Фернан Кайзергрубер родился в бельгийском Антверпене 18 января 1923 года. В юности он вступил в бельгийскую фашистскую партию Rexist. После немецкого вторжения в Бельгию в мае 1940 он добровольно уехал в Германию и работал на заводе в Кёльне. Вступил в немецкую армию в сентябре 1941 года и уехал на русский фронт в июне 1942 года, где он пробыл до ноября того же года. После тяжёлых боёв на Восточном фронте его часть была отведена в Германию. Кайзергрубер вернулся в Россию в июле 1943 года в составе Ваффен-СС. При отступлении в феврале 1944 года он был дважды ранен и сломал ногу. После этого Кайзегрубер был демобилизован.