Оценивать обстановку помогает экспертная система, элементы искусственного интеллекта. Это наименее "освещенная" часть Aegis. Известно, что она работает на основе правил, названных разработчиками "доктринами-инструкциями". Согласно им оценивается информация, поступающая от РЛС. Например, обнаружив "чужую" цель на дистанции менее 54 км, комплекс поразит ее в автоматическом режиме.

"Эгида" выдает целеуказания не только зенитным, но и стартующим из вертикальных шахт противокорабельным ракетам RGM-84 Harpoon и крылатым BGM-109 Tomahawk. Она управляет огнем 127/54-мм орудий Mark 45 и закрывающими "мертвые зоны" от ПКР 20-мм автоматами Phalanx CIWS. Через интерфейс LINK-4A Aegis может наводить самолеты на воздушные цели, а через LINK-14 обмениваться информацией с другими кораблями группы, формируя эдакий внутриэскадренный интранет. Теоретически это позволяет значительно повысить боевую эффективность соединения. На практике единственная победа — уничтожение лайнера Iran Air "рейс 655", что обеспечило теплые чувства иранцев к ВМФ США.[Моряки крейсера USS Vincennes (CG-49) в 1988 году спутали его с истребителем F-14; результат — 290 погибших.] Но вот деньги налогоплательщиков "Эгида" действительно экономит — продлевая срок службы систем оружия, объединяя их в сеть и тем самым придавая новые системные свойства. Так, предполагается продлить срок службы крейсеров класса Ticonderoga, оснастив их ракетами SM-3 (сегодня они есть у 18 из 82 кораблей с Aegis) и используя в качестве платформ противобаллистического/противоспутникового оружия.