Осенью 1665 года гетман Брюховецкий отправился в Москву, там был принят с большим почётом, пожалован боярином, женился на боярской дочери и получил богатую вотчину от царя, а приехавшие с ним полковники пожалованы в дворяне. Желая угодить Москве, Брюховецкий сам предлагает уничтожить украинские привилегии. Гетман просит умножить в Малороссии количество царских воевод, ввести кабацкую продажу вина, сделать перепись народа, установить на великорусский образец целовальников и прислать митрополита из Москвы вместо выборного. И новые воеводы были посланы в Прилуки, Лубны, Гадяч, Миргород, Полтаву, Батурин, Глухов, Сосницу, Новгород-Северский и Стародуб, а с ними, конечно, и войска. Брюховецкий хлопотал, чтобы их было побольше! В Малороссию приехали переписчики и стали переписывать всех людей по городам и сёлам и облагать их налогами. В городах установили целовальников для сбора царских доходов. Таким образом, благодаря Брюховецкому царь ещё раз существенно ограничил автономию и привилегии украинской старшины и самого гетмана. В осуществлении власти на Украине всё большее значение приобретает созданный в Москве в 1663 году Малороссийский приказ. Местная украинская администрация была поставлена под контроль царских воевод. Разве гетман Брюховецкий не достоин звания героя России?
Когда Брюховецкий вернулся из Москвы на Украину, он быстро понял, что его ненавидят там все слои населения. Казацкая старшина за урезание её привилегий, а крестьяне за нарушение гетманом предвыборного обещания записать всех желающих в казаки. Горожанам не нравились царские воеводы и их стрельцы. И поголовно все украинцы ненавидели гетмана за его непотребный образ жизни: распутство, пьянство и стяжательство. Особенно казаков возмутили новые титулы гетмана и тех, кто с ним ездил в Москву. «У нас прежде бояр не бывало!» — Говорили они. Один из полковников так испугался, что публично заявил: «Мне дворянство не надобно: я по-старому казак!» Как видите, верхом мечты казаков остаётся возведение в шляхетское звание польским королём. Русское дворянство и даже боярство казаки презирают. И это ещё один кирпич в стене, разделяющей русских и украинцев. Ни гетманы, ни старшина ничего не сделали для разрушения этой стены. Наоборот, они старательно её укрепляли, всё более погружая и себя, и простой народ в омут крайнего национализма.
Брюховецкий испугался за свою жизнь. Он решил привлечь на свою сторону хотя бы казацкую старшину, недовольную потерей части своих свобод и привилегий. Царь, естественно, взятое назад не вернёт, поэтому собранные гетманом на совет полковники решили отторгнуться от Москвы и поддаться турецкому султану. Когда об измене Брюховецкого узнали в Польше, то сказали русским послам: «Надобно нашим государям послать войска — выжечь и перебить этих изменников-казаков, чтоб места их были пусты, потому что они и вам, и нам изменяют, и добра от них не будет!» Царь послал в Малороссию войско под началом князя Ромодановского для наведения порядка, но казаки сами убили Брюховецкого, и на Украине вновь началась чехарда гетманов.
В марте 1669 года, в городе Глухове была собрана рада, и на ней был избран в гетманы Малороссии Демьян Многогрешный. По новому договору царь ограничил количество казаков до 30 тысяч. Гетманы отныне не только избираются на раде, но и утверждаются царём. Кроме того, гетманы лишались права сноситься с иностранными государствами. В Малороссии учреждался особый казачий полк в 1000 человек, обязанный отслеживать, где начинаются бунты, и подавлять их в начале. Этот полк назван компанейским. Митрополитом в Малороссию Москва прислала черниговского архиепископа Лазаря Барановича. Как видите, измена Брюховецкого позволила ещё более урезать казацкие привилегии и усилить власть царя в Малороссии. Гетман Брюховецкий просто героически послужил России!
Многогрешный тоже не долго продержался в гетманах. Он был пьяница, а в пьяном виде не воздержан на язык. Этим и воспользовались его враги. Казаки сами схватили гетмана и отправили его в Москву вместе обширным доносом, в котором обвиняли Многогрешного в измене, сношениях с правобережным гетманом Дорошенко, в поношении царя и т. п. Под пытками Многогрешный отверг обвинения в измене, но сознался, что в пьяном виде говорил «неистовые речи». Старшина просила царя казнить гетмана, но царь сослал Демьяна Многогрешного в Тобольск.
Видите, как изменилась обстановка в Малороссии? Казацкая старшина не расправилась сама с неугодным гетманом, а отправила того в Москву, на суд царя! И царь вынес свой приговор, а не утвердил казацкий. Как известно, римский прокуратор Пилат в подобной ситуации «умыл руки», хотя власти в Иудее у него в то время было несравнимо больше, чем у русского царя в Малороссии! Измена Многогрешного, пусть и не на деле произошедшая, а только на словах, наглядно проявила усилившуюся власть и авторитет царя в Малороссии. Отныне участь гетманов-изменников будет определять царь, а не казаки.
Гетман Иван Самойлович
17 июня 1672 года, недалеко от Конотопа, в Казачьей Дуброве, новым гетманом рада избрала Ивана Самойловича. Этот гетман верно служил России пятнадцать лет. И сгубили его полученные в наследство от Богдана Хмельницкого украинский национализм, проявившийся в пренебрежении к русским, и жажда удержать хотя бы остатки «самостийности» Малороссии.
В 1686 году Москва приняла решение уничтожить Крымское ханство, издавна досаждавшее русским городам и сёлам регулярными грабительскими набегами, даже не смотря на то, что Россия ежегодно платила хану дань деньгами и пушниной! Казаки гетмана должны были принять участие в намечающейся войне. После краха Правобережья, у казацкой старшины остался всего один возможный союзник против царя — крымский хан. Если Украина в очередной раз решит отложиться от России в погоне за самостийностью, то ей больше не к кому обратиться за помощью. Казаки и крымчаки не раз устраивали ранее совместные набеги на Польшу и Россию. Самойлович завидовал тому, что крымчаки живут совершенно самостоятельно, лишь формально подчиняясь турецкому султану. Вот бы и Малороссии так жить, лишь формально подчиняясь русскому царю, как это было при Богдане Хмельницком! — Мечтал Самойлович. Гетман вёл широкую торговлю с ханом, что не мало способствовало обогащению его семьи. Короче, Самойловичу война с ханом была совершенно не выгодна, он прекрасно понимал, что уничтожение крымского ханства серьёзно подорвёт его личное благополучие и окончательно похоронит надежды казацкой шляхты когда-либо вырваться из-под власти Москвы. Гетман не скрывал своего недовольства и открыто называл предпринимаемую войну «чертовскою, гнусною», величал Москву глупою: «Хочет дурна Москва покорить государство крымское, а сама себя оборонить не может».
Весной 1687 года стотысячное русское войско под предводительством фаворита царевны Софьи, князя Василия Голицына, двинулось в южные степи. На Самаре к нему присоединился со всеми своими полками гетман Самойлович. 14 июня войско дошло до речки Карачакрана и встретилось с неожиданным препятствием. Вся степь была выжжена, продовольствие для лошадей, конечно, не везли. Лошади начали погибать. Продолжать поход стало невозможно. Пришлось прекратить войну, не начав, и позорно повернуть назад. У Голицына не было ни малейшего сомнения, что татар предупредил гетман, тем более, что Самойлович не сдерживая своего злорадства открыто говорил: «Не сказывал ли я, что Москва ничего Крыму не сделает. Се ныне так и есть; и надобно вперёд гораздо им от крымцев отдыматись». Даже из этих слов видно, что гетман ни в малейшей степени не считает себя и вообще малороссов гражданами России. Поражение потерпела лишь Москва, а казаки вроде как просто погулять вышли! Гетман Самойлович за 15 лет правления под защитой московского царя, как говорится, зажрался и оторвался от реальности. Но казацкая старшина, с которой он давно перестал считаться, прекрасно понимала, что Голицын не простит казакам предательства и позора поражения. Когда войско вернулось из похода и стало станом над рекою Коломаком, старшина тут же подала донос на гетмана, в котором обвинила Самойловича в предательстве и дурном поведении. Старшина просила от имени всех казаков сместить и наказать гетмана. Более того, Голицыну прямо сказали, что казаки выберут в гетманы того, на кого он укажет!