Родился 12 октября 1956 года в семье служащих. Отец Лев Михайлович Некрасов - ведущий конструктор, мать Мария Ивановна Некрасова (Воронцова) - ведущий инженер. Учился в московской специализированной средней школе № 56 с углублённым изучением английского языка, в одном классе с Татьяной Митковой. После окончания школы работал токарем, грузчиком.
В 1980 году окончил фармацевтический факультет Первого московского медицинского института. Позже служил на военно-медицинском складе, работал в аптеке.
С 1985—1989 работал в еженедельнике «Литературная Россия». Как сам признавался Некрасов, в это издание он попал совершенно случайно: "В 1985 г., имея около тридцати авторских листов никому еще не показанной прозы (авт. лист — 24 страницы), зашел с улицы в редакцию «Лит. России». Был убежден, что это «Литгазета» (Там на здании вывеска «Издательство „Литературная газета“»). Ошибку обнаружил, когда опубликовали рассказ и пригласили работать сначала литконсультантом, затем в штат отдела русской литературы."
В 1989 году вышел первый сборник рассказов в «Современнике».
С 1994 работал в еженедельной газете московской интеллигенции «Вечерний клуб»; главный редактор с 2000 года.
Член союза писателей Москвы с 1993 года.
В 1998 году окончил Высшие литературные курсы, параллельно с учебой работал в различных изданиях.
Награжден премией журнала «Дружба народов» (1998).
В 1998 году номинирован на Букеровскую премию за книгу «Коржик или Интимная жизнь без начальства». Информация о годе издания книги недостоверна по одним источникам она была опубликована в 1998, по другим 2001.
Приблизительно в это время Евгений Некрасов начинает писать детские детективы. Первая повесть была написана для сына. Постепенно появилась серия «Суперсыщик по прозвищу Блин» или «Следствие ведет Блин». Всего 12 книг. "В «Блине» сверхидеей было — показать читателям разные профессии, исторические факты, страны и города. Вот я и рассказывал обо всем, что видел в жизни и знаю, а когда знаний не хватало, читал исторические и справочные книги".
После окончания серии о Блине появилась серия повестей «Муха — внучка резидента». Всего 6 книг.
Оба цикла повестей печатались в серии детских детективов «Черный котенок» (Эксмо).
Сейчас издательство «Эксмо» переиздает повести по 2 в одной книге. В новых книгах о Блине старые повести обрамляются небольшими рассказами о жизни взрослого Блина. Точной информации о преиздании всех книг в таком формате нет. Так же были переизданы первые четыре повести о Мухе. медленно, но пишется продолжение: "...Я медленно пишу, потому что увлекся историей танков. Первая книжка вышла в журнале "Детская энциклопедия", вторая давно готова, ждет выхода, и третья почти написана. Когда их станет четыре в формате "Детской энциклопедии" - по 100 000 знаков, попробую издать все под одной обложкой".
По словам Некрасова, он заболел новым героем - Сашей (героиня из рассказов о взрослой жизни Блина).
Некоторые произведения были размещены в Интернете собственноручно автором.
Женат, сын Дмитрий, дочери Мария и Ольга.
