Ева Ингеборг Фляйшхауэр родилась в 1942 г. в Эрфурте (Тюрингия). Окончила школу в ГДР в июле 1961 г. Изучала философию, психологию и славистику в университетах Гамбурга, Берлина (Свободный университет), Парижа (Сорбонна) и Папском Григорианском университете в Риме. Работала ассистенткой проф. Г. А. Веттера в римском Центре марксистских исследований. В июле 1970 г. защитила в Констанцском университете диссертацию, посвященную философу Н. Н. Страхову. Преподавала в университетах Париж XII, Йювяскюля (Финляндия), Иерусалимском еврейском университете. Участница научно-исследовательского проекта, посвященного германо-российским отношениям с XVIII по XX в., в Бонне. Руководитель Исторической комиссии немцев в России и Советском Союзе (Бонн). С 1991 г. руководитель Центра российских реформ при Санкт-Петербургском государственном университете, здесь 24 мая 1994 г. получила ученое звание профессора по кафедре истории и истории социологии. В настоящее время занимается научными исследованиями в области российской истории.