Федеральное министерство координирует и контролирует деятельность подведомственных ему агентств и служб и возглавляется входящим в состав Правительства РФ федеральным министром; федеральная служба, федеральное агентство возглавляется руководителем (директором). Структура федеральных органов исполнительной власти определена Указом Президента РФ от 20 мая 2004 г. № 649 «Вопросы структуры федеральных органов исполнительной власти» и представлена тремя блоками органов.
1 блок – органы исполнительной власти, руководство деятельностью которых осуществляет Президент РФ (так называемые политические органы):
– Министерство внутренних дел РФ
– Федеральная миграционная служба;
– Министерство РФ по делам гражданской обороны, чрезвычайным ситуациям и ликвидации последствий стихийных бедствий;
– Министерство иностранных дел РФ;
– Министерство обороны РФ
– Федеральная служба по военно-техническому сотрудничеству;
– Федеральная служба по оборонному заказу;
– Федеральная служба по техническому и экспортному контролю;
– Федеральное агентство специального строительства;
– Министерство юстиции РФ
– Федеральная служба исполнения наказаний;
– Федеральная регистрационная служба;
– Федеральная служба судебных приставов;
– Государственная фельдъегерская служба РФ (федеральная служба);
– Служба внешней разведки РФ (федеральная служба);
– Федеральная служба безопасности РФ;
– Федеральная служба РФ по контролю за оборотом наркотиков;
– Федеральная служба охраны РФ;
– Главное управление специальных программ Президента РФ (федеральное агентство);
– Управление делами Президента РФ (федеральное агентство).
2 блок – федеральные органы исполнительной власти, руководство деятельностью которых осуществляет Правительство РФ:
– Министерство здравоохранения и социального развития РФ
– Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека;
– Федеральная служба по надзору в сфере здравоохранения и социального развития;
– Федеральная служба по труду и занятости;
– Федеральное агентство по здравоохранению и социальному развитию;
– Федеральное медико-биологическое агентство;
– Федеральное агентство по высокотехнологичной медицинской помощи;
– Министерство культуры и массовых коммуникаций РФ
– Федеральная служба по надзору за соблюдением законодательства в сфере массовых коммуникаций и охране культурного наследия;
– Федеральное архивное агентство;
– Федеральное агентство по культуре и кинематографии;
– Федеральное агентство по печати и массовым коммуникациям;
– Министерство образования и науки РФ
– Федеральная служба по интеллектуальной собственности, патентам и товарным знакам;
– Федеральная служба по надзору в сфере образования и науки;
– Федеральное агентство по науке и инновациям;
– Федеральное агентство по образованию;
– Министерство природных ресурсов РФ
– Федеральная служба по надзору в сфере природопользования;
– Федеральное агентство водных ресурсов;
– Федеральное агентство лесного хозяйства;
– Федеральное агентство по недропользованию;
– Министерство промышленности и энергетики РФ
– Федеральное агентство по промышленности;
– Федеральное агентство по техническому регулированию и метрологии;
– Федеральное агентство по энергетике;
– Министерство регионального развития РФ
– Федеральное агентство по строительству и жилищно-коммунальному хозяйству;
– Министерство сельского хозяйства РФ
– Федеральная служба по ветеринарному и фитосанитарному надзору;
– Федеральное агентство по рыболовству;
– Министерство транспорта РФ
– Федеральная служба по надзору в сфере транспорта;
– Федеральное агентство воздушного транспорта;
– Федеральное дорожное агентство;
– Федеральное агентство железнодорожного транспорта;
– Федеральное агентство морского и речного транспорта;
– Федеральное агентство геодезии и картографии;
– Министерство информационных технологий и связи РФ
– Федеральная служба по надзору в сфере связи;
– Федеральное агентство по информационным технологиям;
– Федеральное агентство связи;
– Министерство финансов РФ
– Федеральная налоговая служба;
– Федеральная служба страхового надзора;
– Федеральная служба финансово-бюджетного надзора;
– Федеральная служба по финансовому мониторингу;
– Федеральное казначейство (федеральная служба);
– Министерство экономического развития и торговли РФ
– Федеральное агентство по государственным резервам;
– Федеральное агентство кадастра объектов недвижимости;
– Федеральное агентство по управлению федеральным имуществом;
– Федеральное агентство по управлению особыми экономическими зонами.
3 блок – федеральные агентства и федеральные службы, руководство деятельностью которых осуществляет Правительство РФ:
– Федеральная антимонопольная служба;
– Федеральная аэронавигационная служба;
– Федеральная служба по тарифам;
– Федеральная служба по гидрометеорологии и мониторингу окружающей среды;
– Федеральная служба государственной статистики;
– Федеральная служба по финансовым рынкам;
– Федеральная служба по экологическому, технологическому и атомному надзору;
– Федеральная таможенная служба;
– Федеральное агентство по атомной энергии;
– Федеральное космическое агентство;
– Федеральное агентство по туризму;
– Федеральное агентство по физической культуре и спорту Федеральные органы исполнительной власти, руководство деятельностью которых осуществляет Правительство РФ, называют административными органами. Порядок взаимоотношений федеральных министерств и находящихся в их ведении служб и агентств, полномочия федеральных органов исполнительной власти, а также порядок осуществления ими своих функций определены в Положениях об этих органах, утверждаемых соответственно Президентом РФ или Правительством РФ. По представлению федеральных министров Правительство РФ назначает заместителей федеральных министров и руководителей федеральных служб и агентств, подведомственных Правительству; федеральные министры по представлению руководителей федеральных служб и агентств назначают заместителей руководителей федеральных служб и агентств и руководителей территориальных органов. Назначения в органах стратегического блока проводятся Президентом РФ.
Федеральные органы исполнительной власти имеют право формировать территориальные органы. Правила их организации и деятельности отражены в Типовом регламенте внутренней организации федеральных органов исполнительной власти, утвержденном постановлением Правительства РФ от 28 июля 2005 г. № 452. Такие органы образуются для осуществления полномочий федерального органа исполнительной власти на определенной территории в соответствии с единой схемой их размещения, на основании приказа федерального органа исполнительной власти. Схема размещения подготавливается федеральным органом исполнительной власти и вносится его руководителем в Правительство РФ или соответствующее федеральное министерство. Схема сопровождается пояснительной запиской с указанием цели, задач и видов образуемых территориальных органов; сведений о территориях их деятельности; финансово-экономического обоснования. В зависимости от того, в чьем ведении находятся федеральные органы исполнительной власти, схема размещения их территориальных органов утверждается Правительством РФ, приказом федерального министерства.
Положения о территориальных органах утверждаются руководителями соответствующих федеральных служб и агентств, в них отражены правила осуществления распорядительных, разрешительных, контрольно-надзорных полномочий, мер государственного принуждения; реализации федеральных целевых программ, планов и иных мероприятий; взаимодействия с органами исполнительной власти субъектов РФ, органами местного самоуправления, иными территориальными органами и полномочными представителями Президента РФ в федеральных округах; осуществления полномочий руководителя территориального органа. Деятельность территориального органа организует его руководитель, несущий персональную ответственность за реализацию возложенных на орган функций. Как правило, статус территориальных органов – Управление (например, Управление федеральной службы по ветеринарному и фитосанитарному надзору по Саратовской области; Управление государственной службы занятости населения по Саратовской области и т. д).