-й эскадры проходили текущий ремонт и обучение по программе одиночного корабля, поэтому часто происходили смены флагманских кораблей командующего эскадрой и младшего флагмана.

Поскольку принц Генрих Прусский с декабря 1900 г. по январь 1901 г. находился в отпуске, 1-й эскадрой временно командовал младший флагман контр-адмирал Фишель. Сначала он держал свой флаг на устаревшем броненосце «Баден». затем перешёл на «Саксен» и. наконец, на «Кайзер Фридрих III».

С 8 февраля по 9 марта продолжались частые кратковременные смены флагманских кораблей, пока вице-адмирал принц Генрих Прусский не вернулся на свой «Кайзер Фридрих III».

Обучение кораблей 1-й эскадры обычно начиналось в конце марта с учений в составе эскадры в Балтийском море. Ими руководил вице-адмирал принц Генрих Прусский с борта флагманского линкора «Кайзер Фридрих III».

В середине марта все корабли 1-й эскадры собралась в Киле. Ещё до проведения весенней смены мест базирования эскадра предприняла поход в среднюю часть Балтийского моря. В ходе его проведения командующий эскадрой и специально прибывший в Данциг будущий командующий учебным флотом адмирал фон Кёстер на паровом катере прошли вдоль побережья, чтобы изучить его и наметить подходящие места для задуманных кайзером осеиыо совместных манёвров армии и флота.

1 апреля 1-я эскадра под командованием принца Генриха Прусского, державшего свой флаг на линкоре «Кайзер Фридрих III», вышла из Данцига в Киль.

Во время этого перехода в ночь с 1 на 2 апреля флагманский линкор 1-й эскадры «Кайзер Фридрих III» повредил себе днище у отмели Адлер-грунд северо-восточнее мыса Аркона. Авария линкора «Кайзер Фридрих III» до сих пор считается одной из тяжелейших аварий в имперском военно-морском флоте. Корабль получил серьёзные повреждения корпуса, но, к счастью, обошлось без человеческих жертв.

Вступившие в состав эскадры новые линкоры сначала в течение 3-х часов должны были идти форсированным ходом, затем в течение 24-х часов – полным. «Кайзер Фридрих III» с командующим эскадрой на борту в 1 ч.27 м. 2 апреля прошёл плавучий маяк Адлер-грунд и находился севернее отмели Адлер-грунд к северо-востоку от мыса Аркона. Внезапно находящиеся на его борту почувствовали сильное сотрясение. Корабль ударился сначала носовой частью, затем кормой, и вслед за этим на командирский мостик стали поступать донесения о подводных пробоинах в наружной обшивке правого борта.

По счислению в этот момент эскадра находилась на чистом фарватере – обычном пути судов. Согласно имеющимся картам, линкор шёл таким курсом, который обеспечивал глубину моря, по меньшей мере, 1 3 м (осадка линкора составляла 7,8 м). Как впоследствии выяснилось, из-за большой скорости хода корма линкора погрузилась на 0,5 м глубже, чем обычно и, при прохождении вблизи отмели Адлер-грунд днище ударилось о подводный камень, не обозначенный на карте. Выступающие камни неизвестной мелководной банки прочертили по днищу корабля, пятка ахтерштевня обломилась и была утеряна, руль и лопасти винтов погнулись. Около 1200 т воды (для кораблей того времени это было довольно большое количество) поступило в пять основных отсеков корпуса, вызвав крен на правый борт.

Во время удара командир линкора капитан 1-го ранга Тиле находился на мостике. Была пробита водяная тревога, сразу же задраили непроницаемые люки и двери. В то время, когда на аварийном корабле под командованием старшего офицера корветтен-капитана Мейера производили заделку пробоин, стараясь не допустить деформации переборок, командиру доложили о возникновении пожара в кочегарках правого борта.

В трёх кочегарках загорелся гудрон, попавший через лопнувший при аварии трубопровод из топливной цистерны в двойном дне на настил кочегарок и с увеличением уровня воды в котельных отделениях, достигшей горячего основания топок котлов. На поверхности воды образовалась горящая плёнка гудрона. Ввиду этого пришлось остановить паровые машины, а эти котлы погасить. Машинная команда не покидала своих постов, пока жар не выгребли из топок, а пар не стравили, благодаря чему и удалось избежать взрыва котлов.

Несколько кочегарок пришлось совсем затопить водой для погашения огня. То же пришлось сделать с погребами боезапаса, находившимися рядом с котельным отделениями. Несмотря на поступление воды в эти помещения, температуру ближайших к месту пожара переборок не удавалось понизить ниже 80°С. Принц Генрих лично распоряжался спасением корабля, и, благодаря его энергии и высокой дисциплине экипажа, удалось избежать гибели линкора.

Ради предосторожности с линкора «Кайзер Фридрих III» спустили катера и спасательные шлюпки, и в то же время для оказания помощи терпящему бедствие экипажу срочно подошедшей «Кайзер Вильгельм II» также спустил свои шлюпки. Но вскоре удалось потушить пожар, так что спасательные средства снова подняли на борт.

«Кайзер Вильгельм II» предпринял попытку буксировки аварийного корабля, но буксирные канаты каждый раз рвались. Между тем. на аварийном корабле экипажу удалось поднять пары в неповреждённых передних котельных отделениях, бортовые паровые машины заработали, и можно было начать переход в Киль со скоростью не более 5 уз., при этом два высланных навстречу спасательных судна в любой момент были готовы оказать помощь.

В сопровождении линкора «Кайзер Вильгельм II», который при сближении с аварийным кораблём также несколько раз слёгка коснулся грунта, «Кайзер Фридрих III» на малой скорости направился к близлежащей бухте Прорер-Вик.

У плавучего маяка Гьедсер остальные корабли эскадры присоединились к своему тяжёло повреждённому флагманскому кораблю. Теперь эскадра в полном составе направилась дальше в Киль, где «Кайзер Фридрих III» 3 апреля в 11 ч. пришвартовался к бочке, а затем его ввели в док для ремонта.

По получении донесения о случившемся, император Вильгельм II телеграфировал принцу Генриху Прусскому, выражая офицерам и экипажу линкора свою благодарность за доблестное поведение при спасении корабля.

Лишь 23 апреля повреждённый корабль смог перейти в Вильгельмсхафен, где 4 мая его временно вывели из состава эскадры – ремонт должен был продлиться не менее 6-7 месяцев.

Затем последовало подробное обследование повреждений и выяснение причин аварии. Техническое расследование – непосредственно через статс-секретаря имперского морского министерства фон Тирпица – самым неожиданным образом поручили молодому конструктору-судостроителю, тогда строительному советнику конструкторского отдела, а впоследствии начальнику конструкторского бюро имперского военно-морского флота Бюркнеру, поскольку он уже тогда являлся опытным строителем кораблей.

Повреждения оказались значительными. Обследование показало, что у линкора «Кайзер Фридрих III» на подводной обшивке правого борта на 2/3 длины корпуса проходили вмятины общей длиной до 25 м и шириной 60-70 см. с трещинами и разрывами. Часть шпангоутов была повреждена, но настил внутреннего дна, в основном, уцелел. Удивительным было то, что небольшие участки корпуса между трещинами не были повреждены, как будто бы кораблю во время касания отмели, длившегося всего около одной минуты, пришлось совершать прыжки. Котлы имели повреждения в тех кочегарках, где возник пожар.

Вторым местом тяжёлых повреждений являлась кормовоя оконечность корабля, где была сломана пятка руля и в двух местах перебит ахтерштевень. Однако каких-либо конструктивных ошибок не нашли. Из этого сделали оптимистические выводы, что применяемые в германском судостроении британские нормы допустимых нагрузок (например, прочности соединений элементов корабельных конструкций) тем самым были подтверждены и уточнены, так что их с уверенностью можно было использовать уже при проектировании линкоров типа «Дёйчланд».

Непосредственной причиной аварии явилось то, что эскадра для выигрыша времени проложила курс южнее острова Борнхольм, а этот фарватер вообще не рекомендовался для прохода кораблей с большой осадкой.

На место аварии была послана следственная комиссия. Первые же произведённые гидрографические обследования банки Адлер-грунд показали, что линкор оказался на неизвестной отмели с глубиной 9,5 м, на которой местами лежали крупные выступающие камни, так что фактическая глубина моря там едва составляла 8,2 м, а плавучий маяк Адлер-грунд оказался не на месте на 700 м.