Очередное шествие в Вильнюсе 18 августа 1861 года, в котором приняло участие 5 тысяч человек, увенчалось столкновением с полицией. В ответ 3 сентября 1861 года было введено военное положение в Вильнюсе и Виленском уезде (снято 14 октября 1862 года), почти во всей Ковненской губернии. Манифестации прекратились, но подспудно началась подготовка к восстанию.
После манифестаций 1861 года в Литве стали создаваться кружки "красных", в которых участвовали литовские интеллигенты, студенты. Летом 1862 года был образован Комитет движения "красных" во главе которого стал адъютант командующего войсками Виленского военного округа Людвик Звеждовский. Затем он был реорганизован в Литовский провинциальный комитет, который возглавил Константин Калиновский. Комитет установил связи с Центральным национальным комитетом в Польше. Интересы Польши в Литовском провинциальном комитете представлял Н. Дюлоран.
Параллельно развивалось движение "белых", в котором главным образом участвовали помещики. Во главе "белых" стоял помещик Якуб Гейштор. "Белые" Литвы были организационно связаны с аналогичной "белой" организацией в Польше. Как сказано в "Истории Литовской ССР", "возможное восстание ими рассматривалось как средство для выдвижения "польского вопроса" на международную дипломатическую арену. Они полагали, что "польский вопрос" может решить коалиция западных держав.
22 января 1863 года Центральный комитет провозгласил себя Временным национальным правительством Польши и в своем манифесте объявил о начале восстания в пределах Речи Посполитой для установления ее независимости. Одновременно провозглашались: равноправие всех сословий, отмена феодальных повинностей, передача крестьянам собственности помещиков с последующим вознаграждением последних за счет государства, наделением безземельных, принявших участие в восстании, участками земли. Как сказано в "Истории Литовской ССР", "о национальных правах литовского и белорусского народов в этих документах ничего не говорилось".
Выступление "красных" в Польше было неожиданностью для их соратников в Литве, но они также решили начать восстание. 1 февраля 1863 года Комитет движения "красных" опубликовал манифест и аграрные декреты в духе документов варшавского Центрального комитета. В "Истории Литовской ССР" говорится, что была также принята "Повстанческая инструкция", которая обязывала командиров повстанческих отрядов "истреблять царскую полицию, предавать суду наиболее ярых угнетателей крестьянства".
Однако вскоре возникли разногласия между польским и литовским руководством восстания. Как сказано в "Истории Литовской ССР", "равноправие Литвы с Польшей отстаивали руководители Литовского провинциального комитета. По этому вопросу велись… малоуспешные переговоры с Центральным национальным комитетом. Видный организатор восстания в Ковненской губернии – литовский революционный демократ Антанас Мацкявичюс добивался для своего народа и гражданских прав и национального равноправия. Спор Литовского провинциального комитета с Центральным национальным комитетом и Временным национальным правительством шел по существу о характере восстания, т.е. должно ли оно в Литве и Белоруссии ограничиться польскими национально-освободительными целями или следует расширить его на социальной основе до восстания народных масс с широким привлечением литовского крестьянства".
Внешнеполитические враги России решили вновь воспользоваться восстанием в Польше и Литве для нанесения сокрушительного удара по империи. 17 апреля 1863 года Великобритания, Франция и Австрия направили ноты правительству России с требованием "изменить политику в польском вопросе". К этому демаршу присоединились Испания, Португалия, Италия, Швеция, Нидерланды, Дания, Турция и папа римский. 27 июня 1863 года в адрес России эти страны направили еще более резкие ноты.
Лицемерие авторов этих нот было беспредельным. Ноты, в которых осуждалось угнетение других народов, направляла Англия, державшая в это время в колониальной неволе многие народы Азии, Африки, Америки, а также соседнюю европейскую Ирландию, разбогатевшая на бесстыдном разграблении богатств Индии, торговле африканскими рабами, только что завершившая беспрецедентную по масштабам и жестокости расправу с участниками всенародного восстания в Индии 1857 – 1859 гг., уничтожившая самыми жестоким методами в ходе установления своих колониальных режимов миллионы людей различных национальностей, включая ирландцев.
Россию осуждала Франция, солдаты которой полвека назад разграбили почти все страны Европы, уничтожив миллионы их жителей, а в середине века беспощадно истребляли сотни тысяч жителей Северной и Центральной Африки, Индокитая. В 1861 – 66 годах, то есть в то время, когда Франция возмущалась действиями царизма в Польше и Литве, Франция осуществляла "усмирение" Алжира, в ходе которого погибло 300 тысяч человек. Вместе с Англией Франция, стала участницей уничтожения китайского народа, стремясь навязать ему потребление опиума, в ходе второй опиумной войны 1856 – 60 годов.
Крокодиловы слезы о судьбе Польши и Литвы проливала Австрия, соучастница разделов Речи Посполитой, жестоко подавившая восстание поляков в 1846 году, раздавившая с помощью царских войск восстание венгерского народа в 1848 – 49 гг. и жестоко угнетавшая славянские народы и другие национальные меньшинства в своей империи.
В хор "возмущенных жестокостью царя" включились Испания и Португалия, которые стали мировыми державами лишь благодаря разграблению Америки и других континентов, разрушению древних цивилизаций и уничтожению миллионов индейцев и африканцев, жителей Филиппин. В момент вручения своих протестов эти государств Пиренейского полуострова продолжали грабить свои колонии в различных странах мира.
Спешили выразить свой протест против царской политике в Польше и Литве Нидерланды, навязавшие огнем и мечом колониальный гнетом миллионам людей в Азии и Америке. За 3 года до присоединения Нидерланд к протесту против политики царя в Польше голландец Деккер в своей книге "Макс Хавалар" так оценил политику Голландии в Индонезии: "Голландцы занимаются разбоем. Каждый мешок кофейных зерен – это обездоленная семья. Каждый ящик сахара – умирающие дети".
Если недавно возникшее на географической карте единое итальянское государство еще и не прославилось своими жестокостями в ходе создания своей колониальной империи, то это "упущение" было скоро компенсировано истребительными походами Италии в Северной и Восточной Африке, беспощадным уничтожением ее солдатами народов Ливии, Эритреи, Эфиопии и Сомали.
Протесты Дании и Швеции против политики царя в прибалтийском регионе позволяли забыть о колониальной политике этих стран в отношении народов Эстонии и Латвии, истребительные походы шведских королей, пытавшихся подчинить своей власти народы Литвы и Польши.
Протестовала против жестокостей царя даже Турция, которая давно разработала свое "ноу-хау" для решения национального вопроса: вырезая национальные меньшинства поголовно. За годы своего существования Османская империя уничтожила миллионы армян, греков, болгар, сербов, черногорцев и других южных славян, поощряла работорговлю и угон в рабство.
Участие в этих протестах папы римского означало, что "Святой престол" не отказался от своих попыток покорить Русь, впервые предпринятых на рубеже XI и XII веков, а затем постоянно возобновлявшихся вплоть до польско-литовской интервенции в начале XVI века.
Лишь Пруссия не поддержала антироссийской кампании. Стремясь предотвратить выступления польского населения на своей территории, прусское правительство предложило России свою военную помощь для подавления восстания. Уже в феврале 1863 года была подписана российско-прусская конвенция о совместных мероприятиях против польских повстанцев.