• Управление по борьбе с терроризмом и политическим экстремизмом (УБТПЭ)

• Антитеррористический центр / Центр специального назначения (ЦСН)

• Управление по борьбе с международным терроризмом (УБМТ)

• Организационно-оперативное управление

• Оперативно-розыскное управление (ОРУ)

3. Пограничная служба

4. Служба экономической безопасности (СЭБ)

• Управление по контрразведывательному обеспечению предприятий промышленности (Управление «П»)

• Управление по контрразведывательному обеспечению транспорта (Управление «Т»)

• Управление по контрразведывательному обеспечению кредитно-финансовой системы (Управление «К»)

• Управление по контрразведывательному обеспечению МВД, МЧС, Минюста (Управление «М»)

• Организационно-аналитическое управление

• Управление по борьбе с контрабандой и незаконным оборотом наркотиков (Управление «Н»)

• Административная служба

5. Служба оперативной информации и международных связей (бывшая Служба анализа, прогноза и стратегического планирования)

• Департамент оперативной информации (ДОИ)

• Аналитическое управление

• Управление стратегического планирования

• Отдел открытой информации

• Управление международного сотрудничества

6. Служба организационно-кадровой работы (СОКР)

• Управление специальных регистраций

• Организационно-плановое управление

• Управление кадров

7. Контрольная служба

• Инспекторское управление

• Управление информационного обеспечения оперативно-розыскной деятельности

• Контрольно-ревизионное управление

• Управление собственной безопасности

8. Научно-техническая служба

• Управление заказов и поставок вооружений, военной и специальной техники

• Управление оперативно-технических мероприятий (УОТМ)

• НИИ информационных технологий

9. Служба обеспечения деятельности

• Финансово-экономическое управление

• Управление материально-технического обеспечения (УМТО)

• Управление капитального строительства

Подразделения центрального подчинения

• Следственное управление

• Управление делами

• Приемная ФСБ (на правах отдела)

• Договорно-правовое управление

• Центр безопасности связи ЦБС

• Центр радиоэлектронной разведки на средствах связи — ЦРРСС

• Специальная служба (шифрование)

• Центр по лицензированию, сертификации и защите государственной тайны (Центр «ЛСЗ»)

• ФГУП НТЦ Атлас

Центр специальной техники

• Институт криминалистики Оперативно-поисковое управление (ОПУ)

Управление программ содействия

• Центр общественных связей

Управление регистрации и архивных фондов (УРАФ)

• Центральный архив

Управление радиоконтрразведки (управление «Р»). Управление авиации Управление специальной связи Военно-строительное управление Комендантская служба Дежурная служба

Десятый отдел (военно-мобилизационный)

Академия ФСБ

3 декабря 1991 г. Михаил Горбачев, президент СССР, распускает Комитет государственной безопасности (КГБ) Советского Союза.

24 января 1992 г. Борис Ельцин, президент России, создает Министерство безопасности Российской Федерации.

21 декабря 1993 г. Министерство безопасности переименовано в Федеральную службу контрразведки (ФСК). В своем указе Борис Ельцин написал: «Система органов ВЧК-ОГПУ-НКВД-НКГБ-МГБ-КГБ-МБ оказалась нереформируемой. Предпринимаемые в последние годы попытки реорганизации носили в основном внешний, косметический характер… Система политического сыска законсервирована и легко может быть воссоздана».[395]

5 января 1994 г. Следственное управление ФСК переводят в ведение Прокуратуры. Тюрьмы, включая Лефортово, передаются МВД. Пограничные войска выделяются в отдельное ведомство.

22 ноября 1994 г. Ельцин восстанавливает Следственное управление ФСК. Лефортовская тюрьма вновь передается спецслужбе.

24 ноября 1994 г. Организованный ФСК штурм Грозного терпит сокрушительный провал.

3 апреля 1995 г. ФСК переименована в ФСБ — Федеральную службу безопасности.

14 июня 1995 г. Чеченские боевики, возглавляемые Шамилем Басаевым, захватывают больницу в городе Буденновске. 19 июня, после провала штурма здания, российские власти вынуждены позволить Басаеву (вместе с несколькими заложниками) вернуться в Чечню. Общее количество жертв — 129 человек.

9—18 января 1996 г. Салман Радуев возглавляет атаку на город Кизляр в Дагестане — республике, пограничной с Чечней. Российская армия, силы спецназа и специальные подразделения ФСБ окружают и штурмуют боевиков, однако радуевцам удается бежать в Чечню.

31 августа 1996 г. В городе Хасавюрт подписывается соглашение о прекращении боевых действий. Хасавюртовские соглашения знаменуют конец Первой чеченской войны и предусматривают вывод федеральных войск из Чечни к 31 декабря 1996 г.

Сентябрь 1997 г. Создается специальное подразделение по борьбе с организованной преступностью — УРПО (Управление по разработке и пресечению деятельности преступных организаций).

6 июля 1998 г. Создается Управление по защите конституционного строя. УРПО распускается. Управление экономической контрразведки преобразуется в Управление экономической безопасности.

25 июля 1998 г. Владимир Путин назначен директором ФСБ.

8 октября 1998 г. Сформирован Центр специального назначения ФСБ. В него входят два управления — «Альфа» и «Вымпел». В июле 1999 года два спецподразделения, находившиеся в ведении УФСБ по Москве и Московской области и Управления экономической контрразведки, также передаются в состав Центра.

3 апреля 1999 г. Управление экономической безопасности подвергается реорганизации, созданы Управление по контрразведывательному обеспечению предприятий промышленности (Управление «П»), Управление по контрразведывательному обеспечению транспорта (Управление «Т»), Управление по контрразведывательному обеспечению кредитно-финансовой системы (Управление «К») и Управление по борьбе с контрабандой и незаконным оборотом наркотиков (Управление «Н»),

16 августа 1999 г. Николай Патрушев сменяет Путина на посту директора ФСБ.

28 августа 1999 г. Образовано Управление по защите конституционного строя и борьбе с терроризмом на базе Департамента по борьбе с терроризмом и Управления конституционной безопасности. Первый раз в российской истории функции борьбы с терроризмом и политического сыска объединяются в одном подразделении спецслужбы.

9 сентября 1999 г. Взрыв жилого здания на юго-востоке Москвы, 94 человека погибли. Спустя четыре дня, 13 сентября взрыв большой силы в подвале жилого дома на Каширском шоссе на юге Москвы, 118 жертв.

16 ноября 1999 г. Создается Управление программ содействия ФСБ. В состав нового управления входит Центр общественных связей (пресс-служба).

7 февраля 2000 г. Путин, премьер-министр и и.о. президента, подписывает «Положение об управлениях (отделах) ФСБ РФ в Вооруженных Силах РФ, других войсках, воинских формированиях», дающее военной контрразведке право выявлять потенциальные угрозы режиму в войсках.

26 марта 2000 г. Путин избран президентом России.

22 января 2001 г. На ФСБ возложено руководство антитеррористической операцией в Чечне.

24 апреля 2001 г. Николай Патрушев подписывает приказ, регулирующий правила прикомандирования офицеров ФСБ к госструктурам, организациям и компаниям.