Со стороны высших немецких властей был в июле 1942 г. поднят вопрос о подчинении добровольного „Омакайтсе“ немецкому военному командованию, дабы этим целесообразнее провести включение „Омакайтсе“ на службу военной безопасности страны. 26 июля состоялось в Тарту в штабе 207 охранной дивизии по этому вопросу совещание, на котором представителями эстонского „Омакайтсе“ были руководитель полиции и „Омакайтсе“ подполковник Э. Рейссаар, его заместитель подполковник В. Гутман и начальник отдела „Омакайтсе“ полковник И. Майде.

На основании приказания командующего генерала охранных войск и руководителя Северного военного округа (Коммандирендер-генерал дер Сихерунгструппен унд Бефельсхабер им Хеэресгебит Норд) генерала фон Рок от 29 сентября 1942 г. № 1655/42с территориальные части „Омакайтсе“ были, считая с 1 октября 1942 г, переданы в его подчинение под названием „Эстонское Омакайтсе“. Согласно этому приказу считались подчиненными военным властям штабы полков „Омакайтсе“, штабы территориальных батальонов, оркестры и все территориальные части. Таким образом, командующий генерал охранных войск стал высшим начальником „Омакайтсе“. Непосредственно „Омакайтсе“ было подчинено командующему генералу 207 охранной дивизии генерал-лейтенанту Тидеманну, который отдавал распоряжения, касающиеся „Омакайтсе“, непосредственно эстонскому полицейскому директору.

Территориальные подразделения полков „Омакайтсе“ перешли во всех отношениях в подчинение полевому коменданту соответствующей территории, которые начали давать командирам полков оперативные задачи. Согласно этому порядку подчинялись:

полевому коменданту Раквере — полк Виру;

полевому коменданту Таллина — полки Таллина, Харью и Ярва;

коменданту Балтийских островов — полк Саарема, 5 территориальный батальон (в Хийумаа) из полка Ляэне (в хозяйственном отношении батальон оставался подчинен полку Ляэне);

полевому коменданту Пярну — полки Ляэне, Пярнумаа и Сакалама;

полевому коменданту Тарту — полки Тартумаа, Валгамаа, Вирумаа и Петсеримаа.

Приказанием о подчиненности были установлены задачи, на выполнение которых можно вывести „Омакайтсе“. Такими перечислялись: охрана эстонского берега, железных и шоссейных дорог, а также в военном отношении важных предприятий, борьба с неприятельскими шайками, против воздушных десантов и парашютистов, а также другие задачи военного характера.

Полевым и местным комендантам было вменено в обязанность руководство обучением „Омакайтсе“ и снабжение его оружием и боеприпасами.

Для проведения личных изменений в составе начальства „Омакайтсе“ было необходимо согласие: от полевого коменданта и охранной дивизии — относительно ротных командиров, от них же и от командующего генерала охранных войск — относительно батальонных командиров и высших.

Офицером для связи в 207 охранной дивизии был назначен из полицейского управления капитан Аугуст Яксон, начиная с 1 октября 1942 г.

Казармированные части „Омакайтсе“ по-прежнему оставались подчиненными через полицейского директора командиру полиции порядка, а их сведение в охранные батальоны (Шутцманншафтс — В — батальон) было возложено на командира полиции порядка. Они были оставлены по-прежнему в оперативном подчинении полевым комендантам и продолжали все свою прежнюю деятельность. В персональном и хозяйственном отношении их подчиненность также не изменилась — они принадлежали к полкам, но были подчинены командиру полиции порядка.

На основании приказания командира полиции порядка от 1 декабря 1942 г. приступили к формированию охранных батальонов из казармированных подразделений „Омакайтсе“, причем провели это следующим образом:

287 охранный батальон в Таллине — из казармированных подразделений полка Таллина;

288 охранный батльон в Таллине — из казармированных подразделений полков Харью и Ярва;

289 охранный батальон в Раквере — из казармированных подразделений полков Виру и Нарва;

290 охранный батальон в Тарту — из казармированных подразделений полка Тартумаа;

291 охранный батальон в Пярну — из казармированных подразделений полков Пярнумаа и Сакалама;

292 охранный батальон в Хаапсалу — из казармированных подразделений полков Ляэне и Сааремаа;

293 охранный батальон в Выру — из казармированных подразделений полков Вырумаа, Валгамаа и Петсеримаа.

После необходимых инструкций командира полиции порядка и полицейского директора командиры батальонов, назначенные командиром полиции порядка 4 декабря 1942 г., начали переформировывать казармированные подразделения „Омакайтсе“ в охранные батальоны.

Вступая на службу в охранный батальон, личный состав был обязан дать по особой форме присягу, в которой, между прочим, было предусмотрено обязательство служить до неопределенного времени. Это требование вызвало в некоторых местах среди людей недоразумения, так как дотоле они имели договор с обязательством служить один год. 2 декабря 1942 г. последовало относительно этого приказание руководителя СС и полиции в Эстонии, согласно которому все члены казармированных подразделений были обязаны с 1 декабря 1942 г. продолжать службу без срока.

Окончание переформирования казармированных подразделений „Омакайтсе“ не успели докончить к концу года. Окончательно это провели лишь к 1 февраля 1943 г. В структуре добровольного „Омакайтсе“ к концу года не произошло изменений, за исключением вышеизложенных.

Число членов „Омакайтсе“ на 1 января 1942 г. было 40709 человек(см. таблицу № 3),[52] а на 1 января 1943 г. — 43053, то есть прирост в течение г. — 2344 членов. В течение г. прибыло — 18477, а убыло — 16133 члена В первых месяцах г., однако, многочисленное прибытие не смогло покрыть числа убывших, так что в течение января и февраля месяцев число членов уменьшилось на 830. Убыль большого числа членов вызвало, главным образом, формирование добровольческих частей, в которые вербовали людей, в первую очередь, из „Омакайтсе“. Начиная с марта месяца, прибыль превышала ежемесячную убыль до сентября месяца, когда опять замечалось маленькое уменьшение. Заметный прирост в весенние и летние месяцы зависел от формирования добровольных подразделений в Тартумаа, да и от формирований в Таллине, Сааремаа и Хийумаа. В последних месяцах г. уменьшение членов вызывало, главным; образом, комплектование Эстонского легиона, куда из „Омакайтсе“ перешли многие. Наибольшее число членов состояло 1 января в полку Виру — 8040, а в конце г. имел наибольшее число членов полк Тартумаа — 9002. Полк Виру со своими 7120 членами остался на втором месте.

Членами „Омакайтсе“ состоят из общего числа мужчин Эстонии около 9 %. Этот процент стоит выше всего в районе полка Виру — 16,7 %, <далее. следует Ярвамаа -13,4 % и Вильяндимаа — 13,1 %. В городах этот процент заметно ниже: от 1,4 до 9 %. Наименьший процент из общего числа мужчин состоит в „Омакайтсе“ в Таллине -1,4 %, где к формированию территориальных подразделений приступили лишь с марта месяца 1942 г. Дальше следует Петсеримаа с 2,6 %, где большинство народонаселения составляют русские, почему там число верных людей более ограничено.

Состав членов „Омакайтсе“ по группам рода занятий на 1 января 1943 г. в процентах приблизительно: хлебопашцев — 60 %, деревенских рабочих — 8 %, работников из учреждений эстонского самоуправления — 7 %, с вольной профессии — 4 %, городских рабочих -3%, студентов и учеников — 2 %, разных — 8 % и зарплатных членов в „Омакайтсе“ (казармированные подразделения + кадры и штабы территориальных частей) — 8 %.

Пропорция зарплатных членов и добровольных составляет на 1 января 1943 г. отношение 1 к 12. В казармированных частях числилось на 1 января 1943 г. 2576 человек. После перевода казармированных частей отношение зарплатных членов к добровольным стало 1 к 37.