Несмотря на то, что министром обороны стал противник Квашнина Игорь Сергеев, начальник Генштаба начал кадровые продвижения своих людей: Виктор Казанцев стал Командующим СКВО, Геннадий Трошев стал его заместителем; в августе 1997 года начальником Главного оперативного управления ГШ стал Юрий Балуевский; в ноябре — Главнокомандующим ВМФ стал однокурсник Квашнина по академии ГШ Владимир Куроедов.

В августе 1997 года министром юстиции был назначен другой член команды — Сергей Степашин. В результате, по некоторым данным, сформировалась связка: Савостьянов — Степашин — Квашнин. Говорят, что в круг лиц, с которыми контактировал в Администрации Президента РФ Квашнин в этот период входил и Владимир Путин.

В ходе войны Квашнина с Игорем Сергеевым, был отставлен Петр Дейнекин, Главком ВВС, сопротивлявшийся объединению ВВС и ПВО. На его место был поставлен генерал-полковник авиации Анатолий Корнуков, командующий авиацией ПВО, который поддержал идею Квашнина об объединении.

Говорят, что в свое время Квашнин был инициатором реформирования Сухопутных войск (упразднения Главкомата), что привело к ослаблению позиций Владимира Семенова, очередного кандидата на пост министра обороны. Позже Семенов «ушел в политику» и увяз в грандиозном скандале вокруг выборов президента в Карачаево-Черкесии.

В ходе этой войны Квашнин получил еще одного союзника — Николая Михайлова, статс-секретаря и заместителя министра обороны, который и сейчас занимает в команде Квашнина видное место.

Интересно, что в этот период некоторые источники называли Квашнина креатурой Бориса Березовского, с которым генерал был замечен в ряде поездок на Северный Кавказ.

В декабре 1998 года Евгений Примаков отправил в отставку Евгения Савостьянова, чем ослабил команду Квашнина, однако — не до конца: в марте 1999 года Главное оперативное управление ГШ получило приказ о разработке плана очередной антитеррористической операции на территории Чечни. Кроме самого Квашнина, другими разработчиками плана были — Сергей Степашин (от МВД) и Владимир Путин (от ФСБ). А назначение Степашина на пост премьер-министра вновь усилило позиции команды.

Одновременно ГОУ ГШ (Юрий Балуевский) подготовило проект участия России в мирном урегулировании ситуации в Югославии — то самый десантный бросок на Приштину. Моральный успех операции добавил влияния Квашнину и выставил Сергеева генералом, «проспавшим» операцию.

В августе 1999 года, с началом военной операции в Дагестане против отрядов Басаева и Хаттаба, и.о. премьер-министра стал Владимир Путин. Успех операции предопределил не только рост рейтинга Путина, но и генералов, которые обеспечивали ее проведение: Квашнина, Казанцева, Трошева, Шаманова и Корнукова. Они и стали основой генеральской поддержки кандидатуры Путина на выборах Президента РФ. В результате, после победы Путина на президентских выборах, Квашнин занял очень устойчивые позиции в своей нише.

Особые отношения имеют Квашнин и военная реформа. В 1997 году, еще только придя в Генштаб, Квашнин начал продвижение концепции реформы Вооруженных сил на базе создания семи оперативно-стратегических командований, в распоряжение которых отходили бы ВВС, ПВО и Сухопутные войска: «Министерство обороны создает условия для выполнения боевых задач, Генштаб формулирует их, а командующие округов — и только они — отвечают за выполнение этих задач. У них в руках и авиация, и ПВО, и сухопутные соединения… Все остальные — администраторы»[80]. Подозревают, что именно эта концепция оказала идеологическое влияние на Путина, который позже реформировал административную вертикаль, разделив ее именно на 7, но не военных, а федеральных округов (кстати, во главе которых встали именно генералы из команды Квашнина).

В 2000 году Квашнин изменил свой взгляд на концепцию реформы ВС в сторону построения мононациональной континентальной армии с правом участия в политической жизни страны.

В начале апреля 2000 года Квашнин представил Путину технически разработанную концепцию реформы, основными положения которой сводились к сокращению ВС до 800.000 человек и подчинению всех воинских формирований Генштабу.

Кстати, в этот период основные проекты Генштаба (реформа и Чечня) разрабатывал один из ведущих идеологов ГШ В.Манилов. Однако одобрив, в общем, идею единоначалия в ВС, Путин сохранил паритет в ведомстве, продлив контракт Сергеева еще на один год.

В качестве компенсации команде Квашнина Трошев был назначен Командующим федеральной группировкой в Чечне. Кроме этого, Константин Пуликовский был назначен Полномочным Представителем Президента РФ в Дальневосточном федеральном округе, а Виктор Казанцев возглавил Южный федеральный округ. Знаковым было также назначение на пост Командующего Уральским военным округом, нацеленным на Центральную Азию, генерала-полковника Александра Баранова, также причисляемого к команде Квашнина.

Кстати, по некоторым данным, Квашнин дружен с Эдуардом Росселем, губернатором Свердловской области. И, якобы в результате этой дружбы, в 2001 году было принято решение о слиянии Приволжского и Уральского военных округов (это слияние уже происходило в 1989 году и центром крупнейшей военной «территории» стала Самара) и переносе штаба ПурВО из Самары в Екатеринбург.

В довершение, 10 июня 2000 года Путин назначил Квашнина членом Совета безопасности РФ и ведомство стали представлять два генерала (Квашнин и Сергеев), что само по себе было беспрецедентным.

Среди «сильных ходов» Квашнина также отметим вывод армии из Чечни и перекладывание ответственности за ход операций на ФСБ и МВД и, наконец, уход с поста министра обороны Сергеева. Однако сам Квашнин вновь не был назначен на пост министра, им стал, как известно, Сергей Иванов.

Сейчас Квашнин и Иванов, говорят, нашли общий язык в осуществлении перемен в ведомстве. Так, оба они делают ставку на крупные (но не такие, как раньше) группировки сухопутных сил, как переходный тип к бесконтактным войнам. На новом этапе Квашнин вновь сформулировал свое видение военной реформы. По мнению Квашнина, войска должны делиться по следующему принципу: суша — море — воздух, космос.

Конкретно Генштабом предполагается уменьшение количества округов с 8 до 7 (6), например, вновь объединив ПриВО и УрВО; к 2003 году планируется уменьшить количество ядерных боезарядов до 1500 и реформировать РВСН (это уже практически сделано). Главное, на чем вновь настаивает Квашнин — то, что Генштаб должен сосредоточить управление всеми войсками у себя.

Основным противником «реформы по Квашнину» является Андрей Николаев, председатель Комитета по обороне, бывший директор Федеральной пограничной службы, один из кандидатов на пост министра обороны. Инициативы Николаева в этом направлении всячески поддерживает бывший министр обороны РФ Игорь Сергеев. Он, в частности, направил Николаеву благодарственное письмо, в котором отметил поправки, сделанные депутатом в «Плане реформирования ВС».

Одновременно, есть данные, что Квашнин все-таки подминает под себя Иванова — в чисто аппаратном плане. Так что реальная власть де-факто находится у Квашнина, за спиной которого сейчас стоит руководство Московского военного округа и все та же группа «чеченских» генералов. В ответ, по имеющимся данным, «силовики-спецслужбисты» (по линии Федеральной службы охраны) собирают «компромат» на военачальников группы Квашнина.

Среди нынешних креатур Квашнина выделяются следующие персоны:

генерал-лейтенант Александр Рукшин, начальник ГОУ ГШ;

генерал-полковник Валентин Корабельников, начальник ГРУ ГШ;