Одними из первых, кто начали оказывать масштабное коллективное сопротивление нацистам, были подпольщики Минского гетто. Организация возникла здесь в рекордно короткие сроки - через три недели после образования гетто. Во главе подпольной организации стояли Михаил Гебелев, Михаил Пруслин и Гирш Смоляр. Подпольщики были разбиты на 22 группы, строго соблюдавшие правила конспирации. Руководством организации была установлена связь с городским подпольным комитетом и с партизанскими отрядами. Подпольщикам Минского гетто удалось сохранить свою организацию вплоть до ликвидации гетто. Это позволило вывести к партизанам несколько тысяч узников - самое большое число уцелевших на всей оккупированной территории СССР в немецкой зоне оккупации.
Особенностью подпольной организации Минского гетто было то, что её деятельность была направлена на спасение как можно большего количества узников и их включение в партизанские отряды.
Другая особенность длительной и сравнительно успешной деятельности подпольщиков состояла в том, что его руководству удалось внедрить в администрацию и внутреннюю полицию своих агентов. Так, в Минске сотрудники юденрата составляли одно из подразделений подпольщиков. Но не только его председатель Илья Мушкин, но и начальник еврейской полиции Зяма Серебрянский, казнённые впоследствии нацистами, и назначенные на их место люди активно участвовали в планировании и проведении важнейших мероприятий, направленных прямо или косвенно против нацистов. Таким же образом участвовали в сопротивлении нацистам, например, заместитель начальника еврейской полиции Вильнюсского гетто И. Глазман, начальник еврейской полиции гетто Барановичей и Ивье (Лидский район), целый ряд рядовых полицейских активно участвовали в антинацистском сопротивлении и героически погибли.
В Западной Белоруссии деятельность подпольщиков в ряде гетто поддерживались юденратами (в Лахне, Дисне, Шарковщине) или вызывала их симпатии (в Мире, Острине, Клецке, Пружанах).
Одной из важных задач подпольщиков была организация оказания помощи бежавшим советским военнопленным: их прятали, лечили и переправляли к партизанам, расплачиваясь за эти действия собственной жизнью.
Массовые побеги совершали узники гетто в Новогрудке и Кобрине. В новогрудском гетто был прорыт туннель протяжённостью 250 метров и шириной 1,5 метра, выводящий за ограду. Побег был совершён 26 сентября 1943 г., более 150 человек ушли в партизанский отряд братьев Бельских.
Важнейшим направлением деятельности подпольщиков было приобретение и изготовление оружия, а также его накопление вне гетто. Как минимум, в 42 гетто Западной Белоруссии и Литвы подпольщики были вооружены. Поскольку подавляющее большинство подпольных организаций составляли молодые люди, подростки и женщины, не имевшие военной подготовки, то было организовано их обучение основам военного дела.
Ещё одно важное направление подпольной деятельности еврейского сопротивления состояло в информировании узников гетто и местного населения о намерениях оккупантов и о положении на антигерманских фронтах, в первую очередь, об успехах Красной Армии. Для этого некоторые подпольные группы специализировались на изготовлении и распространении листовок.
В конце января 1942 г. в Вильнюсском гетто была создана "Объединённая партизанская организация", численность которой насчитывала несколько сот членов. Возглавляли организацию И. Виттенберг, И. Глазман и А. Ковнер - члены различных еврейских политических партий. Идейные разногласия между ними не влияли на характер борьбы с нацистами. В составе организации действовала и молодёжная секция (руководитель Абба Ковнер). Известно её воззвание, призывавшее к массовому вооруженному сопротивлению нацистам. Воззвание распространялось и в Белостоке, Варшаве, Гродно. По разным причинам восстание в Вильнюсском гетто не состоялось. Однако сотни членов подпольных групп Вильнюсского и Каунасского гетто стали бойцами еврейских партизанских отрядов Литвы. К партизанам удалось вырваться и членам подпольной организации гетто в местечке Свенцаны, состоявшей из 25 человек. В основном это были подростки, работавшие на немецком складе трофейного оружия.
В Рижском гетто также активно действовала антинацистская подпольная организация.
В отличие от индивидуальных актов коллективное сопротивление, как правило, не было спонтанным. Подпольщики преследовали две главные цели: подготовка вооружённого сопротивления в момент ликвидации гетто и создание партизанских отрядов путём пополнения узниками отрядов действующих. Были, конечно, и "попутные" цели: поднятие морального духа узников; поиск единомышленников; поиск и ликвидация предателей и провокаторов; добыча оружия и денежных средств; изготовление фальшивых документов; взаимодействие с местным подпольем и литовским антинацистским партизанским движением.
Накануне акций уничтожения летом - осенью 1942 г. прошли восстания в белорусских гетто Несвижа, Клецка, Мира, Лахвы, а также и в украинских гетто Тучина, Луцка, Мизочи, Борщова, Рогатино, Брод, Ковеля, Дубно, Дубровиц. В августе 1943 г. вспыхнуло восстание в Белостокском гетто, но, к сожалению, было беспощадно подавлено. Следует сказать и о том, что в некоторых случаях десятки, а то и сотни вырвавшихся на свободу узников гетто не смогли по разным причинам попасть в партизанские отряды и спастись. Но всё-таки в партизанских отрядах евреи воевали. Точно их численность установить не удалось до сих пор. Историки полагают, что их было, примерно, 25-30 тысяч человек. Гауляйтеры оккупированных территорий, командование СС и СД, полиции неоднократно подчёркивали движущую роль евреев-партизан в движении Сопротивления. Об этом, в частности, говорил палач Белоруссии гауляйтер В. Кубе. Нацистам не хотелось признаться в том, что в движении Сопротивления участвуют массы русских, украинцев, белорусов и людей других национальностей (не говоря о евреях), которые столкнулись с ужасами оккупационного режима: массовыми расстрелами и угоном в Германию.
Ещё одна особенность еврейского коллективного сопротивления заключалась в том, что при партизанских отрядах были семейные лагеря, где укрывались дети, старики, женщины. Охрана этих лагерей и обеспечение их существования стоили еврейским партизанам огромных усилий. Эти образования требовали затрат ресурсов, которые можно было использовать на борьбу с нацистами, снижали манёвренность еврейских партизанских отрядов и приводили к большим потерям бойцов.
Наибольшую известность получили, к сожалению, только несколько еврейских партизанских отрядов.
-- Отряд Тувье Бельского из Новогрудка (Белоруссия) сформирован буквально через три недели после прихода немцев. Его ядро составляли братья Бельские: Тувье, Асоэл, Арчик и Зуся. Командиром был избран старший из братьев Тувье, служивший до войны в польской армии. После войны он жил в США; похоронен с воинскими почестями в Израиле. В составе отряда был семейный лагерь. Общая численность отряда с учётом детей, женщин и стариков составляла около 1 270 человек. Деятельность отряда была направлена как на борьбу с оккупантами, так и на сохранение жизни подзащитного контингента.
-- Шломо Зорин в октябре 1941 г. бежал из гетто и в партизанском отряде под командованием Семёна Ганзенко командовал конным взводом. После того, как С. Ганзенко возглавил созданную под его руководством партизанскую бригаду имени Будённого, отряд (N 106) возглавил Зорин. В Израиле ещё живы партизаны, воевавшие под командованием Ш. Зорина: Хаим Гольдин, Моисей Горелик, Макс Конюк, вытащивший раненного командира и спасший ему жизнь. Эти бывшие партизаны сообщили историку следующий факт: после освобождения Красной Армией Минска партизанский отряд N106 был сразу же расформирован. Формальная причина такого решения историкам до сих пор неизвестна, как и неизвестна судьба его командира. Однако высказывается мнение о том, что это решение было принято из чувства чьей-то личной неприязни.