После 4 октября, принесшего много потерь советской стороне, атаки русских значительно ослабли. В ночь на 5 октября немецкие роты без помех перешли с передовой линии «Берлинской позиции» на «Берлинскую позицию».

К этому времени советские штабы вынуждены были признать, что все их надежды помешать эвакуации рухнули. Нервозность приводила к глупым решениям. 5 октября группа советских эсминцев под командованием капитана 2-го ранга Негоды действовала против немецких транспортов у крымского побережья. На подходе к Феодосии эсминцы «Беспощадный» и «Способный» встретились с немецкими торпедными катерами 1 -й флотилии и вели с ними безрезультатный бой. Лидер «Харьков» обстрелял ночью Ялту и Алушту. Утром 6 октября 1943 года объединившееся соединение кораблей заметила немецкая воздушная разведка. Ju-87 из 77-й эскадры пикирующих бомбардировщиков вылетели на перехват. Первой атакой был поврежден «Харьков» и взят «Способным» на буксир. Во время второй атаки были повреждены все три корабля. «Способный» попеременно пытался буксировать оба корабля. Третьей атакой «Беспощадный» и «Харьков» были потоплены. «Способный» немецкие самолеты отправили на дно во время четвертой атаки. После того как за один рейд было потеряно два эсминца и один лидер, Сталин запретил применять крупные корабли без его разрешения.

В ночь на 6 октября была оставлена позиция под Голубицкой. В журнале боевых действий 17-й армии говорится: «...667-й гренадерский полк 3-й батальон 666-го гренадерского полка 370-й пехотной дивизии в терние десяти дней на решающем направлении отражали атаки трех советских дивизий...»

В ту ночь произошло еще кое-что! Был высажен советский десант на сходящийся в Керченском проливе вытянутый остров Коса Тузла, имевший большое значение для обороны пролива. На острове длиной 7,6 км и 5 км шириной, возвышающемся над уровнем моря на 2 метра, с 5 октября находился 1-й батальон 282-го гренадерского полка 98-й пехотной дивизии, сменивший 2-й батальон 170-го полка 73-й пехотной дивизии. Охранение заметило высадку десанта, но темная ночь не позволила организовать оборону. 6 октября слабый 1-й батальон 282-го полка под командованием капитана Фокентанца безуспешно атаковал высадившуюся группу. Даже когда в бой вступил прежний гарнизон острова — 2-й батальон 170-го полка под командованием майора Кремница, советский десант сбросить не удалось. Однако действия обоих немецких батальонов предотвратили серьезную опасность для набравшего полные обороты движения судов, обеспечивавших переправу.

Вечером 6 октября генерал Конрад перенес свой командный пункт в Ильич. Одновременно он отдал приказ об отходе с «Берлинской позиции». Группа Беккера прошла через занятую 97-й егерской дивизией «Мюнхенскую позицию» и направилась в Ильич на погрузку. Арьергарды Беккера обошли одну из групп противника, высадившегося на берегу. 370-я пехотная дивизия и части 50-й пехотной дивизии в 7.10 были доставлены в Керчь.

В окончательном этапе эвакуации принимали участие только 97-я егерская дивизия и 4-я горнострелковая дивизия. Обе они находились под командованием генерал-лейтенанта Мюллера (командира 97-й егерской дивизии). К этому времени вся артиллерия была эвакуирована и заняла позиции вместе с дальнобойными батареями на Керченском полуострове.

В 7.10 три советские дивизии при поддержке 40 танков атаковали «Мюнхенскую позицию». Немецкие пикирующие бомбардировщики пикировали на танки, наносил удары артиллерийский кулак. Атаки противника были отражены с большими для него потерями.

8 октября советская артиллерия открыла огонь по «Мюнхенской позиции», но она уже была пуста. В ночь группа Мюллера заняла «Бреславльскую позицию». В 10.00 снова пошли в атаку 30 танков с пехотой на броне. Но далеко им пробиться не удалось. У Запорожи их встретил удар 40 тяжелых реактивных минометов, и 20 танков остались на месте. Южнее Запорожи скопления противника были полностью разгромлены пикирующими бомбардировщиками и артиллерией.

8 октября генерал Конрад и генерал-лейтенант Мюллер свернули свои командные пункты. В 18.00 13-й горнострелковый полк оставил южную часть «Бреславльской позиции», одновременно была оставлена и ее северная часть, а занимавшие их части отправились на погрузку в Ильич.

Причалы и места погрузки оставшиеся части обороняли на узких участках «Ульмской позиции» перед Ильичем и «Штутгартской позиции» на Косе Чушка. Для прикрытия отхода последних групп на «Ульмской позиции» находился 560-й батальон специального назначения и 97-й артиллерийский дивизион с 10 горными орудиями. 13-й горнострелковый полк ждал отправки на «Штутгартской позиции».

С наступлением темноты с позиции снялся первый батальон, ив 19.30 по причальным мосткам в Ильиче он погрузился на два морских парома, которые доставили его к северному молу в Керчи. Немецкая артиллерия поставила непроходимую завесу заградительного огня. Мешали советские ночные бомбардировщики, русская артиллерия вслепую перепахивала землю, но погрузка частей продолжалась. Последним на паромы поднялся 13-й горнострелковый полк подполковника Бюхнера.

В полночь причалы были взорваны. 9 октября в 1.00 от берега Таманского полуострова отошла последняя лодка. Последние подразделения прибыли в Керчь в 2.00. Эвакуацию Кубанского плацдарма 9 октября 1943 года завершило примечательное боевое донесение командующего 17-й армией:

Секретно! Управление 17-й армией

По оперативному отделу № 14674/43 секр. КП армии, 9.10.1943 Утреннее донесение от 9.10.1943

1. Армия закончила переправу через Керченский пролив. Последними частями, прикрывавшими эвакуацию армии, были: 97-я егерская дивизия, 13 и 91-й горнострелковые полки 4-й горнострелковой дивизии. Под прикрытием заградительного огня тяжелой артиллерии, размещенной северо-восточнее Керчи, и уничтожающего действия многочисленных реактивных минометов они оторвались от противника. С ними переправились командующий 17-й армией генерал саперных войск Енеке и командир 49-го армейского (горнострелкового) корпуса генерал горнострелковых войск Конрад. В завершение гарнизон острова Коса Тузла также был переправлен в Керчь.

Таким образом, эвакуация Кубанского плацдарма закончилась в полном соответствии с планом. Удалось переправить всю армию до последней роты, не оставлено ни одного исправного орудия. Главная заслуга в этом принадлежит заслуживающим всемерной благодарности войскам.

Большая часть применявшихся для переправы десантно-высадочных средств скрытно от противника вышла в южном направлении в Черное море и движется в Севастополь. Отдельные суда, которые не успели присоединиться к конвою, будут собраны в отдельный конвой.

2. (Речь идет о боевых действиях на Кубанском плацдарме.)

3. Эвакуация с Кубанского плацдарма.

Планировавшаяся сначала на срок 8—10 недель эвакуация Кубанского плацдарма, в связи с обстановкой на других фронтах и необходимостью скорейшего высвобождения сил, в день своего начала была сокращена до 4 недель. Несмотря на это, в Крым удалось вывезти большую часть зимних запасов Кубанского плацдарма, эвакуировать работоспособное население, а также все вооружение, боеприпасы, автомобили и оборудование. Уничтоженное оборудование и материалы ограничивались, главным образом, материалом покрытия полевых дорог, углем и фуражом. Переправочная организация командира штаба 700-го саперного полка полковника Бетца на Кубанском плацдарме и управление переправой коменданта Керченского пролива приняли особое участие в бесперебойной работе всей переправы. Транспортные суда морского командования «Кавказ» и 770-го десантно-саперного полка под командованием полковника Хенке в неустанном труде, несмотря на сильные бомбардировки авиацией противника и на последнем этапе — артиллерийские обстрелы, обеспечили переправу через Керченский пролив всей 17-й армии со всеми ее людьми, вооружением, транспортными средствами, обозами, материалом и оборудованием.

В ходе эвакуации Кубанского плацдарма через Керченский пролив было эвакуировано:

177 355 немецких военнослужащих