В сентябре дивизия обеспечивала отход немецких войск за Днепр, а с середины октября вела тяжелые бои, отбив несколько попыток советского наступления на Кривой Рог. Но к моменту, когда 15 ноября советские войска перешли в наступление, Беккера в Кривом Роге уже не было — еще 9 ноября он сдал командование оберштурмбаннфюреру СС Карлу Уллриху[67] и был отправлен на Балканы. Как оказалось «расставание» Беккера с родной дивизией было недолгим.

Новым местом назначения Беккера стал город Лайбах (Любляны), на территории Словении. Здесь на базе штурмовой бригады «Рейхсфюрер СС» полным ходом шло формирование новой дивизии — 16-й моторизованной дивизии СС «Рейхсфюрер СС» (16. SS-Panzergrenadier-Division «Reichsführer SS») под командованием группенфюрера СС и генерал-лейтенант войск СС Макса Симона. Симон хорошо знал Беккера еще по боям под Демянском, а последнее время до назначения в Лайбах возглавлял всю дивизию СС «Мертвая голова», поэтому при выборе командиров подчиненных ему полков он остановился на кандидатуре Беккера. Таким образом 13 ноября 1943 года штандартенфюрер СС Беккер вступил в командование 36-м моторизованным полком СС. Однако фактически как воинской части полка еще не существовало и именно Беккер возглавил все мероприятия по его формированию.

В марте 1944 года полк Беккера в составе дивизии принял участие в операции «Маргарита» — оккупации немецкими войсками Венгрии, где и оставался в течение двух месяцев, выполняя функции оккупационных войск и не имея боевых столкновений. В середине мая 1944 года части дивизии начали перебрасываться в район Лука — Пиза: ситуация в Италии резко обострилась и там настоятельно требовались резервы. Однако еще до того, как дивизия была окончательно переформирована, часть ее солдат была отправлена на советско-германский фронт, где они были влиты в качестве пополнения в потрепанную в боях дивизию СС «Мертвая голова». В числе тех, кому вместо солнечной Италии предстояло отправиться в Россию был и штандартенфюрер СС Гельмут Беккер.

В июне 1944 года 3-я моторизованная дивизия СС «Мертвая голова» находилась на отдыхе и перевооружении в Румынии. Предполагалось, что дивизия, штатная численность которой должна была составить около 21 тысячи человек, будет переформирована в танковую (официально название «3-я танковая дивизия СС “Мертвая голова”» она получила, правда, только 21 октября 1944 года). Одновременно группенфюрер СС и генерал-лейтенант войск СС Герман Присс принял командование действовавшим на Западе XIII армейским корпусом СС, и пост командира «Мертвой головы» остался вакантным. 21 июня 1944 года Гельмут Беккер встал во главе своей «родной» дивизии — на этом же посту ему предстояло встретить и крах Третьего рейха. В тот же день Беккер был произведен в оберфюреры СС.

После завершения переформирования новая танковая дивизия СС стала состоять из 3-го танкового полка СС «Мертвая голова» (SS Panzer-Regiment 3 «Totenkopf»), 5-го моторизованного полка СС «Туле» (SS Panzer-Grenadier-Regiment 5 «Thule»), 5-го моторизованного полка СС «Теодор Эйке» (SS Panzer-Grenadier-Regiment 6 «Theodor Eicke»), 3-го танково-артиллерийского полка СС (SS Panzer-Artillerie-Regiment 3), 3-го зенитного дивизиона СС (SS Flak Artillerie-Abteilung 3), 3-го дивизиона штурмовых орудий СС (SS Sturmgeschütz-Abteilung 3), 3-го танкового разведывательного батальона СС (SS Panzer-Aufklärungs-Abteilung 3), 3-го противотанкового дивизиона СС (SS Panzerjäger-Abteilung 3), 3-го танкового саперного батальона СС (SS Panzer-Pionier-Bataillon 3), 3-го танкового батальона связи СС (SS Panzer-Nachrichten-Abteilung 3), а также частей дивизионного подчинения (которые также имели номер 3).

23 июня советские войска перешли, наступление по всему фронту — началась операция «Багратион». К операции советское командование привлекло четыре фронта, 22 армии, 5 воздушных армий, 166 дивизий, 12 танковых и механизированных корпусов — всего 2,4 миллиона человек, более 36 тысяч орудий и минометов, 5,2 тысяч танков и самоходных орудий, 5,3 тысячи боевых самолетов. Советским войскам противостояла ослабленная группа армий «Центр», которая даже с примыкавшими к ней войсками группы армий «Север» (16-я армия) и «Северная Украина» (4-я танковая армия) насчитывала 1,2 миллиона человек, 9,5 тысяч орудий и минометов, 900 танков и штурмовых орудий, 1350 самолетов. Немцы удара не выдержали, фронт трещал по швам, крупные группировки группы армий «Центр» оказались в окружении. Командование в срочном порядке стягивало резервы, бросая в бой все имевшиеся в его распоряжении средства. Сначала предполагалось передать дивизию в состав 4-й армии, но сложившаяся тяжелая обстановка вынудила командование использовать еще не полностью прибывшую на фронт дивизию «Мертвая голова» (последние ее части прибыли на фронт только 7 июля) в качестве пожарной команды, бросая ее на наиболее проблемные участки фронта. 8 июля танковая дивизия «Мертвая голова» начала перебрасываться под Гродно, где Беккеру пришлось спешно организовывать оборону города. 16 июля советские войска очистили левобережную часть города, но, несмотря на все усилия советского командования, выбить дивизию Беккера из города удалось лишь после восьми дней тяжелых боев — 24 июня. Противник превосходил эсэсовцев по живой силе в 7, а по танкам — в 10 раз. 25-28 июля Беккер успешно оборонял Седльце — в 80 километрах восточнее Варшавы — от наступавших частей 11-го танкового и 3-го кавалерийского советских корпусов. 28 июля Беккер оставил город и начал отступление в направлении Варшавы. Дивизия «Мертвая голова» провела серию контратак, и ее вклад в то, что немцам удалось в июле—августе 1944 года выровнять линию фронта в Польше и не допустить окончательного развала фронта, очень значителен. В августе 1944 года дивизия вошла в состав IV танкового корпуса СС, которым командовал один из двух кавалеров Рыцарского креста с дубовыми листьями, мечами и бриллиантами в войсках СС обергруппенфюрер СС и генерал войск СС Герберт Отто Гилле.

С 14 августа «Мертвая голова» отбивала отчаянные атаки советских войск, и лишь 26 августа, когда ее позиции были атакованы силами восьми советских стрелковых дивизий, при мощной поддержке с воздуха, дивизия начала организованный отход. Потери все же были очень значительными, особенно осложняло положение дивизии практически полное господство советских ВВС. Тем не менее советским войскам так и не удалось нанести поражение солдатам Беккера, и он медленно, с боями продолжил отход к столице Польши — Варшаве. 11 сентября поредевшая дивизия совершила практически невозможное: стремительной контратакой она опрокинула советские войска, выбив их из Праги (так именуется северо-восточное предместье) и отбросил за Вислу. Заняв глухую оборону, измотанная дивизия держалась в Праге до конца месяца, но когда советские войска перешли в новое широкомасштабное наступление, Беккер был вынужден отвести войска в Варшаву. Упорство «Мертвой головы», а также храбрость Беккера, не только руководившего дивизией, но и лично принимавшего участие в боях, принесли ему 21 сентября 1944 года дубовые листья к Рыцарскому кресту. 1 октября 1944 года он был произведен в следующее звание и стал бригадефюрером СС и генерал-майором войск СС — это было последнее производство Беккера.

10 октября позиции дивизии были вновь атакованы советскими войсками, и несмотря на то что Беккеру пришлось отступить, он смог закрепиться на новых позициях и удержать их. Через неделю дивизия отошла к Модлину и продолжала вести оборонительные бои в Польше до конца 1944 года.

В декабре же весь IV корпус СС был в срочном порядке переброшен в Венгрию: Гитлер решил нанести мощный удар и деблокировать окруженный 24 декабря советскими войсками Будапешт. Это сражение иногда называют «Сталинградом войск СС» — в окружении оказались несколько дивизий СС, а вызволять их направили танкистов-эсэсовцев. В первый день последнего года войны «Мертвая голова» пошла на штурм советских позиций. Одиннадцать дней эсэсовцы пытались прорваться к своим товарищам на участке Марьян — Бичке, но превосходство Красной Армии было абсолютным. Затем командование решило изменить направление удара, и 18 января Беккер (вместе с дивизией СС «Викинг») попытался осуществить наступление в районе озера Балатон. И опять «Мертвой голове» удалось невозможное: пройдя с боями между озером Веленце и городом Барачка, танки Беккера к вечеру 26 января вышли к Валю — предместью Будапешта. Но здесь наступление захлебнулось. 29 января «Мертвая голова» пошла в последнюю отчаянную атаку. Результат был тем же: советские войска стояли насмерть, а потери «Мертвой головы» стремительно росли. А через два дня последовало контрнаступление и эсэсовцы начали откатываться на запад, ведя бои в районе Секешфехервар — озеро Веленце. 11 февраля «Сталинград войск СС» завершился: Будапештская группировка СС пошла в отчаянный прорыв, из окружения вышло 785 человек.