Только когда боевые действия подкатились к Днестру, в северной части полуострова приступили к возведению трех линий обороны: в районе Перекопского вала; на линии Буденновка, Филатовка; в районе Пятиозерья. Саперные подразделения приступили к минированию Сиваша и Перекопа, на перешейке стали устанавливаться противотанковые заграждения и надолбы.

Был сформирован Каркинитский сектор береговой обороны (8 стационарных и 2 подвижные батареи), а на Арабатской стрелке установлена артиллерийская батарея (4 орудия 127-мм калибра). Для поддержки стрелковых подразделений, занявших оборону на Арабатской стрелке, в Утлюкском заливе огневые позиции заняли несколько канонерских лодок Азовской военной флотилии.

Крым, хоть и с запозданием, начал готовиться к обороне с суши. Но уже с 16 июля 1941 года боеспособная 32-я кавалерийская дивизия по распоряжению начальника Генерального штаба приступила к погрузке в железнодорожные эшелоны на станциях Симферополь и Джанкой для переброски на Западный фронт. Для восполнения этой убыли с 19 июля в Симферополь в железнодорожных эшелонах начали прибывать эшелоны с формируемыми Харьковским военным округом частями 48-й кавалерийской дивизии, полное сосредоточение которых завершилось к исходу 22 июля 1941 года.

А пока штаб Южного фронта докладывал в Москву обстановку в полосе боевых действий его войск:

Горький опыт прошедших сражений, большая нехватка опытных командных кадров, вооружения и боевой техники вызвали необходимость изменений в системе руководства Красной армии, ее организационной структуры, проведения мероприятий для улучшения боевого использования всех родов войск и их управления в ходе дальнейших операций. 15 июля 1941 года Ставка Главного Командования направила главкомам войск направлений, командующим фронтами и армиями директивное письмо, в котором потребовала по возможности без ущерба для боевых действий приступить к переходу к системе небольших армий «в пять — максимум шесть дивизий без корпусных управлений и с непосредственным подчинением дивизий командующему армией». Было решено расформировать механизированные корпуса, создав танковые бригады, и изменить организационную структуру стрелковых, кавалерийских и авиационных соединений и частей в сторону уменьшения численности личного состава и количества боевой техники.

Таким образом, переход частей и соединений на уменьшенные штаты резко снижал их боевую мощь и маневренность. Но это была вынужденная мера.

Для повышения роли руководства Вооруженными силами страны 19 июля 1941 года И. В. Сталин назначается народным комиссаром обороны, а 8 августа этого же года — Верховным главнокомандующим. Ставка Верховного Командования была преобразована в Ставку Верховного Главнокомандования.

А обстановка на Южном фронте продолжала осложняться. Разведорганы фронта 16 июлядокладывали о продолжавшемся сосредоточении вражеских войск на могилев-подольском и белцинско-кишиневском направлениях, о проводимой рекогносцировке и сосредоточении переправочных средств на Днестре в районе Ямполя. По полученным у захваченных пленных данным, в направлении Кишинева выдвигалась от Штефэнешти румынская моторизованная бригада.

Сотрудники разведотдела фронта сделали правильный вывод из полученной информации о возможных дальнейших событиях: «Противник подтягивает войска к реке Днестр на участке Калюс, Ямполь и готовится форсировать р. Днестр на широком фронте. Вводом в бой свежих сил противник усиливает свое наступление на кишиневском направлении, стремясь отрезать части левого крыла фронта. Авиация противника ведет разведку в направлениях Тирасполь, Днепропетровск; Фокшаны, Кременчуг с целью подготовки данных для совершения в ближайшее время налетов на Харьков, Кременчуг» [290].

Но никакой перегруппировки войск командование Южного фронта так и не провело: 130-я стрелковая дивизия, в полосе которой готовилось форсирование реки противником, продолжала удерживать оборону по Днестру на широком фронте, а кишиневское направление прикрывали ослабленные силы 35-го стрелкового корпуса.