Кроме четырех описанных выше вариантов, отдельные производственные серии также различались между собой. Прежде всего, особенностью поздних машин стало усиленное хвостовое оперение, что позволило отказаться от наружных накладок. Это нововведение появилось в тот момент, когда заканчивался выпуск истребителей F-2 и разворачивался выпуск варианта F-4. Летом 1941 года модифицировали воздухозаборник карбюратора у F-4, сделав его совместимым с тропическим воздушным фильтром. Прототип Me 109F-4/trop, имевший ряд конструктивных особенностей, поднялся в воздух в конце июня — начале июля 1941 года. В августе 1941 года фирма Erla освоила серийный выпуск тропического варианта самолета. Такая спешка объяснялась острой нехваткой тропической истребителей. Едва стало известно о том, что начался выпуск тропической модификации «мессера», заказы на тропические истребители не поступали разве что из-за Полярного круга. На худой конец требовали комплекты воздушных фильтров, которые можно было установить на самолеты в условиях полевых мастерских. Уже в середине июня поступил заказ на комплекты фильтров для «мессеров» из Luftflotte 2, а также для Me 109F-4/trop из II/JG 54. Спустя месяц фильтры заказало командование Luftflotte 5 (для 20 Me 109T) и Luftflotte 4 (в общей сложности 320 комплектов). Однако все заказы остались без ответа, так как в распоряжении RLM в июне 1941 года имелось всего 220 комплектов для «Эмилей», причем установить фильтры можно было только в заводских условиях. До конца июля 1941 года было готово 60 тропических комплектов для «Фридрихов-4». За это время число заказанных комплектов для Me 109F/trop уже достигло 680.

Два снимка самолета Me 109F, принадлежавшего Вернеру Мёльдерсу, октябрь 1940 года.

Me 109F-2 Мёльдерса, сфотографированный в период между 10 и 20 февраля 1941 года во Франции. На руле направления видны отметки о 56 воздушных победах.

Три снимка Me 109F-2 W.Nr. 6714, изготовленного фирмой WNF. На этом самолете в апреле 1941 года Голланд добился своей 60-й победы в воздухе. Обратите внимание на необычную раскраску самолета, цветные эмблемы на бортах, а также на люнетный прицел ZFR 5, которым оснащались отдельные истребители. Обратите внимание на угловатый воздухозаборник крабюратора. Вопреки расхожему мнению форма воздухозаборника указывала не на вариант истребителя, а на его изготовителя.

Третьей особенностью, различающей старые и новые серии «Фридрихов», был винт. На машинах F-2 и F-4 использовали винты двух типов: VDM 9-12010A с узкими лопастями (эти винты ставили главным образом на F-2) и VDM 9-12087А с широкими лопастями (на F-4). Винт с широкими лопастями сначала ставили на самолеты, оснащенные ускорителем GM 1, а затем этот винт стал стандартным для всех «Фридрихов-4».

Новый истребитель выпускали в нескольких стандартных комплектациях, причем на F-4 использовались разные модификационные комплекты Ruestzatz. Среди вариантов можно назвать R5 — пилон для подвесного бака, R1 — два пулемета MG 151/15 в гондолах под крыльями (в этой конфигурации выпустили 240 машин), R7 — две пушки MG 151/20 в гондолах под крыльями, R2-R4 — три разведывательных модификации оснащенных разной фотоаппаратурой и без радиостанции, R8 — еще одна разведывательная модификация, оснащенная рацией (серия 43 машины). Эти варианты выпускались в конце 1941 — начале 1942 года, после того, как линейные части были в целом насыщены стандартными истребителями. Самолеты модификаций «R» выпускались на базе Me 109F-4/Z. Разведчики R2 оснащались фотокамерами Rb 20x30, R3 — Rb 50x30, R4 — Rb 75x30, a R8 — Rb 50x30. Кроме того, существовали истребители-бомбардировщики, оборудованные пилоном ETC 500XIb или ETC 50VIIId. Эти самолеты на практике обозначали как F-4/B.

Два снимка Me 109F, РН+ВЕ, выпущенных WNF.

Me 109F-1/B из 10.(Jabo)/JG 2. Самолет хорошо подходил для налетов по принципу «ударил и беги», поскольку в небе над Англией постоянно кружило множество английских самолетов. Обратите внимание на желтые руль направления, нижнюю часть капота и шеврон с полосой за крестом на фюзеляже. Все эти детали типичны для истребителей-бомбардировщиков JG 2.

Незадолго до нападения на Советский Союз JG 54 переоснастили «Фридрихами». Этот F-1 принадлежал командиру II./JG 54, на что указывает двойной шеврон на борту. Лопасти винта черно-зеленые. Обтекатель винта темно-зеленый с желтой и красной полосами. Как это часто встречалось в JG 54 крест на фюзеляже имел широкий желтый кант. Борта фюзеляжа выкрашены в черно-зеленый цвет (70) с большими серыми пятнами (02).

Два снимка Me 109F-4 с пулеметами MG 151/15 под крыльями. Эти самолеты принадлежали 1./JG 52, который одним из первых получил новые «Фридрихи». Кроме того, полк получил вариант самолета с пушками MG 151/20 под крыльями.

10 июля 1941 года майор Роль Пингле, имевший на счету 26 побед (в том числе 4 в Испании), и занимавший должность командира III./JG 26, был сбит в районе Дувра в ходе боя с английскими бомбардировщиками. Англичане смогли отремонтировать его F-1 и подвергли трофей всесторонним испытаниям, которые внезапно завершились 20 октября когда испытатель отравился угарным газом, потерял сознание и разбил машину.

II./JG 27 была оснащена Me 109F-1 и F-2. Группа прибыла в Северную Африку в сентябре 1941 года. F-1 «красная 4» украшена характерным «берлинским медведем». Стоящий рядом F-2 «красная 3» оборудован бронированным лобовым стеклом.

F-2 Вернера Мельдерса, осень 1941 года, Восточный фронт, обтекатель втулки винта, нижняя часть капота, кончики крыльев, полоса на фюзеляже и руль направления желтые. На машине установлено бронированное лобовое стекло и бронирование кабины.

Пара F-2/Z/trop из I./JG 53. На передней машине заметен более объемистый маслорадиатор, необходимый для форсированного двигателя. Нижняя часть ветрового стекла закрашена. Это было типично для «Фридрихов», действующих в Северной Африке.

5 декабря 1941 года рейхсмаршал Геринг посетил JG 26. Ему показали оба F-2 Адольфа Галланда, имеющие усиленное вооружение. На первом самолете в фюзеляже стояли два 13-мм пулемета MG 131. Сбоку из капота торчит рукоятка стартера.